Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SWX5

Protein Details
Accession A0A395SWX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
598-625DLEAVQKQMPRKTKRRRKLDDDSWEEYIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
608-615RKTKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13428  TPR_14  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAAAPVQISAEQLLREAVDRQEVGVQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVRRNRLNLNNWMRYAQWELEQKEFKRAESVFERALDAHPNNVQLWVRYIESEMKSRNINHARNLLDRAVSRLPRVDKLWYKYVYMEEMLGNIPGTRQVFDRWMQWHPDEAAWSSYIKLEKRYGEFERAREIFRTFTQLHPESRNWIKWAKFEEEYGTSDQVREVFGDAVEALGDDFVDEKLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSMILHKAYTTFEKQFGDKDGVEDVVLSKRRVYYEELIKENPKNYDAWFDYAKLEETSQDSDRIRDIYERAVAQVPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEMEGQDVERTRQIYNTCLGLIPHKRFTFAKIWLMAAQFEIRQGELTAARKLLGRAIERKLFEFVRCRTLYEKHIEFNPANCQTWIKFAELERGLDDLDRTRAIFELAVQQQQLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYERTRALYERLLEKTDHVKVWISYAHFEINIPEDDDEEGDEEQPVSEEAKARARKVFTRAHKSMRDRDLKEECVSLLNAWLSFERTHGSAEDLEAVQKQMPRKTKRRRKLDDDSWEEYIDYVFPADDKQAANLSNLLSMAQSWKQQSGGGLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.54
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.21
22 0.21
23 0.22
24 0.22
25 0.23
26 0.25
27 0.26
28 0.23
29 0.23
30 0.21
31 0.2
32 0.25
33 0.2
34 0.23
35 0.24
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.34
43 0.35
44 0.39
45 0.41
46 0.45
47 0.54
48 0.6
49 0.61
50 0.68
51 0.74
52 0.78
53 0.76
54 0.7
55 0.69
56 0.68
57 0.64
58 0.65
59 0.64
60 0.61
61 0.62
62 0.61
63 0.53
64 0.47
65 0.44
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.34
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.5
74 0.49
75 0.43
76 0.43
77 0.4
78 0.39
79 0.37
80 0.41
81 0.34
82 0.34
83 0.35
84 0.28
85 0.3
86 0.3
87 0.25
88 0.24
89 0.23
90 0.24
91 0.23
92 0.26
93 0.25
94 0.19
95 0.22
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.2
100 0.23
101 0.24
102 0.29
103 0.28
104 0.29
105 0.32
106 0.33
107 0.41
108 0.44
109 0.45
110 0.46
111 0.5
112 0.5
113 0.5
114 0.52
115 0.44
116 0.38
117 0.34
118 0.34
119 0.34
120 0.32
121 0.29
122 0.32
123 0.34
124 0.34
125 0.36
126 0.39
127 0.4
128 0.44
129 0.51
130 0.46
131 0.44
132 0.43
133 0.42
134 0.36
135 0.29
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.19
151 0.24
152 0.24
153 0.26
154 0.3
155 0.29
156 0.31
157 0.28
158 0.28
159 0.25
160 0.23
161 0.2
162 0.17
163 0.16
164 0.13
165 0.15
166 0.18
167 0.17
168 0.2
169 0.23
170 0.27
171 0.3
172 0.35
173 0.36
174 0.41
175 0.44
176 0.41
177 0.45
178 0.43
179 0.41
180 0.37
181 0.35
182 0.28
183 0.25
184 0.3
185 0.23
186 0.24
187 0.3
188 0.32
189 0.34
190 0.36
191 0.36
192 0.36
193 0.4
194 0.4
195 0.35
196 0.37
197 0.35
198 0.35
199 0.39
200 0.38
201 0.33
202 0.32
203 0.32
204 0.29
205 0.3
206 0.27
207 0.24
208 0.19
209 0.19
210 0.18
211 0.15
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.2
243 0.21
244 0.25
245 0.26
246 0.3
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.29
251 0.29
252 0.25
253 0.25
254 0.23
255 0.23
256 0.24
257 0.24
258 0.26
259 0.31
260 0.32
261 0.31
262 0.32
263 0.32
264 0.33
265 0.38
266 0.43
267 0.39
268 0.37
269 0.36
270 0.35
271 0.33
272 0.32
273 0.28
274 0.22
275 0.22
276 0.21
277 0.21
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.17
282 0.17
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.15
294 0.17
295 0.2
296 0.21
297 0.27
298 0.32
299 0.34
300 0.34
301 0.37
302 0.36
303 0.34
304 0.29
305 0.22
306 0.18
307 0.16
308 0.2
309 0.18
310 0.19
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.12
317 0.11
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.12
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.11
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.15
335 0.14
336 0.13
337 0.15
338 0.14
339 0.17
340 0.19
341 0.2
342 0.22
343 0.33
344 0.4
345 0.48
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.57
352 0.52
353 0.42
354 0.37
355 0.35
356 0.3
357 0.26
358 0.15
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.11
371 0.1
372 0.14
373 0.14
374 0.15
375 0.16
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.14
380 0.17
381 0.23
382 0.24
383 0.29
384 0.28
385 0.3
386 0.3
387 0.34
388 0.34
389 0.31
390 0.33
391 0.28
392 0.29
393 0.28
394 0.28
395 0.24
396 0.18
397 0.15
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.16
413 0.17
414 0.19
415 0.23
416 0.28
417 0.32
418 0.32
419 0.33
420 0.33
421 0.3
422 0.29
423 0.31
424 0.29
425 0.32
426 0.32
427 0.32
428 0.33
429 0.35
430 0.38
431 0.38
432 0.38
433 0.32
434 0.34
435 0.37
436 0.34
437 0.32
438 0.35
439 0.31
440 0.3
441 0.28
442 0.27
443 0.23
444 0.28
445 0.27
446 0.2
447 0.2
448 0.19
449 0.27
450 0.27
451 0.27
452 0.22
453 0.21
454 0.2
455 0.17
456 0.17
457 0.11
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.1
465 0.09
466 0.15
467 0.17
468 0.19
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.18
473 0.18
474 0.12
475 0.1
476 0.08
477 0.12
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.11
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.12
489 0.12
490 0.13
491 0.14
492 0.15
493 0.12
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.15
501 0.19
502 0.24
503 0.26
504 0.28
505 0.28
506 0.29
507 0.33
508 0.33
509 0.3
510 0.25
511 0.26
512 0.24
513 0.26
514 0.27
515 0.22
516 0.19
517 0.2
518 0.2
519 0.18
520 0.18
521 0.16
522 0.16
523 0.16
524 0.15
525 0.13
526 0.13
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.12
541 0.14
542 0.23
543 0.27
544 0.3
545 0.35
546 0.38
547 0.42
548 0.46
549 0.53
550 0.54
551 0.6
552 0.64
553 0.67
554 0.72
555 0.75
556 0.77
557 0.77
558 0.77
559 0.7
560 0.72
561 0.71
562 0.66
563 0.6
564 0.52
565 0.43
566 0.36
567 0.33
568 0.25
569 0.21
570 0.18
571 0.16
572 0.15
573 0.16
574 0.15
575 0.15
576 0.16
577 0.14
578 0.14
579 0.15
580 0.15
581 0.17
582 0.15
583 0.16
584 0.18
585 0.16
586 0.17
587 0.16
588 0.17
589 0.17
590 0.19
591 0.24
592 0.28
593 0.37
594 0.46
595 0.56
596 0.66
597 0.75
598 0.82
599 0.88
600 0.9
601 0.91
602 0.92
603 0.91
604 0.91
605 0.88
606 0.83
607 0.75
608 0.65
609 0.55
610 0.44
611 0.34
612 0.23
613 0.16
614 0.1
615 0.08
616 0.07
617 0.08
618 0.1
619 0.13
620 0.13
621 0.15
622 0.18
623 0.19
624 0.21
625 0.22
626 0.21
627 0.19
628 0.18
629 0.16
630 0.12
631 0.12
632 0.15
633 0.16
634 0.2
635 0.22
636 0.24
637 0.24
638 0.26
639 0.27