Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395RGD5

Protein Details
Accession A0A395RGD5    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-87IQSARISKSTKRRRPSKKLATTLDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-80RISKSTKRRRPSKK
105-125KIRHKSLKSKKGALKKKEKVV
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPLPPGLKKPSARTLRHQRVTGQIHPQAPQKVFRDDAAVTDSFLSSKRDKRLIKHSSFVSRIQSARISKSTKRRRPSKKLATTLDGLADALPELEEANAEQQGKIRHKSLKSKKGALKKKEKVVKGEMERFGVSMARLTAQDEAKAVPQDEKMDEEEKKAAPAATANRWAALRGFISSTMEQNPAFVEKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.71
3 0.75
4 0.78
5 0.73
6 0.67
7 0.67
8 0.69
9 0.64
10 0.62
11 0.57
12 0.52
13 0.52
14 0.55
15 0.51
16 0.47
17 0.48
18 0.42
19 0.41
20 0.4
21 0.37
22 0.36
23 0.29
24 0.28
25 0.25
26 0.22
27 0.17
28 0.16
29 0.16
30 0.12
31 0.13
32 0.16
33 0.16
34 0.22
35 0.28
36 0.36
37 0.39
38 0.45
39 0.54
40 0.6
41 0.6
42 0.59
43 0.58
44 0.57
45 0.57
46 0.53
47 0.47
48 0.41
49 0.37
50 0.33
51 0.34
52 0.29
53 0.3
54 0.32
55 0.32
56 0.35
57 0.45
58 0.54
59 0.57
60 0.64
61 0.71
62 0.76
63 0.82
64 0.87
65 0.87
66 0.86
67 0.86
68 0.8
69 0.73
70 0.64
71 0.54
72 0.43
73 0.32
74 0.22
75 0.14
76 0.1
77 0.06
78 0.04
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.02
83 0.03
84 0.03
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.14
91 0.17
92 0.19
93 0.22
94 0.27
95 0.31
96 0.42
97 0.5
98 0.55
99 0.57
100 0.64
101 0.67
102 0.71
103 0.76
104 0.75
105 0.76
106 0.73
107 0.77
108 0.75
109 0.72
110 0.68
111 0.65
112 0.64
113 0.6
114 0.61
115 0.53
116 0.48
117 0.45
118 0.39
119 0.33
120 0.25
121 0.17
122 0.11
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.14
136 0.15
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.23
142 0.23
143 0.24
144 0.26
145 0.23
146 0.23
147 0.23
148 0.2
149 0.16
150 0.2
151 0.23
152 0.24
153 0.3
154 0.3
155 0.3
156 0.3
157 0.3
158 0.26
159 0.24
160 0.2
161 0.15
162 0.16
163 0.15
164 0.2
165 0.2
166 0.22
167 0.22
168 0.24
169 0.22
170 0.21
171 0.22