Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SPH8

Protein Details
Accession A0A395SPH8    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-71DDGADVKKAKKEKRDKKFKKESRKERKEKRKDLQDLPEQDBasic
93-120TVDVEKSAKKDKKKEKKAKVEEEKQQDABasic
123-148DTETKDESKKSKKKNKKQDKSAETTEHydrophilic
251-274GGGGKTKQRQEKIKEKNVKLNENRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-62GKKRKREDDGADVKKAKKEKRDKKFKKESRKERKEKRK
99-111SAKKDKKKEKKAK
130-140SKKSKKKNKKQ
255-315KTKQRQEKIKEKNVKLNENRTKRIERERIAKEESSKANADRRPAGDDGIHPSRRAHIPGRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKSKRARETAEVDEKPVISVDAEPGKKRKREDDGADVKKAKKEKRDKKFKKESRKERKEKRKDLQDLPEQDDDVEDAQDTPMAGADDKPADTTVDVEKSAKKDKKKEKKAKVEEEKQQDASADTETKDESKKSKKKNKKQDKSAETTESADAEADTADAKTNGKADRHIVFVGNLPFTATAETIKAHFASLNPIGVRCMSDPKDSKPCRGFAFVEFAKVWHMRTCLDKFHHSEFTDGTSYPRRINVELTAGGGGKTKQRQEKIKEKNVKLNENRTKRIERERIAKEESSKANADRRPAGDDGIHPSRRAHIPGRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.33
4 0.23
5 0.14
6 0.14
7 0.16
8 0.22
9 0.25
10 0.29
11 0.37
12 0.45
13 0.5
14 0.54
15 0.58
16 0.59
17 0.65
18 0.68
19 0.71
20 0.73
21 0.74
22 0.76
23 0.72
24 0.66
25 0.62
26 0.62
27 0.58
28 0.58
29 0.63
30 0.67
31 0.73
32 0.81
33 0.86
34 0.89
35 0.94
36 0.94
37 0.94
38 0.94
39 0.95
40 0.95
41 0.95
42 0.95
43 0.95
44 0.96
45 0.96
46 0.95
47 0.94
48 0.94
49 0.91
50 0.89
51 0.87
52 0.85
53 0.79
54 0.73
55 0.65
56 0.54
57 0.45
58 0.36
59 0.28
60 0.19
61 0.14
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.16
85 0.19
86 0.29
87 0.33
88 0.37
89 0.46
90 0.56
91 0.66
92 0.75
93 0.82
94 0.83
95 0.89
96 0.92
97 0.93
98 0.92
99 0.89
100 0.87
101 0.83
102 0.77
103 0.66
104 0.56
105 0.45
106 0.36
107 0.28
108 0.21
109 0.15
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.19
117 0.28
118 0.36
119 0.46
120 0.56
121 0.66
122 0.75
123 0.84
124 0.89
125 0.89
126 0.92
127 0.92
128 0.89
129 0.85
130 0.79
131 0.71
132 0.61
133 0.52
134 0.41
135 0.31
136 0.23
137 0.16
138 0.11
139 0.07
140 0.06
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.08
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.16
154 0.18
155 0.18
156 0.16
157 0.14
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.14
184 0.1
185 0.15
186 0.15
187 0.22
188 0.24
189 0.29
190 0.4
191 0.4
192 0.47
193 0.45
194 0.46
195 0.42
196 0.44
197 0.41
198 0.32
199 0.39
200 0.31
201 0.31
202 0.27
203 0.24
204 0.24
205 0.23
206 0.22
207 0.17
208 0.18
209 0.16
210 0.22
211 0.25
212 0.28
213 0.31
214 0.36
215 0.37
216 0.41
217 0.47
218 0.41
219 0.4
220 0.34
221 0.33
222 0.3
223 0.26
224 0.24
225 0.24
226 0.26
227 0.26
228 0.29
229 0.28
230 0.27
231 0.3
232 0.28
233 0.26
234 0.25
235 0.24
236 0.21
237 0.19
238 0.18
239 0.16
240 0.15
241 0.16
242 0.21
243 0.27
244 0.34
245 0.42
246 0.51
247 0.58
248 0.68
249 0.72
250 0.78
251 0.81
252 0.79
253 0.81
254 0.8
255 0.82
256 0.79
257 0.8
258 0.79
259 0.78
260 0.78
261 0.76
262 0.75
263 0.72
264 0.74
265 0.73
266 0.7
267 0.71
268 0.72
269 0.72
270 0.7
271 0.67
272 0.61
273 0.59
274 0.56
275 0.51
276 0.47
277 0.45
278 0.47
279 0.46
280 0.47
281 0.46
282 0.44
283 0.44
284 0.42
285 0.4
286 0.35
287 0.35
288 0.37
289 0.4
290 0.39
291 0.35
292 0.35
293 0.39
294 0.41
295 0.44