Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SF00

Protein Details
Accession A0A395SF00    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-33PRDISGFRKKHPYKPPKHEHRKIIKIRPSIDHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-27RKKHPYKPPKHEHRKIIKI
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 10.5, mito 5.5, cyto_pero 3, cyto 2.5, pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0005975  P:carbohydrate metabolic process  
GO:0071555  P:cell wall organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences MPRDISGFRKKHPYKPPKHEHRKIIKIRPSIDHQDDVSEDFERGVRQADRGSTLYLPQGQTFVIGKALDLTGLNDIHIHLDGEIRFTDDVEYWQKNAWYHPFQKSIMFWKWGGQDIKIYGSGVIEGQGQRWWDEFEAGTGSILNPDNKYYRPILFYAENTTNLDVSGIHLKDSPCWNNFIVSSKNITYTDVVATALSNNGSIIPKNTDFMNTMNTSTVRIERTWVNIDDDCFSPKPNSSDLYVNTMYCNGTHGQSMGSLGQYKGEVSNVHDVHIENVWMMNGDYSGARIKVWAGNETGTGFVNNVTFKNFWVARMDYGIFLDSCYFNISAEECNAHPSGMQITNIHFENFTGYTSGVYGNAVARLSCSAAEDAVCANITLRNFDVKPPCGGEPVVICDGMHDDVGVDCVPYESDEAQVALEAKCKTPLVPIDTDPWGSGLIDKKNGAFHPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.83
3 0.89
4 0.89
5 0.94
6 0.94
7 0.94
8 0.93
9 0.93
10 0.92
11 0.92
12 0.89
13 0.86
14 0.82
15 0.77
16 0.75
17 0.73
18 0.68
19 0.61
20 0.53
21 0.47
22 0.43
23 0.38
24 0.32
25 0.24
26 0.18
27 0.15
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.21
35 0.22
36 0.26
37 0.26
38 0.28
39 0.24
40 0.25
41 0.27
42 0.28
43 0.27
44 0.23
45 0.22
46 0.19
47 0.21
48 0.2
49 0.17
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.11
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.07
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.11
76 0.15
77 0.19
78 0.2
79 0.19
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.27
84 0.31
85 0.33
86 0.38
87 0.43
88 0.46
89 0.45
90 0.47
91 0.45
92 0.46
93 0.42
94 0.39
95 0.33
96 0.33
97 0.34
98 0.38
99 0.36
100 0.29
101 0.28
102 0.26
103 0.27
104 0.23
105 0.21
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.11
132 0.13
133 0.16
134 0.16
135 0.2
136 0.2
137 0.2
138 0.21
139 0.21
140 0.23
141 0.23
142 0.23
143 0.26
144 0.25
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.19
149 0.16
150 0.15
151 0.09
152 0.09
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.15
157 0.15
158 0.19
159 0.25
160 0.27
161 0.22
162 0.25
163 0.25
164 0.23
165 0.24
166 0.24
167 0.21
168 0.18
169 0.21
170 0.18
171 0.2
172 0.19
173 0.2
174 0.17
175 0.15
176 0.14
177 0.11
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.15
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.13
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.19
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.13
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.18
227 0.19
228 0.24
229 0.23
230 0.21
231 0.19
232 0.19
233 0.17
234 0.13
235 0.14
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.18
255 0.17
256 0.18
257 0.19
258 0.18
259 0.19
260 0.18
261 0.16
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.2
299 0.21
300 0.2
301 0.22
302 0.22
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.13
319 0.1
320 0.14
321 0.14
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.15
326 0.15
327 0.17
328 0.14
329 0.16
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.15
334 0.13
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.17
369 0.18
370 0.25
371 0.32
372 0.31
373 0.35
374 0.36
375 0.36
376 0.33
377 0.32
378 0.28
379 0.23
380 0.26
381 0.24
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.19
386 0.17
387 0.15
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.09
393 0.07
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.1
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.11
404 0.12
405 0.13
406 0.11
407 0.16
408 0.16
409 0.16
410 0.2
411 0.2
412 0.19
413 0.24
414 0.31
415 0.31
416 0.34
417 0.36
418 0.37
419 0.4
420 0.4
421 0.34
422 0.28
423 0.23
424 0.18
425 0.2
426 0.22
427 0.24
428 0.28
429 0.29
430 0.3
431 0.35