FuNGI

A0A395RI03

Protein Details

Accession

A0A395RI03

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-49	APSHPNGSSKNKKGNPLRPMRKKPANPMVTRRPAPR	Hydrophilic
182-208	APVAKDLNPKRPKKQKEEKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-51	SSKNKKGNPLRPMRKKPANPMVTRRPAPRPA
190-200	PKRPKKQKEEK
483-504	PSGKKPEGSKKGKSLKRAGSPA
514-519	SRKKLK

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPPGNPPANAPSHPNGSSKNKKGNPLRPMRKKPANPMVTRRPAPRPAAPSGSGAQNGAKPNIEEIRRQNGGWSEPPPATYSDIPIMTTKKALLDGIRYHMMKFTQSKVGDRSIDPTDQDDFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKVEVPEAPQPDEHEAERMAQVKAEREAQRAIDQAKIAPVAKDLNPKRPKKQKEEKTTFNRAPKTDAAKKESDIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGNYVSALSESNVAFMIDQSVFRMVPLEKWYRFTSKPPFQPYTIDEAEALMKKKVDVGRWVMKNAEKLAEQNDKEETRKMFYGGGQMVKTESATFKAVSRSEKLDHDDIDFSGDEFQDDDETPMFEKNNDDEDAKDAKDRIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELHEQLQEEELRRELGKTTKKALIKRDQENIYESDDSEENPWSSSSDDNSSDEEEDEEKKEEEKKEAGKDDKTQSGSGSKGTNTPSGKKPEGSKKGKSLKRAGSPALSESSGNESSRKKLKKNVTSAAASRSGTPLPQARRAVVMGAGSGSDGEATAGEMSDGAMGKRKKLKLVSHSARGTPSASRAGSPNPQGAASPGSPGGSIVEPSEILDKIPNEGIVIGELIKAFNHRLGDRPGQMPKNEWIQLVKKLCDYGPDKRLRRRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.42
3	0.45
4	0.45
5	0.43
6	0.44
7	0.49
8	0.58
9	0.6
10	0.66
11	0.65
12	0.72
13	0.79
14	0.81
15	0.81
16	0.82
17	0.85
18	0.85
19	0.9
20	0.91
21	0.91
22	0.89
23	0.89
24	0.89
25	0.87
26	0.84
27	0.83
28	0.84
29	0.83
30	0.81
31	0.76
32	0.74
33	0.72
34	0.7
35	0.69
36	0.64
37	0.61
38	0.61
39	0.57
40	0.52
41	0.47
42	0.44
43	0.37
44	0.32
45	0.28
46	0.26
47	0.28
48	0.26
49	0.25
50	0.21
51	0.25
52	0.31
53	0.31
54	0.33
55	0.36
56	0.42
57	0.43
58	0.42
59	0.43
60	0.4
61	0.42
62	0.4
63	0.37
64	0.33
65	0.31
66	0.32
67	0.29
68	0.27
69	0.27
70	0.23
71	0.24
72	0.23
73	0.23
74	0.23
75	0.25
76	0.26
77	0.22
78	0.23
79	0.2
80	0.17
81	0.18
82	0.19
83	0.18
84	0.22
85	0.24
86	0.27
87	0.32
88	0.31
89	0.3
90	0.32
91	0.3
92	0.29
93	0.3
94	0.29
95	0.32
96	0.33
97	0.37
98	0.38
99	0.42
100	0.4
101	0.37
102	0.37
103	0.33
104	0.33
105	0.3
106	0.28
107	0.25
108	0.23
109	0.23
110	0.22
111	0.19
112	0.17
113	0.19
114	0.16
115	0.2
116	0.28
117	0.33
118	0.38
119	0.41
120	0.48
121	0.52
122	0.62
123	0.64
124	0.65
125	0.64
126	0.63
127	0.68
128	0.66
129	0.61
130	0.54
131	0.52
132	0.47
133	0.45
134	0.41
135	0.33
136	0.32
137	0.33
138	0.33
139	0.29
140	0.24
141	0.23
142	0.24
143	0.25
144	0.21
145	0.2
146	0.18
147	0.18
148	0.2
149	0.2
150	0.17
151	0.17
152	0.18
153	0.18
154	0.2
155	0.27
156	0.26
157	0.26
158	0.29
159	0.29
160	0.3
161	0.31
162	0.3
163	0.24
164	0.22
165	0.2
166	0.2
167	0.2
168	0.18
169	0.15
170	0.15
171	0.16
172	0.18
173	0.27
174	0.29
175	0.37
176	0.46
177	0.51
178	0.6
179	0.67
180	0.73
181	0.74
182	0.82
183	0.82
184	0.84
185	0.87
186	0.87
187	0.86
188	0.87
189	0.82
190	0.79
191	0.74
192	0.64
193	0.6
194	0.56
195	0.56
196	0.54
197	0.53
198	0.51
199	0.47
200	0.47
201	0.52
202	0.49
203	0.43
204	0.38
205	0.35
206	0.32
207	0.31
208	0.31
209	0.24
210	0.23
211	0.2
212	0.17
213	0.15
214	0.13
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.12
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.14
225	0.11
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.07
233	0.09
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.09
241	0.06
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.1
248	0.08
249	0.1
250	0.16
251	0.21
252	0.21
253	0.25
254	0.28
255	0.3
256	0.32
257	0.36
258	0.4
259	0.42
260	0.49
261	0.53
262	0.53
263	0.49
264	0.51
265	0.47
266	0.44
267	0.36
268	0.3
269	0.22
270	0.2
271	0.21
272	0.2
273	0.18
274	0.12
275	0.11
276	0.11
277	0.15
278	0.17
279	0.17
280	0.19
281	0.24
282	0.32
283	0.33
284	0.34
285	0.32
286	0.32
287	0.32
288	0.29
289	0.24
290	0.17
291	0.16
292	0.2
293	0.25
294	0.23
295	0.22
296	0.25
297	0.24
298	0.25
299	0.28
300	0.24
301	0.19
302	0.2
303	0.19
304	0.17
305	0.16
306	0.2
307	0.18
308	0.19
309	0.16
310	0.16
311	0.15
312	0.14
313	0.13
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.1
320	0.13
321	0.15
322	0.17
323	0.18
324	0.2
325	0.21
326	0.22
327	0.25
328	0.23
329	0.22
330	0.21
331	0.2
332	0.16
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.16
357	0.18
358	0.17
359	0.17
360	0.15
361	0.18
362	0.23
363	0.25
364	0.28
365	0.35
366	0.37
367	0.38
368	0.41
369	0.43
370	0.41
371	0.4
372	0.33
373	0.23
374	0.21
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.09
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.15
392	0.16
393	0.16
394	0.17
395	0.15
396	0.16
397	0.16
398	0.16
399	0.13
400	0.19
401	0.25
402	0.27
403	0.31
404	0.36
405	0.41
406	0.45
407	0.51
408	0.54
409	0.54
410	0.57
411	0.6
412	0.57
413	0.54
414	0.52
415	0.45
416	0.39
417	0.31
418	0.26
419	0.2
420	0.17
421	0.16
422	0.15
423	0.15
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.14
432	0.15
433	0.16
434	0.17
435	0.18
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.14
444	0.15
445	0.21
446	0.21
447	0.24
448	0.27
449	0.31
450	0.35
451	0.42
452	0.45
453	0.43
454	0.48
455	0.49
456	0.5
457	0.47
458	0.41
459	0.35
460	0.34
461	0.31
462	0.26
463	0.24
464	0.18
465	0.2
466	0.22
467	0.27
468	0.26
469	0.31
470	0.35
471	0.4
472	0.42
473	0.42
474	0.48
475	0.52
476	0.6
477	0.62
478	0.62
479	0.64
480	0.72
481	0.73
482	0.73
483	0.71
484	0.69
485	0.7
486	0.69
487	0.62
488	0.56
489	0.53
490	0.48
491	0.41
492	0.33
493	0.25
494	0.21
495	0.23
496	0.22
497	0.21
498	0.23
499	0.22
500	0.27
501	0.36
502	0.42
503	0.41
504	0.47
505	0.57
506	0.63
507	0.7
508	0.72
509	0.69
510	0.68
511	0.65
512	0.61
513	0.55
514	0.45
515	0.37
516	0.32
517	0.26
518	0.21
519	0.23
520	0.25
521	0.26
522	0.33
523	0.34
524	0.33
525	0.35
526	0.35
527	0.32
528	0.26
529	0.22
530	0.14
531	0.12
532	0.11
533	0.08
534	0.07
535	0.06
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.06
547	0.07
548	0.06
549	0.14
550	0.15
551	0.21
552	0.29
553	0.32
554	0.37
555	0.45
556	0.54
557	0.56
558	0.67
559	0.69
560	0.7
561	0.71
562	0.67
563	0.61
564	0.54
565	0.46
566	0.37
567	0.33
568	0.3
569	0.27
570	0.25
571	0.26
572	0.3
573	0.34
574	0.36
575	0.36
576	0.3
577	0.3
578	0.29
579	0.28
580	0.28
581	0.21
582	0.2
583	0.17
584	0.16
585	0.16
586	0.16
587	0.16
588	0.12
589	0.12
590	0.1
591	0.11
592	0.11
593	0.12
594	0.14
595	0.12
596	0.12
597	0.15
598	0.15
599	0.17
600	0.18
601	0.17
602	0.15
603	0.15
604	0.15
605	0.11
606	0.11
607	0.09
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.09
612	0.1
613	0.11
614	0.14
615	0.19
616	0.19
617	0.24
618	0.31
619	0.38
620	0.41
621	0.46
622	0.52
623	0.53
624	0.54
625	0.53
626	0.51
627	0.52
628	0.5
629	0.45
630	0.43
631	0.42
632	0.49
633	0.51
634	0.49
635	0.43
636	0.43
637	0.41
638	0.43
639	0.44
640	0.44
641	0.48
642	0.56
643	0.61

A0A395RI03

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer