Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SDI3

Protein Details
Accession A0A395SDI3    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-150IDATEDRSNKERKRKRKKDNDDLEGKYLBasic
417-436FPPMLPRKLRVTRAKDPRKTHydrophilic
483-502AVQQRHKKRPSTHGESRETEHydrophilic
523-554ARDGLPKDLKQHKKGKGKGKSGRPQNRGAKRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-140KERKRKRKK
421-446LPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGK
522-561SARDGLPKDLKQHKKGKGKGKSGRPQNRGAKRAAEWKKKN
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKGLKGLRASSKAVDPTLDALFASSAGPVQAPAKSKYSTLLDQKVREPAKPKVQLEEDDEVLSEISEELSFEEDGPSDEDEDENDSEQENESGDEQEEEAEEESESADEPMKDAPVELDDIIDATEDRSNKERKRKRKKDNDDLEGKYLDKMAAEEEAERAGKRQKNDALTKTEKKTTADEEDAGNESDIPVHETLAKDSKASDLDKAARTVFLANVSTEAISSKSAKKTLMAHLSSVLEKDATPPQTIESLRFRSVAFAGGSLPKRAAYITKSLMDSTTKSANAYVVYSTTAAARTAATKLNGTQVLDRHLRVDSVAHPSPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTNAEGDTTEKKKNKTPSDIEEGLWRTFSTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDGNDVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKHITTNGASKSTKYKHKATPEEQSMAGRTSKLLGRSAAVQQRHKKRPSTHGESRETESAPTGIKGPEQFVFEGRRASARDGLPKDLKQHKKGKGKGKSGRPQNRGAKRAAEWKKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.36
3 0.3
4 0.28
5 0.26
6 0.23
7 0.16
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.1
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.13
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.26
24 0.3
25 0.34
26 0.38
27 0.42
28 0.48
29 0.51
30 0.53
31 0.56
32 0.6
33 0.56
34 0.54
35 0.51
36 0.51
37 0.55
38 0.6
39 0.58
40 0.57
41 0.6
42 0.59
43 0.6
44 0.55
45 0.46
46 0.37
47 0.35
48 0.27
49 0.22
50 0.18
51 0.11
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.13
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.09
114 0.09
115 0.12
116 0.18
117 0.26
118 0.33
119 0.45
120 0.53
121 0.62
122 0.73
123 0.81
124 0.86
125 0.9
126 0.93
127 0.94
128 0.94
129 0.92
130 0.89
131 0.82
132 0.74
133 0.64
134 0.54
135 0.43
136 0.33
137 0.24
138 0.15
139 0.12
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.18
150 0.21
151 0.23
152 0.3
153 0.34
154 0.42
155 0.49
156 0.52
157 0.53
158 0.58
159 0.63
160 0.6
161 0.6
162 0.54
163 0.48
164 0.47
165 0.43
166 0.41
167 0.36
168 0.33
169 0.28
170 0.27
171 0.27
172 0.23
173 0.18
174 0.12
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.17
185 0.17
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.21
194 0.23
195 0.24
196 0.22
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.14
201 0.12
202 0.11
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.2
217 0.23
218 0.29
219 0.35
220 0.31
221 0.29
222 0.29
223 0.3
224 0.28
225 0.24
226 0.17
227 0.09
228 0.08
229 0.1
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.18
236 0.19
237 0.2
238 0.21
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.23
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.1
258 0.14
259 0.16
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.15
294 0.14
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.13
302 0.14
303 0.12
304 0.17
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.24
310 0.29
311 0.31
312 0.27
313 0.27
314 0.3
315 0.3
316 0.32
317 0.27
318 0.25
319 0.21
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.15
324 0.12
325 0.12
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.11
339 0.15
340 0.22
341 0.26
342 0.29
343 0.35
344 0.44
345 0.49
346 0.53
347 0.56
348 0.54
349 0.59
350 0.58
351 0.53
352 0.49
353 0.45
354 0.36
355 0.3
356 0.24
357 0.17
358 0.2
359 0.21
360 0.18
361 0.18
362 0.2
363 0.25
364 0.28
365 0.29
366 0.29
367 0.29
368 0.28
369 0.27
370 0.27
371 0.25
372 0.27
373 0.3
374 0.31
375 0.38
376 0.4
377 0.39
378 0.4
379 0.38
380 0.37
381 0.41
382 0.36
383 0.33
384 0.3
385 0.3
386 0.28
387 0.27
388 0.26
389 0.18
390 0.17
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.19
406 0.27
407 0.37
408 0.45
409 0.51
410 0.59
411 0.66
412 0.74
413 0.73
414 0.74
415 0.74
416 0.76
417 0.81
418 0.79
419 0.78
420 0.76
421 0.72
422 0.65
423 0.64
424 0.63
425 0.62
426 0.58
427 0.58
428 0.6
429 0.56
430 0.57
431 0.5
432 0.41
433 0.38
434 0.39
435 0.4
436 0.34
437 0.39
438 0.38
439 0.42
440 0.41
441 0.36
442 0.42
443 0.41
444 0.48
445 0.47
446 0.54
447 0.56
448 0.66
449 0.74
450 0.71
451 0.75
452 0.72
453 0.69
454 0.62
455 0.55
456 0.47
457 0.39
458 0.34
459 0.24
460 0.18
461 0.18
462 0.2
463 0.2
464 0.21
465 0.2
466 0.2
467 0.24
468 0.31
469 0.35
470 0.38
471 0.45
472 0.51
473 0.61
474 0.69
475 0.72
476 0.73
477 0.74
478 0.78
479 0.8
480 0.8
481 0.79
482 0.79
483 0.8
484 0.76
485 0.73
486 0.67
487 0.58
488 0.48
489 0.4
490 0.32
491 0.26
492 0.22
493 0.2
494 0.16
495 0.18
496 0.19
497 0.2
498 0.21
499 0.23
500 0.23
501 0.24
502 0.28
503 0.26
504 0.28
505 0.26
506 0.28
507 0.28
508 0.31
509 0.34
510 0.34
511 0.41
512 0.42
513 0.49
514 0.51
515 0.52
516 0.57
517 0.6
518 0.65
519 0.65
520 0.71
521 0.73
522 0.77
523 0.83
524 0.85
525 0.85
526 0.86
527 0.86
528 0.88
529 0.88
530 0.88
531 0.9
532 0.86
533 0.85
534 0.85
535 0.85
536 0.8
537 0.75
538 0.7
539 0.65
540 0.7
541 0.7