Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SJN2

Protein Details
Accession A0A395SJN2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-293WDPTSPKSLKRQSRPDPVQSHydrophilic
337-364LPAHPKPAPKPPSPRQPREPGAPRKGPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
340-363HPKPAPKPPSPRQPREPGAPRKGP
Subcellular Location(s) plas 17, E.R. 4, mito 3, vacu 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MPGDCGSTCPASDGFYTYSPSVGGNAVLLTVFALLSLAALYFGIRSKTYLFSIVLTTGLFLEVLGFIGRILLHSKRDDQGHFFLVLFGTILGPSLMSLAIFIVLPHILSIYGKPICPFRPLVAGLIFWGLAVVIIIFELVGVIFTAYETKNFSRKQGAAIAATGLAIQALSLIACTGLHFWFTLSLSTRRGTLDARHSQIYSSSQFKKFLMAMEMASALLIVYSFYRLVEFADGVSGDVFQNQAAFMVIGGVLPFLAAALLTIIHPGNAFAEAWDPTSPKSLKRQSRPDPVQSPTPSGHPVHHLYDPDIRKQVSPTTPKHQRNSGGPPELPEGSMGLPAHPKPAPKPPSPRQPREPGAPRKGPPLPLNLSAVRASRNSYRAEQRGIVPKDMVPDEELW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.23
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.18
8 0.16
9 0.14
10 0.12
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.07
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.04
20 0.04
21 0.03
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.03
26 0.04
27 0.04
28 0.05
29 0.07
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.14
34 0.17
35 0.19
36 0.21
37 0.2
38 0.19
39 0.21
40 0.2
41 0.18
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.06
48 0.06
49 0.05
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.1
58 0.12
59 0.16
60 0.19
61 0.23
62 0.26
63 0.32
64 0.33
65 0.35
66 0.37
67 0.35
68 0.33
69 0.29
70 0.26
71 0.21
72 0.18
73 0.13
74 0.09
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.1
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.18
102 0.19
103 0.22
104 0.23
105 0.19
106 0.23
107 0.24
108 0.25
109 0.22
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.14
114 0.09
115 0.07
116 0.05
117 0.04
118 0.03
119 0.03
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.09
136 0.11
137 0.18
138 0.19
139 0.22
140 0.26
141 0.27
142 0.29
143 0.31
144 0.31
145 0.25
146 0.25
147 0.23
148 0.16
149 0.15
150 0.12
151 0.06
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.16
180 0.23
181 0.26
182 0.28
183 0.28
184 0.28
185 0.27
186 0.27
187 0.25
188 0.19
189 0.2
190 0.23
191 0.24
192 0.25
193 0.25
194 0.26
195 0.24
196 0.23
197 0.19
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.17
265 0.18
266 0.2
267 0.29
268 0.37
269 0.45
270 0.54
271 0.64
272 0.67
273 0.77
274 0.8
275 0.79
276 0.76
277 0.7
278 0.7
279 0.61
280 0.56
281 0.46
282 0.42
283 0.37
284 0.33
285 0.31
286 0.27
287 0.29
288 0.28
289 0.3
290 0.29
291 0.28
292 0.35
293 0.36
294 0.36
295 0.37
296 0.34
297 0.32
298 0.33
299 0.38
300 0.38
301 0.43
302 0.44
303 0.5
304 0.59
305 0.66
306 0.69
307 0.69
308 0.66
309 0.66
310 0.7
311 0.68
312 0.64
313 0.57
314 0.55
315 0.51
316 0.46
317 0.39
318 0.29
319 0.22
320 0.16
321 0.18
322 0.15
323 0.13
324 0.17
325 0.17
326 0.21
327 0.21
328 0.24
329 0.25
330 0.35
331 0.41
332 0.45
333 0.55
334 0.6
335 0.69
336 0.77
337 0.82
338 0.8
339 0.83
340 0.81
341 0.81
342 0.82
343 0.82
344 0.81
345 0.8
346 0.73
347 0.72
348 0.71
349 0.67
350 0.61
351 0.59
352 0.54
353 0.5
354 0.53
355 0.45
356 0.43
357 0.39
358 0.37
359 0.31
360 0.27
361 0.28
362 0.3
363 0.33
364 0.35
365 0.39
366 0.47
367 0.5
368 0.54
369 0.53
370 0.53
371 0.59
372 0.58
373 0.54
374 0.47
375 0.42
376 0.43
377 0.41
378 0.36