Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395RF27

Protein Details
Accession A0A395RF27    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MATKEKKEKKSKSSRSEPKAEKPEKVBasic
70-92APEPPSKRAKRALKKGKALPAKQHydrophilic
313-335EKDKSQQKQFKTRKWWVNRLMGRHydrophilic
343-385EDDQARYKKRFGKDRKAVPDNDSNPRGRPPPRRNDRGDNRAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-25KEKKEKKSKSSRSEPKAEKPEK
74-92PSKRAKRALKKGKALPAKQ
350-378KKRFGKDRKAVPDNDSNPRGRPPPRRNDR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATKEKKEKKSKSSRSEPKAEKPEKVVKIEKAETEPETTEADDVDMAESEPASSSKRKIELEEIEVNVDAPEPPSKRAKRALKKGKALPAKQDSDDEKKEEAKDKKTRSEHSVWIGNLPFYVTPVEMRKWLVDNSGGVITDEMITRIKLPTNKEPGRDKSVKPTNKGFAYVDFSDIGPKVSAISLTENDLGGRKLLIKDATSFEGRPKKEAEATEDAADGKTTTEQKQDVNASRKVFVGNMGFKTTDEDLSRNFEKCGEIEWVKVATFEDTGKCKGFGWVKFKEPEAAAWAVKGFVKIKEEVETEEDFKDDEEKDKSQQKQFKTRKWWVNRLMGRELKIELAEDDQARYKKRFGKDRKAVPDNDSNPRGRPPPRRNDRGDNRAGENKGNGEATTKPLKEAEDIAVARLTGAVVKHTGSKMTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.91
3 0.91
4 0.88
5 0.88
6 0.88
7 0.83
8 0.77
9 0.74
10 0.76
11 0.71
12 0.71
13 0.68
14 0.63
15 0.66
16 0.65
17 0.61
18 0.55
19 0.53
20 0.47
21 0.44
22 0.39
23 0.32
24 0.29
25 0.25
26 0.21
27 0.17
28 0.15
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.11
40 0.14
41 0.17
42 0.23
43 0.29
44 0.31
45 0.34
46 0.41
47 0.43
48 0.46
49 0.49
50 0.43
51 0.39
52 0.37
53 0.33
54 0.25
55 0.2
56 0.13
57 0.09
58 0.15
59 0.15
60 0.19
61 0.29
62 0.32
63 0.38
64 0.48
65 0.57
66 0.62
67 0.71
68 0.79
69 0.79
70 0.84
71 0.86
72 0.85
73 0.84
74 0.77
75 0.76
76 0.73
77 0.68
78 0.6
79 0.58
80 0.54
81 0.52
82 0.52
83 0.46
84 0.4
85 0.4
86 0.42
87 0.45
88 0.47
89 0.48
90 0.54
91 0.57
92 0.64
93 0.67
94 0.68
95 0.67
96 0.66
97 0.62
98 0.59
99 0.59
100 0.49
101 0.47
102 0.42
103 0.34
104 0.28
105 0.23
106 0.17
107 0.12
108 0.12
109 0.08
110 0.1
111 0.13
112 0.15
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.19
117 0.19
118 0.18
119 0.16
120 0.15
121 0.16
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.11
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.12
135 0.15
136 0.2
137 0.28
138 0.38
139 0.41
140 0.46
141 0.52
142 0.54
143 0.59
144 0.59
145 0.52
146 0.52
147 0.59
148 0.59
149 0.56
150 0.57
151 0.54
152 0.49
153 0.51
154 0.41
155 0.34
156 0.34
157 0.3
158 0.25
159 0.19
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.15
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.19
191 0.26
192 0.25
193 0.25
194 0.25
195 0.24
196 0.27
197 0.28
198 0.28
199 0.26
200 0.27
201 0.25
202 0.24
203 0.22
204 0.18
205 0.17
206 0.11
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.19
215 0.24
216 0.28
217 0.32
218 0.34
219 0.33
220 0.33
221 0.32
222 0.29
223 0.24
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.2
232 0.18
233 0.16
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.19
238 0.21
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.15
252 0.13
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.2
263 0.25
264 0.28
265 0.32
266 0.34
267 0.38
268 0.4
269 0.4
270 0.39
271 0.33
272 0.28
273 0.25
274 0.24
275 0.19
276 0.17
277 0.16
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.12
282 0.12
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.2
287 0.2
288 0.2
289 0.23
290 0.23
291 0.22
292 0.2
293 0.19
294 0.16
295 0.15
296 0.16
297 0.13
298 0.15
299 0.17
300 0.19
301 0.25
302 0.32
303 0.39
304 0.44
305 0.5
306 0.54
307 0.61
308 0.68
309 0.72
310 0.75
311 0.78
312 0.8
313 0.83
314 0.85
315 0.82
316 0.84
317 0.79
318 0.75
319 0.74
320 0.68
321 0.6
322 0.52
323 0.45
324 0.36
325 0.31
326 0.25
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.2
333 0.23
334 0.27
335 0.28
336 0.33
337 0.37
338 0.45
339 0.54
340 0.59
341 0.67
342 0.73
343 0.81
344 0.85
345 0.85
346 0.8
347 0.75
348 0.75
349 0.7
350 0.69
351 0.64
352 0.56
353 0.51
354 0.53
355 0.54
356 0.53
357 0.58
358 0.59
359 0.65
360 0.73
361 0.8
362 0.82
363 0.86
364 0.88
365 0.86
366 0.85
367 0.78
368 0.74
369 0.73
370 0.67
371 0.59
372 0.51
373 0.44
374 0.38
375 0.34
376 0.28
377 0.22
378 0.22
379 0.24
380 0.3
381 0.28
382 0.27
383 0.28
384 0.3
385 0.3
386 0.31
387 0.29
388 0.28
389 0.28
390 0.28
391 0.27
392 0.25
393 0.22
394 0.19
395 0.16
396 0.1
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.13
401 0.18
402 0.19
403 0.23