FuNGI

A0A395SRR3

Protein Details

Accession

A0A395SRR3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-38	DVDECDTSRPKPKRSKKHGGKARQHQNSGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-31	RPKPKRSKKHGGKAR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MATKREFEDVDECDTSRPKPKRSKKHGGKARQHQNSGIDPTWGQKYVFADNEHATTIPAGEESDFEDDADAMAYLDSVRQQAAGIPHLLVAPKVQIGPQLPAELRGDDQDDGEGPVDRSIYNDGIGDARGWYEDGAYMAMPDDVNDEGNYEEGEYPEDDDDSYDEEVAIHEAYFASVMDQYLHLRTILHAEPPHNARSRLAKAKLKTEAPADNQTSVIATWSKLLRDTDPHPLQVAHMSKDTTLRILRIMLGGKFLRRGYTLPERTSRWIWALLARLPDRGELNYAEVGWIRDLGRRAVLLGRSLSEMAALREELAEGGLGAHEAVDRSSSDEDVMADPEDMDVEGAISAEEGEEDSTPPETEQEAEQTPKTTKTTTASPPKPDAEEGEVDEEEDVAMDTASDSDAEEGEVAALESKENLEAAKERLLAQINNGAASEDDEDAAKGAAKQRLRANLRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.32
3	0.37
4	0.42
5	0.45
6	0.55
7	0.65
8	0.73
9	0.81
10	0.89
11	0.9
12	0.93
13	0.94
14	0.94
15	0.94
16	0.93
17	0.94
18	0.92
19	0.84
20	0.78
21	0.73
22	0.68
23	0.64
24	0.54
25	0.46
26	0.37
27	0.37
28	0.36
29	0.33
30	0.26
31	0.22
32	0.25
33	0.28
34	0.32
35	0.31
36	0.31
37	0.31
38	0.32
39	0.29
40	0.26
41	0.21
42	0.16
43	0.15
44	0.1
45	0.09
46	0.08
47	0.07
48	0.08
49	0.1
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.08
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.04
62	0.05
63	0.06
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.11
69	0.13
70	0.15
71	0.15
72	0.14
73	0.15
74	0.15
75	0.16
76	0.13
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.13
83	0.15
84	0.18
85	0.18
86	0.21
87	0.2
88	0.22
89	0.23
90	0.2
91	0.19
92	0.17
93	0.18
94	0.14
95	0.14
96	0.12
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.1
102	0.1
103	0.1
104	0.09
105	0.1
106	0.12
107	0.12
108	0.11
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.12
113	0.1
114	0.08
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.05
129	0.06
130	0.06
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.08
141	0.07
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.07
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.12
174	0.12
175	0.14
176	0.15
177	0.16
178	0.2
179	0.23
180	0.27
181	0.26
182	0.26
183	0.24
184	0.29
185	0.35
186	0.39
187	0.43
188	0.44
189	0.43
190	0.49
191	0.52
192	0.46
193	0.42
194	0.38
195	0.36
196	0.34
197	0.38
198	0.33
199	0.29
200	0.27
201	0.25
202	0.21
203	0.16
204	0.13
205	0.08
206	0.06
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.11
211	0.12
212	0.12
213	0.15
214	0.18
215	0.26
216	0.26
217	0.26
218	0.25
219	0.24
220	0.23
221	0.25
222	0.24
223	0.16
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.17
228	0.17
229	0.14
230	0.13
231	0.12
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.1
238	0.12
239	0.13
240	0.12
241	0.15
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.16
247	0.26
248	0.3
249	0.3
250	0.34
251	0.35
252	0.38
253	0.39
254	0.34
255	0.26
256	0.23
257	0.2
258	0.19
259	0.19
260	0.18
261	0.21
262	0.2
263	0.2
264	0.19
265	0.19
266	0.18
267	0.15
268	0.15
269	0.11
270	0.12
271	0.11
272	0.11
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.08
277	0.09
278	0.07
279	0.1
280	0.11
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.12
285	0.14
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.12
293	0.1
294	0.1
295	0.08
296	0.09
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.04
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.03
313	0.04
314	0.05
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.1
322	0.11
323	0.09
324	0.08
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.03
332	0.03
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.1
351	0.13
352	0.15
353	0.17
354	0.18
355	0.19
356	0.21
357	0.23
358	0.24
359	0.22
360	0.22
361	0.23
362	0.3
363	0.36
364	0.46
365	0.48
366	0.52
367	0.55
368	0.55
369	0.54
370	0.48
371	0.42
372	0.36
373	0.32
374	0.28
375	0.27
376	0.24
377	0.22
378	0.2
379	0.17
380	0.12
381	0.09
382	0.08
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.11
409	0.14
410	0.18
411	0.18
412	0.19
413	0.24
414	0.27
415	0.25
416	0.25
417	0.28
418	0.24
419	0.24
420	0.22
421	0.18
422	0.15
423	0.16
424	0.15
425	0.1
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.1
433	0.16
434	0.22
435	0.24
436	0.3
437	0.36
438	0.46
439	0.5
440	0.55
441	0.54
442	0.57
443	0.58
444	0.55
445	0.52
446	0.44
447	0.39
448	0.33
449	0.27
450	0.19
451	0.16
452	0.12
453	0.1
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.12
462	0.14
463	0.16
464	0.24
465	0.23
466	0.21

A0A395SRR3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer