Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395SVL1

Protein Details
Accession A0A395SVL1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-45HTGHHHLHKRHHQHSHHHDGMBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 17, E.R. 4, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024535  Pectate_lyase_SF_prot  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0016829  F:lyase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12708  Pectate_lyase_3  
Amino Acid Sequences MDSGVFSMYRMLCGLLVFCPLVLGHTGHHHLHKRHHQHSHHHDGMEAQSDISISDVESAIENALAALAEINKARVKHPSFNKYKIVEDSNLSLAGPLDYSSNSTKVKRDTGAAPYVIPSELQDAARTLAESNPQKPSGDHAQVAARIKAKYDHKNSDTNSLDPLDRPDGRLGEFGPDSKQKVMERAAGYWMVDMPQLGLAPYAPKGYKASVWRNVKDFGAKGDGKTDDTAAINRAISDGQRCGPECGASIKIPAVIYFPPGDVSQEHKFDDCMITDMSFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.09
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.15
13 0.19
14 0.21
15 0.28
16 0.35
17 0.38
18 0.48
19 0.57
20 0.62
21 0.67
22 0.75
23 0.75
24 0.78
25 0.83
26 0.83
27 0.78
28 0.68
29 0.59
30 0.52
31 0.47
32 0.4
33 0.3
34 0.2
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.11
39 0.09
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.03
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.08
58 0.1
59 0.11
60 0.13
61 0.21
62 0.25
63 0.33
64 0.42
65 0.51
66 0.56
67 0.61
68 0.67
69 0.61
70 0.59
71 0.55
72 0.5
73 0.41
74 0.36
75 0.32
76 0.26
77 0.24
78 0.2
79 0.16
80 0.12
81 0.1
82 0.08
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.08
87 0.09
88 0.13
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.23
93 0.26
94 0.25
95 0.26
96 0.26
97 0.28
98 0.3
99 0.27
100 0.24
101 0.21
102 0.21
103 0.17
104 0.14
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.22
127 0.2
128 0.21
129 0.23
130 0.25
131 0.22
132 0.18
133 0.16
134 0.16
135 0.2
136 0.26
137 0.31
138 0.37
139 0.42
140 0.43
141 0.49
142 0.5
143 0.53
144 0.48
145 0.4
146 0.35
147 0.29
148 0.26
149 0.2
150 0.22
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.18
157 0.18
158 0.16
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.15
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.21
167 0.18
168 0.22
169 0.24
170 0.27
171 0.26
172 0.25
173 0.26
174 0.23
175 0.22
176 0.18
177 0.16
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.1
190 0.09
191 0.11
192 0.13
193 0.14
194 0.19
195 0.26
196 0.33
197 0.4
198 0.48
199 0.49
200 0.51
201 0.51
202 0.48
203 0.44
204 0.37
205 0.31
206 0.31
207 0.29
208 0.26
209 0.29
210 0.28
211 0.26
212 0.26
213 0.24
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.16
218 0.16
219 0.14
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.15
225 0.16
226 0.17
227 0.21
228 0.23
229 0.25
230 0.25
231 0.25
232 0.23
233 0.24
234 0.25
235 0.21
236 0.21
237 0.19
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.17
242 0.14
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.16
249 0.15
250 0.21
251 0.24
252 0.27
253 0.28
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.29
258 0.24
259 0.2
260 0.18