Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395RXI6

Protein Details
Accession A0A395RXI6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
315-340ATPSQPRSSRPTKQEKRSLSPEQRVIHydrophilic
363-382IVNSRKRKGTDIFHKPKRRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-289SAPRRPSPGP
367-382RKRKGTDIFHKPKRRA
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 1, plas 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPAKSLMDIATAACLKNIRSIDSVGELLLYQTVRQILLKIDNPKQLRNIELNSPQIQGETGEVWLKIIKHEFPMEFKQKAYKPTNPTEWHRVYAKYKKDHQKALDESEAKLKNAFMGLQQDRAKTKTMIVDDRRLLPQGGRVGPKKPWGFGARDPNGSTLAFTRGSRTKTNNGASVMRKVRRETKEIASIHGKLSRPTQASNAITKIRKAPAAMVNDYQRASQPAIRAPSKPTSSEVVEAHEKRAQYISDSDSGDDGGGDDLFDDDPSPPRKVASRPSSSAPRRPSPGPSRPATNVKRSGLLSNNYKGPKPQAAATPSQPRSSRPTKQEKRSLSPEQRVISSSPEPGPYSSPPPASAARPLSIVNSRKRKGTDIFHKPKRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.22
4 0.23
5 0.22
6 0.23
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.26
11 0.19
12 0.18
13 0.15
14 0.12
15 0.13
16 0.11
17 0.08
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.15
24 0.22
25 0.28
26 0.33
27 0.39
28 0.46
29 0.48
30 0.51
31 0.53
32 0.49
33 0.49
34 0.47
35 0.44
36 0.44
37 0.46
38 0.48
39 0.44
40 0.42
41 0.37
42 0.31
43 0.28
44 0.21
45 0.17
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.13
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.24
58 0.25
59 0.28
60 0.37
61 0.41
62 0.39
63 0.38
64 0.43
65 0.42
66 0.5
67 0.52
68 0.51
69 0.52
70 0.58
71 0.66
72 0.64
73 0.67
74 0.67
75 0.64
76 0.59
77 0.55
78 0.53
79 0.52
80 0.54
81 0.56
82 0.55
83 0.61
84 0.68
85 0.72
86 0.75
87 0.71
88 0.72
89 0.69
90 0.66
91 0.64
92 0.55
93 0.49
94 0.49
95 0.46
96 0.37
97 0.32
98 0.26
99 0.19
100 0.19
101 0.18
102 0.11
103 0.18
104 0.19
105 0.25
106 0.28
107 0.29
108 0.31
109 0.32
110 0.32
111 0.24
112 0.26
113 0.24
114 0.26
115 0.32
116 0.34
117 0.39
118 0.38
119 0.41
120 0.4
121 0.35
122 0.32
123 0.23
124 0.24
125 0.23
126 0.25
127 0.27
128 0.28
129 0.29
130 0.32
131 0.39
132 0.36
133 0.31
134 0.32
135 0.31
136 0.33
137 0.37
138 0.45
139 0.4
140 0.41
141 0.41
142 0.37
143 0.35
144 0.3
145 0.24
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.15
151 0.18
152 0.22
153 0.25
154 0.28
155 0.31
156 0.37
157 0.4
158 0.39
159 0.37
160 0.38
161 0.36
162 0.39
163 0.4
164 0.37
165 0.36
166 0.36
167 0.43
168 0.42
169 0.44
170 0.42
171 0.4
172 0.44
173 0.42
174 0.43
175 0.37
176 0.34
177 0.31
178 0.31
179 0.26
180 0.19
181 0.21
182 0.23
183 0.21
184 0.21
185 0.22
186 0.24
187 0.26
188 0.27
189 0.28
190 0.27
191 0.27
192 0.27
193 0.28
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.23
198 0.24
199 0.28
200 0.28
201 0.27
202 0.27
203 0.28
204 0.28
205 0.24
206 0.19
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.17
212 0.22
213 0.24
214 0.25
215 0.27
216 0.31
217 0.31
218 0.3
219 0.29
220 0.27
221 0.27
222 0.29
223 0.25
224 0.23
225 0.28
226 0.27
227 0.28
228 0.26
229 0.25
230 0.22
231 0.24
232 0.2
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.2
237 0.2
238 0.19
239 0.17
240 0.17
241 0.15
242 0.12
243 0.09
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.11
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.21
259 0.26
260 0.35
261 0.39
262 0.42
263 0.44
264 0.49
265 0.58
266 0.6
267 0.63
268 0.6
269 0.57
270 0.55
271 0.55
272 0.58
273 0.58
274 0.61
275 0.59
276 0.55
277 0.56
278 0.56
279 0.64
280 0.6
281 0.6
282 0.58
283 0.53
284 0.54
285 0.5
286 0.5
287 0.46
288 0.46
289 0.44
290 0.4
291 0.46
292 0.43
293 0.43
294 0.41
295 0.4
296 0.4
297 0.36
298 0.36
299 0.36
300 0.39
301 0.43
302 0.47
303 0.52
304 0.48
305 0.52
306 0.49
307 0.45
308 0.49
309 0.53
310 0.55
311 0.54
312 0.63
313 0.67
314 0.76
315 0.83
316 0.83
317 0.82
318 0.82
319 0.83
320 0.81
321 0.8
322 0.77
323 0.7
324 0.64
325 0.58
326 0.5
327 0.46
328 0.38
329 0.34
330 0.29
331 0.3
332 0.3
333 0.29
334 0.32
335 0.29
336 0.33
337 0.34
338 0.33
339 0.31
340 0.34
341 0.35
342 0.34
343 0.38
344 0.35
345 0.32
346 0.31
347 0.31
348 0.32
349 0.37
350 0.41
351 0.44
352 0.5
353 0.51
354 0.56
355 0.59
356 0.61
357 0.6
358 0.64
359 0.65
360 0.66
361 0.74
362 0.78