FuNGI

A0A395SDC4

Protein Details

Accession

A0A395SDC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
463-492	APAVSTKSTKKEKKRKSKETPETKQKKMTL	Hydrophilic
530-553	QAEARSAAKKSKKQKTDRVGSPDL	Hydrophilic
584-608	AVTPAASSKKQKKVKETPLPAPRQS	Hydrophilic
631-664	SQAPSSPIRAKEKRVKKSKDSKKTASSKKETPVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
470-489	STKKEKKRKSKETPETKQKK
636-659	SPIRAKEKRVKKSKDSKKTASSKK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPFKVHSLSKHIENTKKGLSADSQLNRRPTGRSAVVKKESSDPNNIFANNDDEEGSGSDSDSDSSSDEATGSFLERLTAGAKSAPAKPTPVKSTPQAARRRSKDEEIADSDDERKASNNKASTKKPAPKPSSSSDSSSESESDDEETNTKANGTTPAKDADSSSSSSESESESEKEDEKKTLAAKPSARKKDDSDSSSSEESEDEAESKPKPTANGTAAATTSASSSSSSESSSESESEEEQAAKPTTKTVTKPAAKSAATVSDSSSSEDEDSDDEMVDESMHIEDREGQVAVPNFIAPDFILRKGDDGTNGKDVAEVCNKANLEGKQFWYFTVPSDVPISVIQNLEIPMNQSSANNKLFSHGGDDYGFSFESIAPKSNIQIMIPSSDASQYRPAPKQIDQMMQVKKITQLGANSSVGPIPKPAPRAQPAGLKARYQPIGVNEPMGTISDGEDVEMAEAPAVSTKSTKKEKKRKSKETPETKQKKMTLPERPSPQTVEEPTPDTRKNKRKLAASEDDATAVTEQLQAEARSAAKKSKKQKTDRVGSPDLGSEPASVAAKKQTPILPPTIPTAGTPTPKAAVTPAASSKKQKKVKETPLPAPRQSVVPIPSIPHSSPPRSSPAPAPASQAPSSPIRAKEKRVKKSKDSKKTASSKKETPVLPPVPGSSSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.64
3	0.66
4	0.64
5	0.62
6	0.58
7	0.57
8	0.51
9	0.45
10	0.4
11	0.38
12	0.43
13	0.45
14	0.47
15	0.49
16	0.53
17	0.53
18	0.52
19	0.5
20	0.44
21	0.46
22	0.46
23	0.5
24	0.53
25	0.6
26	0.65
27	0.64
28	0.62
29	0.62
30	0.63
31	0.58
32	0.59
33	0.52
34	0.48
35	0.51
36	0.48
37	0.41
38	0.34
39	0.34
40	0.25
41	0.24
42	0.2
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.16
47	0.12
48	0.11
49	0.1
50	0.1
51	0.11
52	0.1
53	0.1
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.08
65	0.09
66	0.09
67	0.1
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.1
72	0.13
73	0.15
74	0.2
75	0.23
76	0.23
77	0.29
78	0.33
79	0.39
80	0.44
81	0.45
82	0.45
83	0.46
84	0.54
85	0.55
86	0.59
87	0.62
88	0.63
89	0.69
90	0.71
91	0.74
92	0.7
93	0.7
94	0.69
95	0.64
96	0.63
97	0.58
98	0.56
99	0.49
100	0.44
101	0.4
102	0.33
103	0.29
104	0.22
105	0.2
106	0.19
107	0.24
108	0.3
109	0.35
110	0.41
111	0.49
112	0.54
113	0.6
114	0.66
115	0.7
116	0.72
117	0.76
118	0.75
119	0.75
120	0.76
121	0.73
122	0.7
123	0.64
124	0.58
125	0.51
126	0.49
127	0.42
128	0.38
129	0.31
130	0.25
131	0.22
132	0.19
133	0.18
134	0.14
135	0.14
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.12
140	0.12
141	0.1
142	0.1
143	0.17
144	0.2
145	0.21
146	0.23
147	0.26
148	0.26
149	0.26
150	0.26
151	0.22
152	0.21
153	0.21
154	0.2
155	0.19
156	0.18
157	0.18
158	0.17
159	0.14
160	0.13
161	0.14
162	0.13
163	0.15
164	0.16
165	0.19
166	0.22
167	0.23
168	0.23
169	0.22
170	0.24
171	0.24
172	0.28
173	0.3
174	0.33
175	0.38
176	0.45
177	0.54
178	0.6
179	0.6
180	0.58
181	0.57
182	0.6
183	0.62
184	0.56
185	0.52
186	0.47
187	0.48
188	0.45
189	0.41
190	0.32
191	0.24
192	0.2
193	0.16
194	0.12
195	0.09
196	0.09
197	0.11
198	0.12
199	0.13
200	0.14
201	0.14
202	0.15
203	0.17
204	0.22
205	0.22
206	0.26
207	0.25
208	0.25
209	0.24
210	0.22
211	0.2
212	0.14
213	0.12
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.12
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.13
237	0.14
238	0.16
239	0.19
240	0.2
241	0.24
242	0.33
243	0.37
244	0.39
245	0.41
246	0.44
247	0.4
248	0.39
249	0.34
250	0.29
251	0.25
252	0.24
253	0.21
254	0.18
255	0.18
256	0.18
257	0.17
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.08
280	0.08
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.04
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.12
296	0.13
297	0.14
298	0.14
299	0.15
300	0.17
301	0.18
302	0.18
303	0.17
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.17
308	0.16
309	0.14
310	0.17
311	0.17
312	0.16
313	0.2
314	0.18
315	0.19
316	0.2
317	0.22
318	0.22
319	0.22
320	0.21
321	0.19
322	0.19
323	0.15
324	0.18
325	0.15
326	0.13
327	0.14
328	0.14
329	0.12
330	0.13
331	0.13
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.08
338	0.07
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.09
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.16
351	0.16
352	0.18
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.07
361	0.08
362	0.07
363	0.09
364	0.09
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.12
369	0.14
370	0.14
371	0.12
372	0.13
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.12
377	0.09
378	0.11
379	0.12
380	0.11
381	0.16
382	0.17
383	0.22
384	0.25
385	0.28
386	0.29
387	0.31
388	0.36
389	0.35
390	0.36
391	0.34
392	0.39
393	0.39
394	0.38
395	0.36
396	0.3
397	0.28
398	0.26
399	0.23
400	0.17
401	0.16
402	0.16
403	0.2
404	0.2
405	0.18
406	0.16
407	0.17
408	0.15
409	0.14
410	0.12
411	0.11
412	0.13
413	0.17
414	0.2
415	0.26
416	0.29
417	0.34
418	0.35
419	0.39
420	0.4
421	0.45
422	0.43
423	0.38
424	0.37
425	0.37
426	0.36
427	0.3
428	0.28
429	0.23
430	0.26
431	0.25
432	0.24
433	0.19
434	0.18
435	0.17
436	0.16
437	0.12
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.08
455	0.12
456	0.19
457	0.29
458	0.38
459	0.48
460	0.59
461	0.69
462	0.78
463	0.86
464	0.9
465	0.91
466	0.94
467	0.94
468	0.95
469	0.94
470	0.94
471	0.91
472	0.85
473	0.82
474	0.76
475	0.72
476	0.69
477	0.68
478	0.67
479	0.66
480	0.68
481	0.68
482	0.67
483	0.62
484	0.56
485	0.51
486	0.46
487	0.43
488	0.39
489	0.33
490	0.33
491	0.35
492	0.38
493	0.39
494	0.4
495	0.46
496	0.52
497	0.58
498	0.63
499	0.66
500	0.69
501	0.71
502	0.74
503	0.72
504	0.67
505	0.62
506	0.54
507	0.48
508	0.39
509	0.32
510	0.23
511	0.15
512	0.1
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.12
517	0.11
518	0.12
519	0.13
520	0.14
521	0.15
522	0.17
523	0.24
524	0.3
525	0.38
526	0.47
527	0.56
528	0.65
529	0.71
530	0.8
531	0.83
532	0.85
533	0.85
534	0.83
535	0.78
536	0.7
537	0.61
538	0.53
539	0.43
540	0.34
541	0.27
542	0.18
543	0.14
544	0.14
545	0.14
546	0.12
547	0.12
548	0.17
549	0.2
550	0.2
551	0.25
552	0.27
553	0.31
554	0.35
555	0.39
556	0.35
557	0.33
558	0.37
559	0.34
560	0.3
561	0.25
562	0.28
563	0.27
564	0.28
565	0.27
566	0.25
567	0.25
568	0.25
569	0.25
570	0.2
571	0.21
572	0.2
573	0.22
574	0.28
575	0.33
576	0.36
577	0.45
578	0.53
579	0.58
580	0.64
581	0.67
582	0.69
583	0.74
584	0.82
585	0.84
586	0.83
587	0.83
588	0.85
589	0.86
590	0.78
591	0.72
592	0.62
593	0.54
594	0.48
595	0.44
596	0.36
597	0.32
598	0.31
599	0.28
600	0.3
601	0.32
602	0.31
603	0.33
604	0.38
605	0.39
606	0.42
607	0.43
608	0.47
609	0.46
610	0.48
611	0.46
612	0.48
613	0.49
614	0.46
615	0.49
616	0.46
617	0.49
618	0.46
619	0.41
620	0.35
621	0.32
622	0.37
623	0.37
624	0.39
625	0.43
626	0.48
627	0.56
628	0.64
629	0.71
630	0.76
631	0.81
632	0.83
633	0.83
634	0.89
635	0.9
636	0.91
637	0.9
638	0.89
639	0.89
640	0.9
641	0.9
642	0.9
643	0.87
644	0.83
645	0.81
646	0.8
647	0.71
648	0.67
649	0.67
650	0.6
651	0.55
652	0.49
653	0.43

A0A395SDC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer