Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TRL7

Protein Details
Accession A0A397TRL7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38LETKEKQIYERKQKIKEAIREHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRRQARLRREYLYRKSLETKEKQIYERKQKIKEAIREGKPIPTELRAEATKFQKDLNFDEAQPEPTTHIDDEYANAGIYDPKILITTSRDPSSRLSQFAKEMRLIFPNSQRINRGNYVVKDLVDACKSNDVTDLIIVHEHRGEPDGLVVCHFPYGPTAFFSLHNVVLRHDIQDEGTVSEAFPHLIFHNFNSNLGRRVMNILKYLFPVPREDSKRVMTFANDSDYISFRHNVFVKINNKEVQLVEVGPRFEMRVYEIKLGTVDLKDADTEWVLRPYQRTARKRDQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.64
3 0.67
4 0.69
5 0.69
6 0.66
7 0.66
8 0.66
9 0.69
10 0.69
11 0.71
12 0.74
13 0.75
14 0.78
15 0.78
16 0.76
17 0.77
18 0.81
19 0.8
20 0.79
21 0.78
22 0.78
23 0.74
24 0.74
25 0.68
26 0.64
27 0.56
28 0.5
29 0.42
30 0.36
31 0.33
32 0.27
33 0.31
34 0.27
35 0.28
36 0.31
37 0.34
38 0.35
39 0.33
40 0.34
41 0.32
42 0.33
43 0.35
44 0.34
45 0.31
46 0.27
47 0.3
48 0.29
49 0.28
50 0.26
51 0.22
52 0.18
53 0.17
54 0.2
55 0.16
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.12
74 0.18
75 0.21
76 0.24
77 0.24
78 0.25
79 0.29
80 0.36
81 0.33
82 0.31
83 0.3
84 0.3
85 0.35
86 0.37
87 0.35
88 0.3
89 0.29
90 0.27
91 0.27
92 0.28
93 0.25
94 0.27
95 0.33
96 0.33
97 0.34
98 0.36
99 0.34
100 0.37
101 0.36
102 0.35
103 0.31
104 0.29
105 0.33
106 0.3
107 0.27
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.16
112 0.16
113 0.11
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.17
156 0.15
157 0.14
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.22
179 0.23
180 0.23
181 0.24
182 0.23
183 0.16
184 0.22
185 0.24
186 0.23
187 0.25
188 0.24
189 0.23
190 0.25
191 0.26
192 0.23
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.3
197 0.35
198 0.36
199 0.38
200 0.42
201 0.43
202 0.41
203 0.37
204 0.3
205 0.28
206 0.27
207 0.27
208 0.22
209 0.2
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.15
216 0.21
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.33
221 0.38
222 0.4
223 0.45
224 0.42
225 0.41
226 0.4
227 0.38
228 0.31
229 0.25
230 0.22
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.2
241 0.24
242 0.29
243 0.28
244 0.28
245 0.28
246 0.28
247 0.26
248 0.19
249 0.17
250 0.12
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.12
256 0.14
257 0.15
258 0.18
259 0.19
260 0.22
261 0.24
262 0.3
263 0.38
264 0.46
265 0.52
266 0.58