Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SBP6

Protein Details
Accession A0A397SBP6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-158DSYDDPTKKFKKEPRKQKPTPILPPLEDHydrophilic
686-708IITENDKKSKRKPARFWPVKGAPHydrophilic
801-822QQKYYKYHTKALKERKRQGIGQHydrophilic
905-931EKFWAYLYYRKDKNKRKIEVCDQLKKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-148KFKKEPRKQK
309-312RRGR
692-700KKSKRKPAR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006607  DM15  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MVSPTTAQPDNNLAGSSVGNVNLIKPAGTKIKNELESNGSSTVRSPVRQTSEQGKETVQLNEENQPYSENETTSKKIIPPPAPIPTVNVWQVRMNAQKATDVTTSNEKEKEVLVDTNRKKTDNNQDNDHNDSYDDPTKKFKKEPRKQKPTPILPPLEDQTSWPAPAEVLIKDKEKETIDSSEKKQTNDSNAKKDDGSSKKGKDKWVRYIPTITHNTPLPGHERSKPSRRRSEDHVGLREQRKSNDKPNNSNNSEVESNNPPPRNPSPSRRRASVPPPTREYSRRYSQSNDNNGQIGHHINGGSHFRGGRRGRGRSYNGARGHPRSATISYSTGYGHHNNGHHGQHGHHGHQGPHQYNNLYGSKVGVVYDVTFLKYYILQQIEYYFSIENLCKDIYLRNNMDSEGYVPISLLAGFNRVKALTMDEKLVREALLMSYIVEVIGDKVRKREGWEFWLLPKQNNLPDNGEEQLTTEQTITESSNIQNQYDVIVEESLLQDEDENKENQEMPTIPEGNSEDNSPNNVNPWILQTKKRRTLSSPTSPHDPPKQTTTTVDDELFQFDEEWTGDSRNNTVQKYYATSDEEDDDDDEFDDDTIASILIVTQKKKDKSHIPFERKAMNEEIVEMINEGLYHYEYDLHKKRVNNNMSNNCKVDIISEEKFTSIVTSTKSREGSSSSNSGTNLSSKIIITENDKKSKRKPARFWPVKGAPQVPLSSSAKANHKHIPDTRQYYAQNAVGWVLGDQPYHPSEGTSPHASASPLSHSNCLSNSYSEQLSSSADLARSFPTFQHPSHELLKENGFIQQKYYKYHTKALKERKRQGIGQSQEMNTLFRFWSHFLREHFNKRMYSEFKKLAVEDANSNYRYGLECLFRFYSYGLEKKYRQDIFNDFQELTLNDHKNGYLYGVEKFWAYLYYRKDKNKRKIEVCDQLKKTLENFQSIDDFRTAQKLTQPSTTYYTTSNHHHATTSSSSSLNNSNTVDNYPPLALATSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.14
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.17
14 0.25
15 0.28
16 0.31
17 0.35
18 0.44
19 0.49
20 0.5
21 0.48
22 0.44
23 0.44
24 0.44
25 0.4
26 0.31
27 0.27
28 0.26
29 0.3
30 0.28
31 0.27
32 0.28
33 0.33
34 0.4
35 0.43
36 0.47
37 0.5
38 0.55
39 0.56
40 0.53
41 0.46
42 0.42
43 0.42
44 0.4
45 0.33
46 0.28
47 0.28
48 0.33
49 0.34
50 0.31
51 0.28
52 0.27
53 0.26
54 0.29
55 0.28
56 0.23
57 0.25
58 0.29
59 0.32
60 0.33
61 0.35
62 0.33
63 0.37
64 0.45
65 0.46
66 0.48
67 0.52
68 0.55
69 0.55
70 0.51
71 0.49
72 0.44
73 0.44
74 0.42
75 0.38
76 0.33
77 0.33
78 0.35
79 0.37
80 0.4
81 0.37
82 0.34
83 0.32
84 0.34
85 0.32
86 0.35
87 0.3
88 0.25
89 0.26
90 0.32
91 0.35
92 0.36
93 0.36
94 0.32
95 0.31
96 0.3
97 0.3
98 0.25
99 0.27
100 0.28
101 0.37
102 0.42
103 0.5
104 0.52
105 0.5
106 0.49
107 0.52
108 0.57
109 0.57
110 0.58
111 0.55
112 0.61
113 0.64
114 0.68
115 0.6
116 0.49
117 0.39
118 0.35
119 0.34
120 0.33
121 0.32
122 0.28
123 0.36
124 0.42
125 0.46
126 0.53
127 0.57
128 0.61
129 0.69
130 0.79
131 0.8
132 0.85
133 0.88
134 0.9
135 0.91
136 0.9
137 0.89
138 0.87
139 0.81
140 0.72
141 0.69
142 0.61
143 0.53
144 0.43
145 0.35
146 0.32
147 0.29
148 0.27
149 0.22
150 0.2
151 0.16
152 0.18
153 0.19
154 0.14
155 0.16
156 0.19
157 0.21
158 0.22
159 0.23
160 0.26
161 0.25
162 0.26
163 0.26
164 0.3
165 0.34
166 0.39
167 0.43
168 0.48
169 0.49
170 0.47
171 0.49
172 0.47
173 0.51
174 0.55
175 0.58
176 0.58
177 0.58
178 0.59
179 0.53
180 0.51
181 0.51
182 0.46
183 0.47
184 0.46
185 0.5
186 0.56
187 0.6
188 0.67
189 0.68
190 0.69
191 0.73
192 0.74
193 0.72
194 0.68
195 0.69
196 0.62
197 0.61
198 0.59
199 0.5
200 0.43
201 0.39
202 0.37
203 0.32
204 0.32
205 0.28
206 0.26
207 0.28
208 0.31
209 0.38
210 0.44
211 0.53
212 0.61
213 0.66
214 0.71
215 0.75
216 0.73
217 0.74
218 0.77
219 0.76
220 0.75
221 0.71
222 0.65
223 0.66
224 0.66
225 0.65
226 0.58
227 0.54
228 0.53
229 0.54
230 0.59
231 0.61
232 0.64
233 0.66
234 0.73
235 0.77
236 0.72
237 0.7
238 0.61
239 0.56
240 0.5
241 0.41
242 0.35
243 0.31
244 0.34
245 0.36
246 0.37
247 0.32
248 0.36
249 0.41
250 0.46
251 0.46
252 0.51
253 0.54
254 0.63
255 0.68
256 0.65
257 0.65
258 0.64
259 0.67
260 0.68
261 0.66
262 0.63
263 0.64
264 0.63
265 0.64
266 0.61
267 0.57
268 0.54
269 0.54
270 0.52
271 0.49
272 0.51
273 0.55
274 0.6
275 0.63
276 0.59
277 0.52
278 0.48
279 0.44
280 0.4
281 0.32
282 0.24
283 0.15
284 0.13
285 0.11
286 0.1
287 0.13
288 0.16
289 0.15
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.23
294 0.25
295 0.32
296 0.37
297 0.42
298 0.45
299 0.52
300 0.57
301 0.58
302 0.62
303 0.62
304 0.57
305 0.58
306 0.58
307 0.53
308 0.51
309 0.42
310 0.37
311 0.32
312 0.3
313 0.26
314 0.23
315 0.21
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.15
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.19
324 0.2
325 0.22
326 0.26
327 0.26
328 0.26
329 0.24
330 0.23
331 0.27
332 0.29
333 0.28
334 0.28
335 0.29
336 0.28
337 0.31
338 0.37
339 0.31
340 0.31
341 0.32
342 0.27
343 0.26
344 0.29
345 0.26
346 0.19
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.15
370 0.16
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.13
381 0.16
382 0.22
383 0.23
384 0.23
385 0.24
386 0.24
387 0.24
388 0.2
389 0.17
390 0.12
391 0.1
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.06
398 0.04
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.16
410 0.17
411 0.17
412 0.17
413 0.17
414 0.13
415 0.1
416 0.09
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.07
428 0.09
429 0.09
430 0.11
431 0.13
432 0.14
433 0.19
434 0.24
435 0.24
436 0.28
437 0.32
438 0.32
439 0.32
440 0.38
441 0.35
442 0.29
443 0.29
444 0.27
445 0.26
446 0.27
447 0.26
448 0.22
449 0.23
450 0.24
451 0.22
452 0.19
453 0.14
454 0.14
455 0.13
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.07
466 0.12
467 0.13
468 0.13
469 0.12
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.1
474 0.06
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.07
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.12
492 0.1
493 0.1
494 0.14
495 0.15
496 0.14
497 0.15
498 0.16
499 0.15
500 0.15
501 0.15
502 0.12
503 0.11
504 0.13
505 0.12
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.1
510 0.09
511 0.12
512 0.15
513 0.17
514 0.24
515 0.32
516 0.41
517 0.5
518 0.53
519 0.52
520 0.52
521 0.59
522 0.6
523 0.61
524 0.59
525 0.52
526 0.54
527 0.53
528 0.53
529 0.51
530 0.46
531 0.38
532 0.37
533 0.37
534 0.32
535 0.33
536 0.33
537 0.29
538 0.27
539 0.26
540 0.21
541 0.19
542 0.19
543 0.17
544 0.12
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.15
556 0.18
557 0.18
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.21
562 0.21
563 0.19
564 0.17
565 0.18
566 0.18
567 0.18
568 0.17
569 0.14
570 0.13
571 0.11
572 0.09
573 0.08
574 0.07
575 0.06
576 0.06
577 0.05
578 0.05
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.03
583 0.03
584 0.04
585 0.09
586 0.11
587 0.12
588 0.17
589 0.24
590 0.29
591 0.32
592 0.38
593 0.43
594 0.48
595 0.58
596 0.64
597 0.66
598 0.66
599 0.67
600 0.68
601 0.59
602 0.54
603 0.46
604 0.37
605 0.28
606 0.24
607 0.22
608 0.15
609 0.14
610 0.11
611 0.08
612 0.06
613 0.06
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.05
618 0.05
619 0.09
620 0.1
621 0.19
622 0.25
623 0.29
624 0.33
625 0.37
626 0.44
627 0.5
628 0.58
629 0.57
630 0.61
631 0.66
632 0.69
633 0.69
634 0.63
635 0.54
636 0.45
637 0.37
638 0.28
639 0.22
640 0.21
641 0.18
642 0.19
643 0.18
644 0.18
645 0.18
646 0.16
647 0.14
648 0.1
649 0.1
650 0.11
651 0.15
652 0.17
653 0.22
654 0.23
655 0.23
656 0.23
657 0.25
658 0.26
659 0.26
660 0.28
661 0.25
662 0.26
663 0.26
664 0.26
665 0.22
666 0.2
667 0.17
668 0.14
669 0.13
670 0.11
671 0.13
672 0.13
673 0.13
674 0.18
675 0.26
676 0.32
677 0.4
678 0.44
679 0.47
680 0.53
681 0.63
682 0.67
683 0.68
684 0.71
685 0.73
686 0.81
687 0.86
688 0.83
689 0.82
690 0.79
691 0.74
692 0.7
693 0.6
694 0.52
695 0.45
696 0.41
697 0.32
698 0.3
699 0.27
700 0.24
701 0.24
702 0.26
703 0.3
704 0.33
705 0.36
706 0.37
707 0.37
708 0.42
709 0.45
710 0.47
711 0.49
712 0.53
713 0.51
714 0.51
715 0.49
716 0.45
717 0.44
718 0.39
719 0.31
720 0.24
721 0.22
722 0.16
723 0.15
724 0.12
725 0.1
726 0.09
727 0.08
728 0.08
729 0.11
730 0.12
731 0.13
732 0.13
733 0.11
734 0.12
735 0.16
736 0.21
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.2
741 0.2
742 0.2
743 0.17
744 0.18
745 0.2
746 0.21
747 0.23
748 0.22
749 0.24
750 0.24
751 0.26
752 0.23
753 0.2
754 0.2
755 0.21
756 0.21
757 0.19
758 0.19
759 0.15
760 0.15
761 0.13
762 0.13
763 0.12
764 0.12
765 0.12
766 0.13
767 0.14
768 0.14
769 0.14
770 0.14
771 0.2
772 0.23
773 0.23
774 0.29
775 0.29
776 0.32
777 0.37
778 0.39
779 0.33
780 0.32
781 0.34
782 0.29
783 0.27
784 0.29
785 0.26
786 0.23
787 0.26
788 0.29
789 0.3
790 0.33
791 0.39
792 0.41
793 0.42
794 0.51
795 0.54
796 0.58
797 0.65
798 0.72
799 0.76
800 0.78
801 0.83
802 0.85
803 0.83
804 0.78
805 0.77
806 0.76
807 0.7
808 0.67
809 0.64
810 0.54
811 0.53
812 0.49
813 0.42
814 0.32
815 0.29
816 0.21
817 0.16
818 0.18
819 0.16
820 0.22
821 0.26
822 0.31
823 0.32
824 0.42
825 0.49
826 0.54
827 0.59
828 0.58
829 0.56
830 0.53
831 0.58
832 0.56
833 0.55
834 0.55
835 0.53
836 0.5
837 0.51
838 0.48
839 0.44
840 0.42
841 0.37
842 0.33
843 0.33
844 0.36
845 0.34
846 0.34
847 0.29
848 0.26
849 0.25
850 0.23
851 0.21
852 0.2
853 0.2
854 0.26
855 0.27
856 0.26
857 0.25
858 0.24
859 0.26
860 0.26
861 0.31
862 0.31
863 0.36
864 0.39
865 0.45
866 0.54
867 0.53
868 0.49
869 0.49
870 0.52
871 0.52
872 0.54
873 0.52
874 0.42
875 0.37
876 0.38
877 0.33
878 0.3
879 0.33
880 0.29
881 0.26
882 0.27
883 0.27
884 0.26
885 0.25
886 0.21
887 0.16
888 0.15
889 0.16
890 0.16
891 0.16
892 0.15
893 0.15
894 0.14
895 0.14
896 0.15
897 0.19
898 0.26
899 0.35
900 0.43
901 0.53
902 0.63
903 0.71
904 0.79
905 0.83
906 0.86
907 0.85
908 0.88
909 0.88
910 0.88
911 0.87
912 0.87
913 0.8
914 0.76
915 0.7
916 0.63
917 0.55
918 0.53
919 0.47
920 0.43
921 0.41
922 0.37
923 0.41
924 0.39
925 0.4
926 0.32
927 0.3
928 0.24
929 0.3
930 0.28
931 0.23
932 0.29
933 0.32
934 0.34
935 0.4
936 0.41
937 0.39
938 0.43
939 0.44
940 0.39
941 0.35
942 0.35
943 0.32
944 0.36
945 0.39
946 0.37
947 0.35
948 0.35
949 0.32
950 0.36
951 0.37
952 0.35
953 0.3
954 0.28
955 0.28
956 0.3
957 0.35
958 0.31
959 0.3
960 0.27
961 0.28
962 0.28
963 0.31
964 0.3
965 0.25
966 0.25
967 0.22
968 0.2
969 0.18