Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397SHF4

Protein Details
Accession A0A397SHF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-149DAFQYCKIRQQSKKNVGKQRNKTVLNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003923  TFIID_30kDa  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03540  TFIID_30kDa  
CDD cd07982  TAF10  
Amino Acid Sequences MEFDNDSDEQQIYNIDKGKGKEVETPEPVEEETHIPAESVEDTESSEEESTDISLSRKEEEFIRKDRSLLDFLLILDGFEPLIPDHVSEYYLSRSGASCDDIRVLVMRLMSLAAQKFVADIATDAFQYCKIRQQSKKNVGKQRNKTVLNLEDLAAALSEYGINVKKPDYYRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.26
4 0.28
5 0.35
6 0.35
7 0.35
8 0.38
9 0.4
10 0.45
11 0.44
12 0.45
13 0.39
14 0.37
15 0.35
16 0.28
17 0.24
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.14
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.08
28 0.07
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.17
47 0.23
48 0.28
49 0.31
50 0.37
51 0.36
52 0.36
53 0.37
54 0.35
55 0.3
56 0.26
57 0.21
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.12
62 0.09
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.03
69 0.04
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.09
114 0.12
115 0.12
116 0.19
117 0.25
118 0.34
119 0.43
120 0.53
121 0.62
122 0.7
123 0.8
124 0.81
125 0.85
126 0.87
127 0.89
128 0.88
129 0.88
130 0.86
131 0.79
132 0.73
133 0.71
134 0.64
135 0.59
136 0.5
137 0.39
138 0.3
139 0.28
140 0.24
141 0.16
142 0.12
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.19