Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T4T9

Protein Details
Accession A0A397T4T9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-210GRLNRAKRSLTKVSKKAKEKGSMCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
193-204KRSLTKVSKKAK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 4.499, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045242  Syntaxin  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15859  SNARE_SYN8  
Amino Acid Sequences MEKSSKLSVLADNTLVSIYERNRCRTENIEYPHEETINKNMEKLRFGVKELEGELSAAEESGTLSTKELKEREDTLIKLTKQIDKLEVLMQDNASARDLLLELNAMNKPSSKKSKKTVRFSDQPDDYDNAVVIQLQQRMMQNQDEDLDRLSDAIGRQRELGLMIGEELNYQVELLAETEDIVDRTDGRLNRAKRSLTKVSKKAKEKGSMCTIALLIFILVVIIIILS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.14
4 0.14
5 0.16
6 0.23
7 0.28
8 0.33
9 0.37
10 0.39
11 0.43
12 0.44
13 0.48
14 0.49
15 0.5
16 0.52
17 0.5
18 0.52
19 0.49
20 0.45
21 0.37
22 0.3
23 0.32
24 0.33
25 0.3
26 0.3
27 0.32
28 0.33
29 0.35
30 0.35
31 0.36
32 0.29
33 0.31
34 0.33
35 0.3
36 0.3
37 0.29
38 0.28
39 0.2
40 0.18
41 0.16
42 0.11
43 0.1
44 0.07
45 0.06
46 0.04
47 0.04
48 0.05
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.1
53 0.12
54 0.17
55 0.18
56 0.2
57 0.22
58 0.25
59 0.3
60 0.29
61 0.29
62 0.28
63 0.34
64 0.32
65 0.33
66 0.32
67 0.32
68 0.31
69 0.32
70 0.29
71 0.23
72 0.25
73 0.23
74 0.22
75 0.19
76 0.17
77 0.15
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.09
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.11
96 0.16
97 0.27
98 0.31
99 0.36
100 0.45
101 0.56
102 0.63
103 0.71
104 0.75
105 0.72
106 0.74
107 0.74
108 0.73
109 0.64
110 0.56
111 0.49
112 0.41
113 0.34
114 0.26
115 0.2
116 0.12
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.14
173 0.15
174 0.2
175 0.28
176 0.3
177 0.38
178 0.44
179 0.48
180 0.49
181 0.56
182 0.61
183 0.64
184 0.71
185 0.73
186 0.77
187 0.81
188 0.83
189 0.83
190 0.81
191 0.8
192 0.73
193 0.72
194 0.7
195 0.65
196 0.57
197 0.51
198 0.42
199 0.32
200 0.29
201 0.21
202 0.12
203 0.07
204 0.06
205 0.04
206 0.03
207 0.03