Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXF1

Protein Details
Accession C4QXF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-248TEMKIEETKNERRDRKRREGLAKQEALMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-253ERRDRKRREGLAKQEALMKEKGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, cyto 4, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003827  tRNA_yW-synthesising  
IPR036602  tRNA_yW-synthesising-like_sf  
Gene Ontology GO:0008175  F:tRNA methyltransferase activity  
GO:0031591  P:wybutosine biosynthetic process  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0655  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02676  TYW3  
Amino Acid Sequences MLDSFDQKKAQILAEIATTNEANPDLSPKGTIDELCLPIMNSINSHSDMITTSSCSGRVSVFLEGDKKGNSKIGAKGDGGHWLFVTHDKRQVSRWWKNIDFECQIEKSNFKPSRFVLFKFEPLILHVKCRDLTTAQKLYQTAMSCGFRESGIGVNNIVGIRISIKLDIPIGYLNEEGKCVLLVDENYLEFIDNQAINRFNENESKLNLLHRKISDMMFATTEMKIEETKNERRDRKRREGLAKQEALMKEKGKKLEMGQNEEPEDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.15
15 0.14
16 0.16
17 0.18
18 0.17
19 0.18
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.21
27 0.17
28 0.12
29 0.13
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.16
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.19
58 0.21
59 0.25
60 0.28
61 0.29
62 0.29
63 0.29
64 0.26
65 0.32
66 0.28
67 0.23
68 0.18
69 0.15
70 0.15
71 0.2
72 0.23
73 0.18
74 0.23
75 0.24
76 0.25
77 0.28
78 0.36
79 0.4
80 0.45
81 0.5
82 0.52
83 0.53
84 0.57
85 0.57
86 0.54
87 0.47
88 0.4
89 0.36
90 0.29
91 0.29
92 0.24
93 0.23
94 0.19
95 0.27
96 0.3
97 0.27
98 0.3
99 0.3
100 0.39
101 0.4
102 0.4
103 0.36
104 0.33
105 0.35
106 0.32
107 0.31
108 0.22
109 0.21
110 0.25
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.14
119 0.18
120 0.22
121 0.26
122 0.26
123 0.27
124 0.26
125 0.26
126 0.27
127 0.23
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.12
182 0.14
183 0.15
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.23
188 0.25
189 0.25
190 0.25
191 0.27
192 0.25
193 0.31
194 0.35
195 0.31
196 0.34
197 0.32
198 0.34
199 0.34
200 0.34
201 0.3
202 0.27
203 0.26
204 0.21
205 0.21
206 0.19
207 0.17
208 0.16
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.18
214 0.23
215 0.32
216 0.41
217 0.5
218 0.58
219 0.68
220 0.77
221 0.8
222 0.84
223 0.86
224 0.87
225 0.88
226 0.89
227 0.89
228 0.89
229 0.81
230 0.71
231 0.68
232 0.6
233 0.54
234 0.48
235 0.43
236 0.4
237 0.43
238 0.46
239 0.42
240 0.44
241 0.46
242 0.5
243 0.52
244 0.54
245 0.55
246 0.56