Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SX80

Protein Details
Accession A0A397SX80    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-129LDSKLFQKHKFRKVRGEQLTIHydrophilic
470-489SDPIRLTKRLSRRINRIINQHydrophilic
524-545VSTKIKLRVKRRVDEDHERRVKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041070  JHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR047578  OBE1-like_PHD  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140680  F:histone H3K36me/H3K36me2 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17811  JHD  
PF02373  JmjC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15612  PHD_OBE1_like  
Amino Acid Sequences MSQVMDTLGEKCPLCANKQRLVPLWFQENTETWIKCDICNVWCHASCLKLPSEECDRIDEYHCPECTRTHGPSIYKVGIRKSQREHSKVNYADLENGLTGNPYKWKRVLDSKLFQKHKFRKVRGEQLTIDWVRWFGLEEPIIIENPDGLDMKMPHKDITVSDIADAVGYDTLVDVIDVSTQQEIPDWNMYKWATYFDGPKRDQVLNVISLEVSDTPFGNSIMRPRIVRELDWVENMWPNKKNVEYPKVQLYCLMSIKDSFTDFHIDFGGSSVFYHVIKGSKVFYFVPPTPSNLKKYSRWISSPEQSMTFFADLVKDCYEVKLVAGNTMIIPTGWIHAVYTPDDSIVIGGNFLHGFNIGIQLAVYDIEKRTNVPIKYRFPYFEKMSWYAGKYYNKILKGNKRLFRNSDFSRYYINDTNFLDDSLSLSQWELKGIVELALFLLNFTGRLESNSEATTEERQLIKDNIPGEVSDPIRLTKRLSRRINRIINQGNMDFDEESEDQKVNLKSCKKDHDDNPGSLRDNSVSTKIKLRVKRRVDEDHERRVKWAKTSSSVPPRPPPYNYSIYSYDENDRESSTSPTPEEIARVEQIIKEKIREFELENRKKNYKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.39
3 0.43
4 0.47
5 0.53
6 0.58
7 0.58
8 0.59
9 0.59
10 0.54
11 0.55
12 0.49
13 0.45
14 0.42
15 0.37
16 0.37
17 0.38
18 0.33
19 0.27
20 0.33
21 0.32
22 0.29
23 0.32
24 0.32
25 0.28
26 0.32
27 0.35
28 0.35
29 0.36
30 0.39
31 0.36
32 0.35
33 0.34
34 0.34
35 0.32
36 0.3
37 0.3
38 0.32
39 0.38
40 0.4
41 0.38
42 0.39
43 0.38
44 0.36
45 0.38
46 0.38
47 0.35
48 0.37
49 0.37
50 0.34
51 0.34
52 0.33
53 0.37
54 0.38
55 0.37
56 0.37
57 0.41
58 0.42
59 0.47
60 0.51
61 0.49
62 0.47
63 0.46
64 0.45
65 0.47
66 0.51
67 0.53
68 0.54
69 0.59
70 0.65
71 0.68
72 0.69
73 0.67
74 0.71
75 0.65
76 0.62
77 0.58
78 0.49
79 0.45
80 0.39
81 0.34
82 0.24
83 0.22
84 0.17
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.18
89 0.19
90 0.23
91 0.27
92 0.3
93 0.36
94 0.45
95 0.53
96 0.54
97 0.61
98 0.66
99 0.73
100 0.76
101 0.75
102 0.76
103 0.76
104 0.77
105 0.79
106 0.76
107 0.76
108 0.8
109 0.85
110 0.82
111 0.79
112 0.7
113 0.63
114 0.65
115 0.55
116 0.46
117 0.35
118 0.28
119 0.21
120 0.19
121 0.17
122 0.1
123 0.14
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.13
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.1
137 0.12
138 0.15
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.19
143 0.2
144 0.17
145 0.21
146 0.21
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.08
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.16
173 0.18
174 0.17
175 0.21
176 0.21
177 0.21
178 0.21
179 0.21
180 0.16
181 0.16
182 0.23
183 0.24
184 0.33
185 0.33
186 0.36
187 0.38
188 0.37
189 0.36
190 0.33
191 0.3
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.11
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.12
208 0.16
209 0.18
210 0.18
211 0.19
212 0.26
213 0.27
214 0.27
215 0.27
216 0.28
217 0.28
218 0.29
219 0.27
220 0.21
221 0.23
222 0.24
223 0.23
224 0.2
225 0.2
226 0.21
227 0.22
228 0.27
229 0.32
230 0.37
231 0.36
232 0.37
233 0.45
234 0.44
235 0.42
236 0.38
237 0.32
238 0.29
239 0.27
240 0.25
241 0.16
242 0.15
243 0.16
244 0.15
245 0.13
246 0.1
247 0.1
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.17
272 0.18
273 0.23
274 0.22
275 0.25
276 0.28
277 0.31
278 0.33
279 0.33
280 0.36
281 0.33
282 0.41
283 0.44
284 0.42
285 0.41
286 0.42
287 0.43
288 0.44
289 0.44
290 0.37
291 0.32
292 0.29
293 0.27
294 0.23
295 0.18
296 0.13
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.04
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.13
357 0.19
358 0.21
359 0.27
360 0.34
361 0.39
362 0.42
363 0.44
364 0.43
365 0.4
366 0.46
367 0.43
368 0.39
369 0.38
370 0.37
371 0.38
372 0.38
373 0.34
374 0.31
375 0.33
376 0.33
377 0.29
378 0.34
379 0.36
380 0.36
381 0.4
382 0.45
383 0.48
384 0.55
385 0.62
386 0.61
387 0.62
388 0.65
389 0.66
390 0.63
391 0.62
392 0.56
393 0.56
394 0.52
395 0.46
396 0.45
397 0.41
398 0.41
399 0.39
400 0.36
401 0.31
402 0.29
403 0.31
404 0.27
405 0.25
406 0.2
407 0.14
408 0.15
409 0.12
410 0.11
411 0.08
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.08
434 0.1
435 0.11
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.13
440 0.15
441 0.17
442 0.15
443 0.18
444 0.17
445 0.17
446 0.21
447 0.22
448 0.22
449 0.23
450 0.22
451 0.2
452 0.19
453 0.19
454 0.16
455 0.19
456 0.17
457 0.16
458 0.16
459 0.17
460 0.2
461 0.21
462 0.24
463 0.27
464 0.36
465 0.44
466 0.54
467 0.6
468 0.67
469 0.77
470 0.83
471 0.8
472 0.8
473 0.76
474 0.71
475 0.66
476 0.57
477 0.48
478 0.39
479 0.35
480 0.25
481 0.19
482 0.19
483 0.16
484 0.16
485 0.17
486 0.16
487 0.14
488 0.21
489 0.23
490 0.22
491 0.29
492 0.34
493 0.39
494 0.46
495 0.55
496 0.56
497 0.62
498 0.65
499 0.69
500 0.69
501 0.67
502 0.65
503 0.61
504 0.57
505 0.48
506 0.44
507 0.34
508 0.3
509 0.28
510 0.3
511 0.29
512 0.28
513 0.36
514 0.41
515 0.48
516 0.54
517 0.61
518 0.64
519 0.69
520 0.75
521 0.75
522 0.78
523 0.79
524 0.81
525 0.8
526 0.81
527 0.8
528 0.71
529 0.68
530 0.66
531 0.61
532 0.57
533 0.57
534 0.52
535 0.5
536 0.54
537 0.6
538 0.63
539 0.66
540 0.65
541 0.66
542 0.67
543 0.68
544 0.67
545 0.63
546 0.59
547 0.59
548 0.55
549 0.52
550 0.48
551 0.47
552 0.46
553 0.43
554 0.42
555 0.37
556 0.37
557 0.32
558 0.3
559 0.27
560 0.26
561 0.28
562 0.25
563 0.27
564 0.26
565 0.26
566 0.27
567 0.26
568 0.27
569 0.24
570 0.24
571 0.22
572 0.23
573 0.22
574 0.23
575 0.28
576 0.33
577 0.33
578 0.34
579 0.36
580 0.37
581 0.39
582 0.4
583 0.38
584 0.42
585 0.5
586 0.56
587 0.6
588 0.64