Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SMH0

Protein Details
Accession A0A397SMH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-235MQHPIKEKSKLVKSKRNKSKVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-235EKSKLVKSKRNKSKVG
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
IPR001876  Znf_RanBP2  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
PS01358  ZF_RANBP2_1  
CDD cd00118  LysM  
cd14273  UBA_TAP-C_like  
Amino Acid Sequences MQNKSCLICHVLFASVSLIETPFLTKCCNRWICDNCLEQNQRFYTYCPFCQEITFTYNKRNDNISNNTLPTYEEVIYNDLNELNNSLKLNSVNEKLNKKLDEKSNYGAIHYVKKDDTLIGLAFKYGIEIVDIRKANRLFDDNIIARSTLIIPNYVGPSLSEKLSEEEEKKMLVKRFQIQSKCIDPIEARFYMEQSNYNIENATQLYRDDILWEMQHPIKEKSKLVKSKRNKSKVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.15
12 0.17
13 0.2
14 0.3
15 0.35
16 0.36
17 0.44
18 0.49
19 0.52
20 0.56
21 0.59
22 0.52
23 0.56
24 0.59
25 0.51
26 0.53
27 0.47
28 0.45
29 0.4
30 0.39
31 0.39
32 0.38
33 0.39
34 0.37
35 0.37
36 0.33
37 0.34
38 0.33
39 0.27
40 0.26
41 0.29
42 0.25
43 0.31
44 0.36
45 0.37
46 0.37
47 0.39
48 0.39
49 0.41
50 0.47
51 0.44
52 0.42
53 0.41
54 0.39
55 0.35
56 0.31
57 0.25
58 0.22
59 0.16
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.2
80 0.26
81 0.29
82 0.3
83 0.34
84 0.35
85 0.34
86 0.37
87 0.4
88 0.4
89 0.4
90 0.39
91 0.41
92 0.38
93 0.36
94 0.32
95 0.26
96 0.25
97 0.22
98 0.21
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.2
124 0.22
125 0.18
126 0.19
127 0.24
128 0.2
129 0.21
130 0.2
131 0.19
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.17
151 0.2
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.21
157 0.26
158 0.27
159 0.27
160 0.31
161 0.36
162 0.43
163 0.5
164 0.53
165 0.5
166 0.52
167 0.52
168 0.5
169 0.42
170 0.37
171 0.3
172 0.3
173 0.33
174 0.27
175 0.25
176 0.22
177 0.23
178 0.24
179 0.24
180 0.22
181 0.19
182 0.23
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.18
187 0.19
188 0.18
189 0.17
190 0.13
191 0.12
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.18
201 0.2
202 0.23
203 0.25
204 0.3
205 0.35
206 0.39
207 0.44
208 0.49
209 0.56
210 0.63
211 0.7
212 0.75
213 0.78
214 0.84
215 0.89