FuNGI

A0A397SM31

Protein Details

Accession

A0A397SM31

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-24	ITFIRNTKSKCISRPNIRFNSKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito_nucl 13.333, mito 9.5, cyto_nucl 9.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MITFIRNTKSKCISRPNIRFNSKVYYSISFKRSNVNKLSPAQTRLFAYHNYSTAAEHAVSTAAPTVSSEINYHSPEPLNINNPLVILPQPRYTPREAGKILSNVFTEHIAVLRACLKIGEIERARNILSNLYKQCTSDTKKYLNIKLHNEFIEAYLEIKQINEALQWFDQLNYYGLTPDLATFAILIRGYLRLDLDFLGCSMLKILVKEAEECGYSFEQLIESNLLSDKEIEKVIHLLRTDPDSNKASKELMEKIENVIEKQKPVINEELNLVEPVSTESFGVKLMKSALSAIKERDLDLVKRQIKLEENALQAAMERWKHANEHRKEKFVNLQKNVLKKSMWKWHEKLVPLIREELERCKNKEILLTDRERISYGPFLQLLSAEKLSAITILELLRQNGGGGINEGMKTTRAVLSIGKAVENEYNSEQLKKKQNRNAFNKDLNVHELFASGKLFNMTIRRAAAKIEAKDMQTNWNPEWPITVRAKVGSILASMLLECATIPTTINGKESEEISMEAPAFYHSYIQHKGKRIGVIKLNPQLIQYLSKESVRDSVHPKMLPMLVHPRPWLTYNSGGYLTSPTYAMRSRDCPEQLAYLQKASEEGHLDRVFAGLDVLGSTCWIINKKVYKVVLEVWNKGEALGKIPSAELNLKMPDKPENCETETSLKIKWIKECKEIASKISNNHSERCTANYKVDIAGAFLNENMYFPHSLDFRGRAYPIPPLFNHLGNDLCRGLLLFKEAKPLGKNGLTWLKIQIANLAGNDKVSFEDRIKFTEDHLEDIKDSVKNPLDGRGWWKKAEDPWQCLAACFELQGALESADPEKYPSQIPIHQDGTCNGLQHYAALGGDLEGAKQVDLYPSDKPSDIYTSVAARINEMIAKTCSEPQDALDFSDMHSTRELAQILLGKISRKVVKQTVMTSVYGVTFIGARLQIESRLKEIEDIPQERVRELSFYVAKLVFNCLGEMFYGARAIQDWLVECAKRISKSVPSEIVLDQNSPEHRNEENFVNGNLQHSSNEHLMNNYEKELHETEKNNHDNLINKKRPIVKIPPSKPGQNQMTTVVWTTPLDLPIVQPYRKLSTRVVKTNLQNINIEDPNFPSPVNPIKQRQAFPPNFIHSLDATHMLMTALACKEKNLTFASVHDSFWTHACDVEVMNQIIRDQFIQLHEQPIMENLRNEFIERYKGYIVPVKVLREDFERLKLQKMKETKNNLITTKNNGYESILSLDELYKIIPNSQKNKNLKLQEFTNTLNTNNIIDLDNKATESLIDITEIDDLLDEDHDIEEEIEKKKKASKHIHIWVDLTFPKLPAKGEFKLSSIMESQYFFD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.83
3	0.85
4	0.86
5	0.85
6	0.8
7	0.73
8	0.72
9	0.63
10	0.57
11	0.51
12	0.46
13	0.46
14	0.5
15	0.53
16	0.49
17	0.48
18	0.53
19	0.56
20	0.59
21	0.61
22	0.61
23	0.62
24	0.62
25	0.69
26	0.65
27	0.64
28	0.58
29	0.53
30	0.49
31	0.45
32	0.41
33	0.37
34	0.37
35	0.36
36	0.34
37	0.33
38	0.31
39	0.29
40	0.27
41	0.26
42	0.2
43	0.15
44	0.14
45	0.12
46	0.11
47	0.11
48	0.12
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.12
53	0.12
54	0.14
55	0.14
56	0.16
57	0.2
58	0.24
59	0.24
60	0.25
61	0.25
62	0.26
63	0.3
64	0.31
65	0.31
66	0.31
67	0.31
68	0.28
69	0.27
70	0.26
71	0.22
72	0.21
73	0.2
74	0.2
75	0.23
76	0.27
77	0.31
78	0.36
79	0.39
80	0.44
81	0.44
82	0.5
83	0.48
84	0.47
85	0.49
86	0.5
87	0.47
88	0.42
89	0.37
90	0.29
91	0.28
92	0.25
93	0.2
94	0.15
95	0.14
96	0.12
97	0.12
98	0.13
99	0.15
100	0.15
101	0.14
102	0.13
103	0.13
104	0.17
105	0.19
106	0.27
107	0.26
108	0.3
109	0.33
110	0.35
111	0.35
112	0.32
113	0.31
114	0.29
115	0.31
116	0.35
117	0.37
118	0.39
119	0.4
120	0.37
121	0.41
122	0.43
123	0.45
124	0.46
125	0.49
126	0.5
127	0.57
128	0.65
129	0.68
130	0.68
131	0.69
132	0.68
133	0.66
134	0.66
135	0.59
136	0.52
137	0.45
138	0.37
139	0.32
140	0.23
141	0.19
142	0.16
143	0.15
144	0.14
145	0.13
146	0.12
147	0.11
148	0.11
149	0.12
150	0.1
151	0.14
152	0.14
153	0.15
154	0.15
155	0.15
156	0.15
157	0.15
158	0.15
159	0.12
160	0.12
161	0.11
162	0.1
163	0.1
164	0.09
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.08
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.09
180	0.11
181	0.11
182	0.11
183	0.1
184	0.1
185	0.11
186	0.1
187	0.09
188	0.09
189	0.11
190	0.11
191	0.11
192	0.13
193	0.15
194	0.16
195	0.18
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.17
200	0.19
201	0.16
202	0.15
203	0.14
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.13
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.17
221	0.19
222	0.21
223	0.2
224	0.2
225	0.2
226	0.26
227	0.29
228	0.26
229	0.3
230	0.3
231	0.32
232	0.32
233	0.32
234	0.27
235	0.26
236	0.29
237	0.29
238	0.3
239	0.31
240	0.3
241	0.3
242	0.34
243	0.31
244	0.28
245	0.3
246	0.27
247	0.25
248	0.27
249	0.28
250	0.24
251	0.27
252	0.33
253	0.27
254	0.26
255	0.27
256	0.26
257	0.24
258	0.23
259	0.19
260	0.12
261	0.11
262	0.12
263	0.11
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.11
269	0.12
270	0.1
271	0.1
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.15
276	0.17
277	0.18
278	0.21
279	0.21
280	0.24
281	0.24
282	0.24
283	0.27
284	0.27
285	0.26
286	0.29
287	0.37
288	0.36
289	0.38
290	0.39
291	0.38
292	0.39
293	0.39
294	0.39
295	0.35
296	0.34
297	0.32
298	0.31
299	0.26
300	0.22
301	0.21
302	0.19
303	0.14
304	0.14
305	0.15
306	0.17
307	0.21
308	0.29
309	0.37
310	0.41
311	0.52
312	0.55
313	0.6
314	0.59
315	0.6
316	0.62
317	0.61
318	0.62
319	0.55
320	0.59
321	0.57
322	0.63
323	0.61
324	0.54
325	0.45
326	0.42
327	0.46
328	0.47
329	0.49
330	0.5
331	0.5
332	0.56
333	0.6
334	0.56
335	0.57
336	0.54
337	0.53
338	0.46
339	0.46
340	0.38
341	0.35
342	0.35
343	0.35
344	0.36
345	0.37
346	0.39
347	0.41
348	0.42
349	0.39
350	0.43
351	0.39
352	0.37
353	0.39
354	0.4
355	0.38
356	0.38
357	0.37
358	0.32
359	0.29
360	0.25
361	0.22
362	0.19
363	0.19
364	0.18
365	0.18
366	0.17
367	0.18
368	0.17
369	0.15
370	0.14
371	0.11
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.08
377	0.05
378	0.06
379	0.06
380	0.1
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.11
402	0.13
403	0.16
404	0.16
405	0.14
406	0.13
407	0.14
408	0.15
409	0.15
410	0.16
411	0.13
412	0.17
413	0.17
414	0.21
415	0.22
416	0.27
417	0.37
418	0.43
419	0.51
420	0.56
421	0.64
422	0.71
423	0.78
424	0.8
425	0.77
426	0.73
427	0.68
428	0.62
429	0.55
430	0.49
431	0.4
432	0.32
433	0.24
434	0.2
435	0.15
436	0.14
437	0.13
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.09
443	0.12
444	0.12
445	0.14
446	0.15
447	0.16
448	0.16
449	0.17
450	0.22
451	0.24
452	0.24
453	0.26
454	0.27
455	0.27
456	0.29
457	0.29
458	0.29
459	0.28
460	0.3
461	0.26
462	0.28
463	0.27
464	0.24
465	0.27
466	0.22
467	0.24
468	0.23
469	0.24
470	0.2
471	0.21
472	0.21
473	0.18
474	0.17
475	0.12
476	0.1
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.08
491	0.09
492	0.11
493	0.11
494	0.12
495	0.12
496	0.13
497	0.13
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.08
504	0.08
505	0.07
506	0.07
507	0.06
508	0.08
509	0.08
510	0.13
511	0.18
512	0.24
513	0.29
514	0.34
515	0.37
516	0.38
517	0.44
518	0.42
519	0.43
520	0.44
521	0.43
522	0.44
523	0.46
524	0.44
525	0.38
526	0.35
527	0.31
528	0.25
529	0.24
530	0.18
531	0.16
532	0.16
533	0.17
534	0.17
535	0.16
536	0.21
537	0.19
538	0.22
539	0.23
540	0.27
541	0.3
542	0.3
543	0.29
544	0.26
545	0.26
546	0.23
547	0.2
548	0.24
549	0.22
550	0.24
551	0.24
552	0.23
553	0.22
554	0.24
555	0.23
556	0.18
557	0.21
558	0.2
559	0.22
560	0.21
561	0.2
562	0.19
563	0.18
564	0.14
565	0.1
566	0.09
567	0.07
568	0.09
569	0.11
570	0.13
571	0.14
572	0.17
573	0.19
574	0.24
575	0.25
576	0.25
577	0.23
578	0.24
579	0.23
580	0.24
581	0.23
582	0.18
583	0.17
584	0.15
585	0.15
586	0.13
587	0.14
588	0.11
589	0.11
590	0.16
591	0.17
592	0.17
593	0.15
594	0.15
595	0.13
596	0.1
597	0.1
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.05
607	0.06
608	0.07
609	0.11
610	0.16
611	0.17
612	0.22
613	0.22
614	0.22
615	0.22
616	0.26
617	0.3
618	0.28
619	0.29
620	0.25
621	0.26
622	0.25
623	0.23
624	0.21
625	0.13
626	0.13
627	0.12
628	0.11
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.09
633	0.1
634	0.08
635	0.09
636	0.11
637	0.12
638	0.12
639	0.13
640	0.18
641	0.18
642	0.2
643	0.22
644	0.23
645	0.24
646	0.25
647	0.26
648	0.23
649	0.24
650	0.23
651	0.2
652	0.19
653	0.22
654	0.23
655	0.27
656	0.31
657	0.33
658	0.37
659	0.39
660	0.39
661	0.42
662	0.41
663	0.38
664	0.36
665	0.35
666	0.33
667	0.36
668	0.4
669	0.34
670	0.36
671	0.34
672	0.3
673	0.28
674	0.3
675	0.28
676	0.23
677	0.23
678	0.21
679	0.21
680	0.19
681	0.19
682	0.14
683	0.11
684	0.1
685	0.08
686	0.07
687	0.06
688	0.06
689	0.05
690	0.06
691	0.05
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.08
696	0.08
697	0.09
698	0.11
699	0.12
700	0.12
701	0.14
702	0.14
703	0.14
704	0.14
705	0.2
706	0.2
707	0.21
708	0.19
709	0.22
710	0.23
711	0.24
712	0.23
713	0.18
714	0.19
715	0.16
716	0.18
717	0.14
718	0.12
719	0.1
720	0.09
721	0.09
722	0.07
723	0.09
724	0.09
725	0.09
726	0.15
727	0.16
728	0.18
729	0.18
730	0.19
731	0.2
732	0.2
733	0.19
734	0.18
735	0.24
736	0.24
737	0.23
738	0.23
739	0.23
740	0.23
741	0.22
742	0.2
743	0.16
744	0.15
745	0.15
746	0.14
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.08
751	0.07
752	0.08
753	0.09
754	0.1
755	0.15
756	0.15
757	0.17
758	0.2
759	0.2
760	0.19
761	0.26
762	0.25
763	0.23
764	0.24
765	0.23
766	0.19
767	0.2
768	0.21
769	0.13
770	0.13
771	0.15
772	0.15
773	0.17
774	0.17
775	0.22
776	0.2
777	0.21
778	0.28
779	0.32
780	0.33
781	0.32
782	0.32
783	0.3
784	0.34
785	0.43
786	0.42
787	0.38
788	0.38
789	0.41
790	0.39
791	0.36
792	0.32
793	0.23
794	0.17
795	0.12
796	0.1
797	0.06
798	0.06
799	0.07
800	0.06
801	0.05
802	0.06
803	0.06
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.08
808	0.08
809	0.09
810	0.1
811	0.13
812	0.16
813	0.19
814	0.23
815	0.26
816	0.29
817	0.28
818	0.29
819	0.26
820	0.27
821	0.24
822	0.21
823	0.16
824	0.14
825	0.13
826	0.12
827	0.12
828	0.07
829	0.06
830	0.06
831	0.06
832	0.04
833	0.05
834	0.05
835	0.05
836	0.05
837	0.05
838	0.05
839	0.05
840	0.05
841	0.06
842	0.07
843	0.09
844	0.11
845	0.13
846	0.15
847	0.15
848	0.16
849	0.16
850	0.18
851	0.18
852	0.17
853	0.16
854	0.16
855	0.18
856	0.2
857	0.18
858	0.15
859	0.14
860	0.14
861	0.14
862	0.12
863	0.12
864	0.1
865	0.11
866	0.12
867	0.15
868	0.16
869	0.16
870	0.16
871	0.15
872	0.19
873	0.18
874	0.17
875	0.16
876	0.14
877	0.13
878	0.21
879	0.2
880	0.17
881	0.17
882	0.17
883	0.16
884	0.2
885	0.19
886	0.11
887	0.13
888	0.15
889	0.15
890	0.16
891	0.16
892	0.14
893	0.15
894	0.19
895	0.21
896	0.19
897	0.25
898	0.28
899	0.32
900	0.35
901	0.36
902	0.38
903	0.37
904	0.35
905	0.3
906	0.26
907	0.2
908	0.17
909	0.14
910	0.08
911	0.06
912	0.05
913	0.07
914	0.06
915	0.06
916	0.08
917	0.09
918	0.13
919	0.16
920	0.18
921	0.18
922	0.19
923	0.19
924	0.19
925	0.19
926	0.21
927	0.25
928	0.26
929	0.29
930	0.31
931	0.31
932	0.29
933	0.3
934	0.23
935	0.17
936	0.16
937	0.18
938	0.17
939	0.16
940	0.19
941	0.19
942	0.19
943	0.18
944	0.21
945	0.16
946	0.15
947	0.15
948	0.12
949	0.11
950	0.11
951	0.11
952	0.09
953	0.07
954	0.08
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.08
959	0.08
960	0.08
961	0.09
962	0.11
963	0.14
964	0.14
965	0.14
966	0.17
967	0.2
968	0.2
969	0.22
970	0.22
971	0.28
972	0.33
973	0.38
974	0.37
975	0.34
976	0.36
977	0.35
978	0.36
979	0.29
980	0.24
981	0.19
982	0.2
983	0.21
984	0.2
985	0.21
986	0.19
987	0.2
988	0.22
989	0.24
990	0.23
991	0.26
992	0.25
993	0.25
994	0.25
995	0.23
996	0.22
997	0.21
998	0.19
999	0.15
1000	0.14
1001	0.17
1002	0.17
1003	0.19
1004	0.18
1005	0.18
1006	0.19
1007	0.22
1008	0.23
1009	0.2
1010	0.19
1011	0.17
1012	0.21
1013	0.22
1014	0.24
1015	0.26
1016	0.28
1017	0.33
1018	0.41
1019	0.44
1020	0.39
1021	0.39
1022	0.37
1023	0.39
1024	0.45
1025	0.51
1026	0.47
1027	0.45
1028	0.51
1029	0.56
1030	0.58
1031	0.59
1032	0.59
1033	0.58
1034	0.63
1035	0.67
1036	0.7
1037	0.67
1038	0.69
1039	0.66
1040	0.65
1041	0.62
1042	0.54
1043	0.51
1044	0.46
1045	0.43
1046	0.38
1047	0.35
1048	0.25
1049	0.2
1050	0.16
1051	0.17
1052	0.15
1053	0.14
1054	0.14
1055	0.13
1056	0.13
1057	0.2
1058	0.25
1059	0.23
1060	0.23
1061	0.26
1062	0.32
1063	0.35
1064	0.37
1065	0.37
1066	0.41
1067	0.5
1068	0.55
1069	0.57
1070	0.58
1071	0.6
1072	0.66
1073	0.63
1074	0.56
1075	0.5
1076	0.43
1077	0.45
1078	0.39
1079	0.36
1080	0.28
1081	0.26
1082	0.26
1083	0.24
1084	0.22
1085	0.16
1086	0.18
1087	0.25
1088	0.3
1089	0.33
1090	0.37
1091	0.46
1092	0.53
1093	0.55
1094	0.59
1095	0.62
1096	0.59
1097	0.58
1098	0.59
1099	0.55
1100	0.51
1101	0.49
1102	0.43
1103	0.32
1104	0.31
1105	0.27
1106	0.22
1107	0.17
1108	0.15
1109	0.14
1110	0.12
1111	0.12
1112	0.1
1113	0.12
1114	0.11
1115	0.13
1116	0.13
1117	0.14
1118	0.18
1119	0.18
1120	0.22
1121	0.21
1122	0.23
1123	0.21
1124	0.23
1125	0.29
1126	0.27
1127	0.26
1128	0.23
1129	0.22
1130	0.2
1131	0.21
1132	0.23
1133	0.16
1134	0.15
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.14
1138	0.18
1139	0.21
1140	0.18
1141	0.19
1142	0.18
1143	0.18
1144	0.18
1145	0.18
1146	0.14
1147	0.11
1148	0.13
1149	0.14
1150	0.21
1151	0.21
1152	0.24
1153	0.24
1154	0.23
1155	0.22
1156	0.24
1157	0.27
1158	0.22
1159	0.23
1160	0.22
1161	0.25
1162	0.25
1163	0.26
1164	0.25
1165	0.22
1166	0.28
1167	0.26
1168	0.29
1169	0.27
1170	0.28
1171	0.3
1172	0.34
1173	0.33
1174	0.32
1175	0.35
1176	0.34
1177	0.35
1178	0.35
1179	0.34
1180	0.32
1181	0.36
1182	0.32
1183	0.35
1184	0.39
1185	0.37
1186	0.45
1187	0.5
1188	0.49
1189	0.51
1190	0.57
1191	0.6
1192	0.62
1193	0.7
1194	0.7
1195	0.73
1196	0.76
1197	0.7
1198	0.68
1199	0.62
1200	0.61
1201	0.6
1202	0.55
1203	0.47
1204	0.41
1205	0.42
1206	0.36
1207	0.35
1208	0.3
1209	0.22
1210	0.18
1211	0.17
1212	0.17
1213	0.15
1214	0.13
1215	0.12
1216	0.11
1217	0.12
1218	0.17
1219	0.22
1220	0.3
1221	0.37
1222	0.46
1223	0.55
1224	0.6
1225	0.67
1226	0.71
1227	0.75
1228	0.72
1229	0.71
1230	0.66
1231	0.63
1232	0.6
1233	0.55
1234	0.54
1235	0.46
1236	0.41
1237	0.38
1238	0.35
1239	0.28
1240	0.25
1241	0.23
1242	0.16
1243	0.16
1244	0.18
1245	0.19
1246	0.18
1247	0.18
1248	0.17
1249	0.16
1250	0.14
1251	0.16
1252	0.15
1253	0.11
1254	0.11
1255	0.11
1256	0.11
1257	0.12
1258	0.12
1259	0.09
1260	0.07
1261	0.07
1262	0.07
1263	0.07
1264	0.07
1265	0.07
1266	0.07
1267	0.07
1268	0.08
1269	0.08
1270	0.1
1271	0.14
1272	0.19
1273	0.25
1274	0.26
1275	0.28
1276	0.35
1277	0.4
1278	0.48
1279	0.54
1280	0.6
1281	0.65
1282	0.74
1283	0.79
1284	0.75
1285	0.71
1286	0.62
1287	0.57
1288	0.48
1289	0.41
1290	0.32
1291	0.26
1292	0.27
1293	0.27
1294	0.28
1295	0.29
1296	0.35
1297	0.35
1298	0.41
1299	0.42
1300	0.4
1301	0.43
1302	0.42
1303	0.37
1304	0.33
1305	0.32
1306	0.26

A0A397SM31

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer