Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A397TPD5

Protein Details
Accession A0A397TPD5    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-217EQPPPPRPIKKARKNMNEGRQFIHydrophilic
278-300QGKIKFISTKQPLKKENNDTNETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-208RPIKKARK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036647  GTF2I-like_rpt_sf  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MVTLSAEQQQKLRDIAKARKEENERLALEMEVPIDQIELFLGRATVQRIEKSRDISGFDLFKKDWYKSNPGNNPLKSNHLVSAAWKEVSSEQKQVYHELAVKQNTKPPTLNPSASTRTNERRGFMNDMKKLADMLSLKCGVESFIVLSSRIPGENFGEITGSDKGLLAAEDLRWTQSFLEFGLKIQNNEIGDREEQPPPPRPIKKARKNMNEGRQFIAHRMKELYREIVGYGVVPYSNWETEKHKLEIDIVGWPEGMPFTAHAFKRDQMQEIINALEQGKIKFISTKQPLKKENNDTNETKMAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.45
3 0.51
4 0.57
5 0.57
6 0.62
7 0.66
8 0.69
9 0.67
10 0.66
11 0.57
12 0.51
13 0.49
14 0.4
15 0.34
16 0.26
17 0.2
18 0.12
19 0.11
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.09
31 0.11
32 0.16
33 0.18
34 0.23
35 0.28
36 0.34
37 0.37
38 0.4
39 0.42
40 0.39
41 0.4
42 0.36
43 0.36
44 0.34
45 0.31
46 0.31
47 0.27
48 0.3
49 0.3
50 0.3
51 0.32
52 0.34
53 0.42
54 0.45
55 0.55
56 0.58
57 0.63
58 0.7
59 0.65
60 0.65
61 0.58
62 0.57
63 0.49
64 0.44
65 0.37
66 0.3
67 0.28
68 0.25
69 0.28
70 0.24
71 0.22
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.26
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.29
80 0.3
81 0.32
82 0.29
83 0.25
84 0.25
85 0.25
86 0.28
87 0.29
88 0.31
89 0.3
90 0.34
91 0.34
92 0.33
93 0.31
94 0.28
95 0.31
96 0.33
97 0.33
98 0.3
99 0.34
100 0.36
101 0.37
102 0.37
103 0.36
104 0.37
105 0.44
106 0.44
107 0.39
108 0.39
109 0.4
110 0.45
111 0.45
112 0.46
113 0.4
114 0.4
115 0.39
116 0.35
117 0.31
118 0.24
119 0.22
120 0.15
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.14
126 0.14
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.18
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.2
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.13
178 0.14
179 0.16
180 0.18
181 0.19
182 0.21
183 0.25
184 0.31
185 0.34
186 0.42
187 0.43
188 0.46
189 0.54
190 0.63
191 0.69
192 0.72
193 0.77
194 0.78
195 0.83
196 0.86
197 0.85
198 0.83
199 0.75
200 0.68
201 0.62
202 0.52
203 0.49
204 0.48
205 0.38
206 0.32
207 0.33
208 0.31
209 0.31
210 0.33
211 0.31
212 0.23
213 0.23
214 0.21
215 0.18
216 0.17
217 0.13
218 0.11
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.08
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.19
228 0.26
229 0.32
230 0.31
231 0.29
232 0.28
233 0.29
234 0.29
235 0.25
236 0.24
237 0.19
238 0.18
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.12
243 0.11
244 0.07
245 0.07
246 0.11
247 0.18
248 0.19
249 0.21
250 0.24
251 0.25
252 0.34
253 0.36
254 0.35
255 0.31
256 0.33
257 0.33
258 0.32
259 0.32
260 0.24
261 0.22
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.21
270 0.23
271 0.3
272 0.37
273 0.47
274 0.53
275 0.62
276 0.7
277 0.74
278 0.81
279 0.81
280 0.82
281 0.8
282 0.79
283 0.72
284 0.7