Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TBX2

Protein Details
Accession A0A397TBX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-357PHFRWIKYLTAIRRRRRNRRSNRQSRIVELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-347RRRRRNRRS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 8.5, mito 5, cyto 2.5, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16454  RING-H2_PA-TM-RING  
Amino Acid Sequences MSNNQVVVVIRNKSLVEPPVKVNSPIQTSNSNENKVLATYQTAMIVLYAVSGVVLGLFFIVVITNIIKNRLNAPTPQTNQGQDPTSRPRRGIARSVLESFPVFFFTMGMKDDDNKKENDDLEKGKAKELESDIELETISSDVMKSAPQAEETKDKENSLDISSKSSDNTSETNNNNDDNSSKSSQESNPDLPKNPPIAHIKDSSRSRSISTASNISAALTNNKVQEGQLTCPICLDDFESGEELRLLPCQHRYHTLCIDPWLLDISPLCPMCKTDYTSWESEVNATQHNQDSSGSSSAELAGNSNYMTNNENRRDSSVASSISHNFPHFRWIKYLTAIRRRRRNRRSNRQSRIVELANNNNNNNNNLLSQQDNNVVGTVITD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.31
4 0.32
5 0.36
6 0.42
7 0.44
8 0.44
9 0.43
10 0.42
11 0.43
12 0.43
13 0.41
14 0.39
15 0.42
16 0.5
17 0.52
18 0.5
19 0.44
20 0.42
21 0.4
22 0.34
23 0.31
24 0.22
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.11
33 0.08
34 0.06
35 0.05
36 0.04
37 0.03
38 0.03
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.02
43 0.02
44 0.02
45 0.02
46 0.03
47 0.03
48 0.03
49 0.04
50 0.05
51 0.08
52 0.09
53 0.13
54 0.15
55 0.16
56 0.21
57 0.25
58 0.27
59 0.28
60 0.34
61 0.4
62 0.42
63 0.46
64 0.45
65 0.42
66 0.42
67 0.42
68 0.39
69 0.31
70 0.34
71 0.39
72 0.45
73 0.45
74 0.43
75 0.45
76 0.49
77 0.52
78 0.55
79 0.52
80 0.5
81 0.51
82 0.54
83 0.49
84 0.43
85 0.37
86 0.3
87 0.23
88 0.17
89 0.14
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.1
97 0.13
98 0.2
99 0.26
100 0.28
101 0.27
102 0.28
103 0.31
104 0.32
105 0.33
106 0.31
107 0.29
108 0.32
109 0.38
110 0.36
111 0.35
112 0.36
113 0.32
114 0.32
115 0.31
116 0.27
117 0.21
118 0.23
119 0.2
120 0.17
121 0.17
122 0.11
123 0.09
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.07
133 0.08
134 0.1
135 0.12
136 0.14
137 0.21
138 0.24
139 0.28
140 0.27
141 0.27
142 0.25
143 0.24
144 0.24
145 0.19
146 0.2
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.18
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.2
158 0.2
159 0.23
160 0.24
161 0.24
162 0.22
163 0.21
164 0.18
165 0.15
166 0.19
167 0.16
168 0.16
169 0.16
170 0.19
171 0.2
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.29
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.32
180 0.3
181 0.26
182 0.26
183 0.26
184 0.28
185 0.29
186 0.32
187 0.3
188 0.34
189 0.37
190 0.37
191 0.34
192 0.31
193 0.3
194 0.28
195 0.28
196 0.25
197 0.23
198 0.22
199 0.19
200 0.19
201 0.18
202 0.16
203 0.16
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.2
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.2
220 0.15
221 0.13
222 0.13
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.16
236 0.19
237 0.2
238 0.28
239 0.31
240 0.35
241 0.39
242 0.4
243 0.35
244 0.34
245 0.34
246 0.26
247 0.23
248 0.19
249 0.15
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.13
258 0.17
259 0.2
260 0.24
261 0.23
262 0.28
263 0.33
264 0.34
265 0.35
266 0.32
267 0.29
268 0.26
269 0.26
270 0.21
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.2
275 0.2
276 0.19
277 0.16
278 0.17
279 0.18
280 0.18
281 0.16
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.12
295 0.17
296 0.25
297 0.3
298 0.33
299 0.34
300 0.37
301 0.38
302 0.38
303 0.37
304 0.33
305 0.3
306 0.28
307 0.3
308 0.29
309 0.3
310 0.31
311 0.27
312 0.25
313 0.23
314 0.31
315 0.32
316 0.31
317 0.34
318 0.35
319 0.37
320 0.42
321 0.49
322 0.49
323 0.56
324 0.63
325 0.67
326 0.74
327 0.81
328 0.85
329 0.89
330 0.9
331 0.91
332 0.93
333 0.95
334 0.96
335 0.95
336 0.94
337 0.88
338 0.82
339 0.78
340 0.71
341 0.66
342 0.61
343 0.61
344 0.59
345 0.59
346 0.55
347 0.53
348 0.52
349 0.46
350 0.42
351 0.34
352 0.27
353 0.23
354 0.25
355 0.23
356 0.22
357 0.24
358 0.27
359 0.26
360 0.25
361 0.24
362 0.21