Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T3W5

Protein Details
Accession A0A397T3W5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-90IKSPDTTRRAKKLKKANKIKRPRPQNAWILYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-83RRAKKLKKANKIKRPRP
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MANQGIYVFNVNQDSPPLPTSPLPSFFDTNNPTINFDLENDMKVFSAAQHELTIELDTLIKSPDTTRRAKKLKKANKIKRPRPQNAWILYRKDTNARLRESRKDFVKLKSCERSKIISKMWKEENVIVKNKFYVIAKWAEHELNKDYEYLEYLSRSSGERRISSPFDSNLSNLSSPSSNEWFEFNCSNTVSTNNTFIFPDLNSIESNDMIEYGFNQPTITNFAFDSTSVDIPINLTAEETALAPNSDVYLTVDCDVNYINSLDEILY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.21
7 0.26
8 0.27
9 0.31
10 0.32
11 0.34
12 0.35
13 0.33
14 0.4
15 0.38
16 0.36
17 0.37
18 0.34
19 0.32
20 0.31
21 0.31
22 0.24
23 0.2
24 0.24
25 0.19
26 0.2
27 0.18
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.14
32 0.09
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.1
50 0.18
51 0.22
52 0.3
53 0.37
54 0.46
55 0.56
56 0.63
57 0.69
58 0.73
59 0.77
60 0.8
61 0.85
62 0.85
63 0.86
64 0.9
65 0.92
66 0.9
67 0.91
68 0.88
69 0.85
70 0.82
71 0.8
72 0.76
73 0.74
74 0.7
75 0.64
76 0.58
77 0.52
78 0.46
79 0.42
80 0.42
81 0.42
82 0.42
83 0.42
84 0.48
85 0.5
86 0.57
87 0.58
88 0.57
89 0.53
90 0.54
91 0.53
92 0.52
93 0.57
94 0.52
95 0.53
96 0.57
97 0.55
98 0.52
99 0.51
100 0.49
101 0.44
102 0.47
103 0.46
104 0.43
105 0.43
106 0.45
107 0.45
108 0.43
109 0.4
110 0.38
111 0.4
112 0.38
113 0.41
114 0.36
115 0.33
116 0.3
117 0.28
118 0.25
119 0.17
120 0.13
121 0.11
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.17
126 0.17
127 0.17
128 0.18
129 0.17
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.17
146 0.18
147 0.2
148 0.24
149 0.26
150 0.28
151 0.29
152 0.25
153 0.24
154 0.23
155 0.22
156 0.19
157 0.18
158 0.16
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.15
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.19
170 0.2
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.18
184 0.18
185 0.14
186 0.16
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.09
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.19
206 0.17
207 0.15
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.18
213 0.15
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.12
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.11
247 0.09