Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SMM9

Protein Details
Accession A0A397SMM9    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-54ISRSNSFKLKKADSQRRKEKRRSKLWYEKTTNSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-44LKKADSQRRKEKRRSK
155-170REAKEREKLEKQKAEK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034186  PIN4-like_RRM  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12253  RRM_PIN4_like  
Amino Acid Sequences MGDDVEFSFDETFEVDSDHSISRSNSFKLKKADSQRRKEKRRSKLWYEKTTNSAAQSDSEASVGAQETIPTAIVIKNIPFSIKRDALLATLNNLDIPKPYAFNYHFDNGVFRGLAFANYRTPEDTDLVVSALNGYEVAGRKLRVEYKRVLPAAEREAKEREKLEKQKAEKEKGEHEPLTIKTDNDLLDKPKTEKSDNGKNDKEKRESIVKSPAPDQLDLNDPETLKFYDQVIIFRDDKSREELVFPKSLSSAHRRTLLLIAHKLQLYYYNEGEGEDRILKIVRKPASAAINIKAPRNGSFGRRTAAQLLANASLSESPSNRSLRGDASPLSRSPFSRKSWLNDGTPIVFPIRQPRGPDPSQNFAYRPSRLHASAIPFGVPDDDVTSTNFSEHRRSGLFDVHAPTFQSIAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.15
8 0.16
9 0.19
10 0.24
11 0.26
12 0.32
13 0.35
14 0.42
15 0.48
16 0.54
17 0.58
18 0.65
19 0.73
20 0.75
21 0.81
22 0.85
23 0.88
24 0.92
25 0.93
26 0.92
27 0.92
28 0.92
29 0.91
30 0.91
31 0.91
32 0.91
33 0.91
34 0.89
35 0.84
36 0.77
37 0.73
38 0.65
39 0.56
40 0.48
41 0.38
42 0.31
43 0.28
44 0.25
45 0.2
46 0.17
47 0.14
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.1
52 0.08
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.16
66 0.16
67 0.19
68 0.26
69 0.26
70 0.26
71 0.25
72 0.25
73 0.24
74 0.26
75 0.23
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.1
83 0.13
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.2
88 0.22
89 0.24
90 0.28
91 0.27
92 0.27
93 0.26
94 0.27
95 0.21
96 0.2
97 0.17
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.17
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.06
123 0.07
124 0.09
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.16
129 0.24
130 0.25
131 0.29
132 0.32
133 0.37
134 0.44
135 0.43
136 0.41
137 0.35
138 0.35
139 0.38
140 0.4
141 0.34
142 0.3
143 0.34
144 0.35
145 0.37
146 0.35
147 0.34
148 0.36
149 0.44
150 0.5
151 0.52
152 0.55
153 0.61
154 0.67
155 0.68
156 0.63
157 0.58
158 0.55
159 0.54
160 0.56
161 0.47
162 0.39
163 0.37
164 0.33
165 0.35
166 0.3
167 0.23
168 0.18
169 0.2
170 0.2
171 0.18
172 0.18
173 0.15
174 0.17
175 0.18
176 0.2
177 0.22
178 0.24
179 0.23
180 0.28
181 0.32
182 0.4
183 0.45
184 0.5
185 0.52
186 0.56
187 0.63
188 0.63
189 0.61
190 0.52
191 0.49
192 0.5
193 0.46
194 0.43
195 0.44
196 0.39
197 0.37
198 0.37
199 0.38
200 0.31
201 0.3
202 0.26
203 0.18
204 0.21
205 0.2
206 0.19
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.15
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.19
224 0.2
225 0.23
226 0.23
227 0.19
228 0.22
229 0.25
230 0.25
231 0.26
232 0.25
233 0.21
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.24
238 0.25
239 0.25
240 0.3
241 0.29
242 0.31
243 0.33
244 0.33
245 0.31
246 0.3
247 0.29
248 0.27
249 0.27
250 0.25
251 0.21
252 0.24
253 0.22
254 0.22
255 0.21
256 0.19
257 0.18
258 0.19
259 0.2
260 0.14
261 0.12
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.15
268 0.22
269 0.22
270 0.22
271 0.24
272 0.28
273 0.31
274 0.34
275 0.34
276 0.28
277 0.32
278 0.33
279 0.33
280 0.31
281 0.27
282 0.25
283 0.28
284 0.28
285 0.27
286 0.32
287 0.33
288 0.33
289 0.33
290 0.33
291 0.31
292 0.33
293 0.28
294 0.23
295 0.23
296 0.22
297 0.2
298 0.18
299 0.15
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.12
305 0.18
306 0.2
307 0.2
308 0.22
309 0.22
310 0.23
311 0.25
312 0.26
313 0.23
314 0.26
315 0.28
316 0.27
317 0.3
318 0.29
319 0.29
320 0.33
321 0.38
322 0.38
323 0.44
324 0.48
325 0.5
326 0.57
327 0.6
328 0.55
329 0.52
330 0.5
331 0.44
332 0.4
333 0.35
334 0.28
335 0.23
336 0.22
337 0.27
338 0.31
339 0.31
340 0.36
341 0.42
342 0.48
343 0.51
344 0.59
345 0.56
346 0.56
347 0.58
348 0.56
349 0.5
350 0.49
351 0.52
352 0.46
353 0.42
354 0.39
355 0.41
356 0.39
357 0.41
358 0.39
359 0.39
360 0.4
361 0.38
362 0.33
363 0.27
364 0.26
365 0.24
366 0.19
367 0.13
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.17
373 0.16
374 0.17
375 0.2
376 0.2
377 0.26
378 0.27
379 0.3
380 0.29
381 0.33
382 0.35
383 0.39
384 0.39
385 0.37
386 0.4
387 0.37
388 0.37
389 0.34
390 0.32