Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SHF1

Protein Details
Accession A0A397SHF1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-198IAYPNRVEKRSRRKQKQIFVNKNIDSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MSHSTLRNETELLPFFNTCSWSGSTLRNENELLYSNFNCVDSTLRNENELLSSNLNTCSWPNHTLRDKEGNPPSNTVREFIEKIERNLLFPFPSYLGNKLSMPVGKKPAKAMNIYMVFRHYLGIVLKQKNLLNGGKDGKFLSSIAGLMWNGASEKEKQSYDKVTEFLKEQNRIAYPNRVEKRSRRKQKQIFVNKNIDSYKKTNHNIPQYLQTNMGSDNVVPQSYVPNLSSQGYYYISNDTTTRQNLVDGDQTAGINGIIFYNDYSQNRCGGGGEEGRRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.25
4 0.25
5 0.19
6 0.2
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.29
11 0.34
12 0.38
13 0.39
14 0.39
15 0.37
16 0.35
17 0.34
18 0.31
19 0.26
20 0.24
21 0.23
22 0.21
23 0.22
24 0.21
25 0.19
26 0.16
27 0.17
28 0.15
29 0.21
30 0.26
31 0.26
32 0.27
33 0.27
34 0.27
35 0.25
36 0.25
37 0.21
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.18
47 0.23
48 0.24
49 0.31
50 0.37
51 0.4
52 0.45
53 0.5
54 0.48
55 0.51
56 0.58
57 0.58
58 0.52
59 0.54
60 0.51
61 0.48
62 0.47
63 0.39
64 0.32
65 0.29
66 0.28
67 0.26
68 0.33
69 0.29
70 0.3
71 0.36
72 0.34
73 0.31
74 0.31
75 0.3
76 0.21
77 0.19
78 0.19
79 0.13
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.26
92 0.28
93 0.29
94 0.33
95 0.36
96 0.37
97 0.36
98 0.33
99 0.32
100 0.33
101 0.32
102 0.29
103 0.25
104 0.22
105 0.2
106 0.19
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.14
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.25
115 0.25
116 0.25
117 0.28
118 0.23
119 0.18
120 0.2
121 0.23
122 0.21
123 0.21
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.15
145 0.18
146 0.21
147 0.23
148 0.23
149 0.23
150 0.21
151 0.21
152 0.21
153 0.25
154 0.27
155 0.26
156 0.25
157 0.27
158 0.27
159 0.29
160 0.3
161 0.32
162 0.3
163 0.37
164 0.4
165 0.41
166 0.45
167 0.51
168 0.6
169 0.63
170 0.71
171 0.71
172 0.78
173 0.83
174 0.88
175 0.89
176 0.89
177 0.89
178 0.86
179 0.84
180 0.74
181 0.69
182 0.63
183 0.55
184 0.48
185 0.41
186 0.41
187 0.41
188 0.42
189 0.45
190 0.51
191 0.57
192 0.56
193 0.54
194 0.56
195 0.5
196 0.49
197 0.43
198 0.36
199 0.28
200 0.25
201 0.23
202 0.15
203 0.12
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.16
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.16
216 0.17
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.21
228 0.22
229 0.23
230 0.2
231 0.21
232 0.21
233 0.23
234 0.26
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.19
239 0.18
240 0.17
241 0.14
242 0.09
243 0.08
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.1
249 0.16
250 0.18
251 0.22
252 0.23
253 0.26
254 0.26
255 0.26
256 0.23
257 0.19
258 0.24
259 0.27