Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T3D8

Protein Details
Accession A0A397T3D8    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-121GKRAANGVKKPTRKPRPPRDPNAPTKPQNHydrophilic
249-276KNLPQESSSKKRSKKRKPHEDDNESVQEHydrophilic
295-337GSEVQAKERKKNKKVSREEDKDLDVSEGGKSKKKKTKKIKQEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-112KRAANGVKKPTRKPRPPRD
242-266AKSNAPAKNLPQESSSKKRSKKRKP
284-315RKSKKKALNEEGSEVQAKERKKNKKVSREEDK
320-334SEGGKSKKKKTKKIK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSAKPDDKRLKLAAQGLRKTALSLQAAVVSLLQTADALTAETDDNLVENNPLDVNLQDLLKGDINGVLTKLFNDALNNEGEALYGDQRAQQNGKRAANGVKKPTRKPRPPRDPNAPTKPQNAFILFQKDIAHQVKAENTGKPWSEIVHLISTRWKALPKEEREVYERKFELAKQQFEADYKIYLENKDQDQVAPDIDGHEEQHDTSDESATPNSSTTASLSEDEEEEDTLNQPIVRQSRSKAKSNAPAKNLPQESSSKKRSKKRKPHEDDNESVQEDDEYESPRKSKKKALNEEGSEVQAKERKKNKKVSREEDKDLDVSEGGKSKKKKTKKIKQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.58
3 0.54
4 0.52
5 0.47
6 0.43
7 0.37
8 0.36
9 0.29
10 0.25
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.22
15 0.19
16 0.12
17 0.1
18 0.09
19 0.08
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.12
74 0.14
75 0.16
76 0.2
77 0.22
78 0.3
79 0.37
80 0.39
81 0.36
82 0.38
83 0.43
84 0.48
85 0.51
86 0.51
87 0.52
88 0.56
89 0.63
90 0.72
91 0.74
92 0.76
93 0.81
94 0.83
95 0.86
96 0.89
97 0.9
98 0.9
99 0.88
100 0.88
101 0.86
102 0.83
103 0.75
104 0.72
105 0.65
106 0.58
107 0.52
108 0.44
109 0.36
110 0.32
111 0.34
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.22
116 0.26
117 0.26
118 0.23
119 0.17
120 0.18
121 0.18
122 0.23
123 0.25
124 0.19
125 0.19
126 0.22
127 0.22
128 0.22
129 0.2
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.18
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.18
142 0.15
143 0.23
144 0.32
145 0.32
146 0.38
147 0.39
148 0.4
149 0.42
150 0.45
151 0.39
152 0.36
153 0.32
154 0.26
155 0.25
156 0.24
157 0.3
158 0.32
159 0.32
160 0.26
161 0.27
162 0.27
163 0.26
164 0.28
165 0.18
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.16
173 0.16
174 0.17
175 0.16
176 0.14
177 0.15
178 0.15
179 0.13
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.12
221 0.15
222 0.17
223 0.19
224 0.22
225 0.32
226 0.37
227 0.44
228 0.46
229 0.5
230 0.57
231 0.64
232 0.68
233 0.63
234 0.66
235 0.61
236 0.64
237 0.59
238 0.5
239 0.44
240 0.43
241 0.45
242 0.46
243 0.52
244 0.52
245 0.58
246 0.66
247 0.74
248 0.79
249 0.83
250 0.86
251 0.88
252 0.89
253 0.92
254 0.94
255 0.91
256 0.85
257 0.81
258 0.75
259 0.64
260 0.55
261 0.43
262 0.32
263 0.25
264 0.22
265 0.16
266 0.15
267 0.16
268 0.18
269 0.21
270 0.28
271 0.34
272 0.37
273 0.45
274 0.5
275 0.59
276 0.68
277 0.76
278 0.78
279 0.76
280 0.77
281 0.7
282 0.62
283 0.53
284 0.43
285 0.37
286 0.31
287 0.3
288 0.34
289 0.41
290 0.49
291 0.56
292 0.67
293 0.73
294 0.79
295 0.87
296 0.88
297 0.9
298 0.88
299 0.86
300 0.81
301 0.74
302 0.64
303 0.54
304 0.45
305 0.35
306 0.27
307 0.22
308 0.23
309 0.22
310 0.28
311 0.33
312 0.42
313 0.51
314 0.61
315 0.69
316 0.74
317 0.83