Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SLX1

Protein Details
Accession A0A397SLX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-63TVTSDYMKRKKYKNVKENDDDDHydrophilic
251-270DRETKKCPKCGVRITKNGGCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MYSYTTTSTSHPSYKKENSSSPYTYTTTSSSSLNSNGKYHFTVTSDYMKRKKYKNVKENDDDDTDDDDDDDDNENEIDTLPSSSTSSSTSQTRDCMICVETLSVNQFEKITKNCSHPNDICKGCVAQHVETQLNTKGDVEGILCPFGNDCGFLIEHDDVQRIVNNDLFERYDGLALKQALSNMPDFRWCKNAGCGSGQIHSGGDKEPIMTCKACGEKSCYTHDIPWHDALTCEQYNEAKKGEDVATQDLLDRETKKCPKCGVRITKNGGCNHMTCRVQNCRHEFCWLCLADFNQIRRHGNHYHERTCQLYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.61
3 0.62
4 0.65
5 0.63
6 0.66
7 0.64
8 0.6
9 0.56
10 0.49
11 0.43
12 0.38
13 0.35
14 0.3
15 0.28
16 0.24
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.28
21 0.28
22 0.29
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.27
28 0.24
29 0.25
30 0.25
31 0.33
32 0.36
33 0.42
34 0.46
35 0.52
36 0.57
37 0.61
38 0.68
39 0.7
40 0.75
41 0.77
42 0.81
43 0.82
44 0.83
45 0.8
46 0.74
47 0.66
48 0.57
49 0.49
50 0.41
51 0.32
52 0.24
53 0.2
54 0.15
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.06
66 0.07
67 0.06
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.17
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.23
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.14
86 0.14
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.14
96 0.16
97 0.2
98 0.21
99 0.26
100 0.33
101 0.36
102 0.43
103 0.43
104 0.46
105 0.48
106 0.45
107 0.4
108 0.35
109 0.31
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.17
114 0.18
115 0.21
116 0.21
117 0.2
118 0.22
119 0.2
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.1
170 0.11
171 0.16
172 0.17
173 0.18
174 0.22
175 0.22
176 0.22
177 0.26
178 0.29
179 0.25
180 0.25
181 0.27
182 0.24
183 0.24
184 0.23
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.16
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.25
203 0.28
204 0.31
205 0.36
206 0.35
207 0.34
208 0.36
209 0.39
210 0.37
211 0.35
212 0.34
213 0.3
214 0.26
215 0.25
216 0.23
217 0.25
218 0.2
219 0.17
220 0.16
221 0.19
222 0.22
223 0.24
224 0.24
225 0.18
226 0.18
227 0.21
228 0.21
229 0.21
230 0.2
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.21
235 0.18
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.17
240 0.26
241 0.34
242 0.37
243 0.43
244 0.5
245 0.55
246 0.62
247 0.7
248 0.72
249 0.73
250 0.79
251 0.81
252 0.79
253 0.77
254 0.71
255 0.65
256 0.56
257 0.49
258 0.44
259 0.43
260 0.39
261 0.36
262 0.41
263 0.46
264 0.51
265 0.58
266 0.62
267 0.61
268 0.6
269 0.65
270 0.6
271 0.53
272 0.54
273 0.46
274 0.39
275 0.35
276 0.34
277 0.35
278 0.38
279 0.37
280 0.36
281 0.41
282 0.44
283 0.44
284 0.49
285 0.47
286 0.5
287 0.58
288 0.59
289 0.61
290 0.63
291 0.65