Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397S045

Protein Details
Accession A0A397S045    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-359GTKFRIVYPHDRKRPKKTKEFKFSLQHydrophilic
603-630IDKIEKDRERDARRKRRQTRGRRGVILPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-350RKRPKK
609-627DRERDARRKRRQTRGRRGV
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF04855  SNF5  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MDSYPSIPSQQQQQQQQQQQQAGYNNNPLSLSTNHALLQQGHQYNFGTPSINPRVMNAQQQMAMERNYGAMGNPNLQQMRGLSGEGGNNMANQYTFQGRQSLQTSAAAPIPPISALGGPIFNNNMTTTNMLGFPSQSNINGLGLEMFQQQGLNRALGQTVGQRPNMMLLQQQQQQQQQLQQRQYQQHHHHQQQNQQQQQQLATVARQQRQRLQSQQMMQQIRRPMANPSPAQNLHHRSSHQKQNAEPTKKPASTIAKPYEPAPDLTSVQKKYLEQYVRRDTLYQKALDLQHKRQMNIINEKRKEITQAESRHQTRQSTFLFGPGYEGYGNGITGTKFRIVYPHDRKRPKKTKEFKFSLQQLREIAEKEDLLVPIRLEIDGADGYKLRDTFTWNINETLITPEHFAEVLCDDLQFPAATFVPAIVKQIREQLQGYISHPLSSLDQFSSSLPSITNPSEDPNVPKEENDNDGESIILNNSEESNIHEELRILIKIDVTIGNISLVDQFEWDVNCQKNDPELFAEILTAELGLGGEFRTAIAHSIREQIQIYVKSLILVGHPFDGSPIQDDDLRQSLLPPVTNIIRKEDTVDQHTPILVELTEAEIDKIEKDRERDARRKRRQTRGRRGVILPDREPPKTHRTLLHSTTIIPDPTDESGFITLISSGMPPVMRKASSMGYDNYSAISEKVPTPSGKVRGRGRTAGSGLRNIISVNSPDVSDLSNTGRSGSVGPSLQGRESRDGAKKSNRRAGKETEEWHCDGCGCPQTATPLLRKGPNGEKTLCNACGKSLGTINDWNHPKEQYSATNFPNYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.73
3 0.78
4 0.76
5 0.72
6 0.68
7 0.64
8 0.6
9 0.57
10 0.52
11 0.52
12 0.46
13 0.42
14 0.39
15 0.34
16 0.32
17 0.27
18 0.29
19 0.22
20 0.23
21 0.23
22 0.24
23 0.26
24 0.24
25 0.26
26 0.29
27 0.32
28 0.31
29 0.33
30 0.32
31 0.32
32 0.33
33 0.29
34 0.22
35 0.18
36 0.27
37 0.32
38 0.35
39 0.33
40 0.32
41 0.39
42 0.4
43 0.48
44 0.42
45 0.37
46 0.36
47 0.36
48 0.37
49 0.33
50 0.3
51 0.23
52 0.2
53 0.18
54 0.16
55 0.15
56 0.13
57 0.16
58 0.16
59 0.19
60 0.2
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.26
65 0.2
66 0.22
67 0.2
68 0.18
69 0.14
70 0.16
71 0.17
72 0.16
73 0.17
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.1
79 0.09
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.21
85 0.21
86 0.27
87 0.29
88 0.29
89 0.26
90 0.27
91 0.27
92 0.24
93 0.26
94 0.21
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.14
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.15
145 0.15
146 0.22
147 0.25
148 0.26
149 0.26
150 0.25
151 0.28
152 0.28
153 0.22
154 0.17
155 0.18
156 0.24
157 0.28
158 0.33
159 0.35
160 0.38
161 0.41
162 0.41
163 0.43
164 0.46
165 0.49
166 0.5
167 0.51
168 0.55
169 0.59
170 0.63
171 0.66
172 0.65
173 0.68
174 0.72
175 0.75
176 0.76
177 0.73
178 0.76
179 0.76
180 0.77
181 0.73
182 0.68
183 0.62
184 0.56
185 0.51
186 0.44
187 0.37
188 0.28
189 0.22
190 0.24
191 0.27
192 0.3
193 0.34
194 0.36
195 0.41
196 0.46
197 0.52
198 0.54
199 0.55
200 0.56
201 0.56
202 0.58
203 0.58
204 0.58
205 0.52
206 0.49
207 0.46
208 0.41
209 0.38
210 0.33
211 0.31
212 0.32
213 0.38
214 0.35
215 0.34
216 0.4
217 0.4
218 0.42
219 0.44
220 0.43
221 0.39
222 0.41
223 0.4
224 0.41
225 0.47
226 0.54
227 0.53
228 0.51
229 0.5
230 0.58
231 0.66
232 0.64
233 0.58
234 0.55
235 0.57
236 0.53
237 0.52
238 0.48
239 0.46
240 0.44
241 0.51
242 0.49
243 0.44
244 0.44
245 0.44
246 0.43
247 0.36
248 0.32
249 0.25
250 0.22
251 0.21
252 0.25
253 0.31
254 0.26
255 0.27
256 0.28
257 0.27
258 0.27
259 0.33
260 0.36
261 0.34
262 0.42
263 0.48
264 0.48
265 0.48
266 0.48
267 0.42
268 0.42
269 0.41
270 0.33
271 0.25
272 0.28
273 0.32
274 0.37
275 0.41
276 0.37
277 0.39
278 0.41
279 0.41
280 0.4
281 0.42
282 0.41
283 0.47
284 0.51
285 0.54
286 0.53
287 0.55
288 0.52
289 0.46
290 0.44
291 0.35
292 0.32
293 0.31
294 0.34
295 0.37
296 0.44
297 0.46
298 0.47
299 0.47
300 0.44
301 0.37
302 0.4
303 0.36
304 0.33
305 0.31
306 0.29
307 0.27
308 0.23
309 0.24
310 0.17
311 0.17
312 0.11
313 0.11
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.07
319 0.05
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.13
326 0.17
327 0.27
328 0.37
329 0.46
330 0.54
331 0.63
332 0.69
333 0.76
334 0.83
335 0.81
336 0.82
337 0.82
338 0.84
339 0.85
340 0.85
341 0.79
342 0.77
343 0.76
344 0.74
345 0.65
346 0.57
347 0.47
348 0.42
349 0.39
350 0.31
351 0.23
352 0.15
353 0.14
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.08
375 0.12
376 0.14
377 0.18
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.21
382 0.2
383 0.17
384 0.16
385 0.13
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.08
410 0.08
411 0.09
412 0.1
413 0.16
414 0.18
415 0.18
416 0.19
417 0.18
418 0.19
419 0.2
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.16
424 0.15
425 0.15
426 0.14
427 0.13
428 0.13
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.1
442 0.12
443 0.13
444 0.14
445 0.16
446 0.17
447 0.21
448 0.2
449 0.19
450 0.2
451 0.2
452 0.23
453 0.22
454 0.2
455 0.16
456 0.15
457 0.15
458 0.12
459 0.1
460 0.07
461 0.06
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.07
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.13
474 0.15
475 0.13
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.15
500 0.15
501 0.18
502 0.18
503 0.19
504 0.16
505 0.16
506 0.15
507 0.15
508 0.14
509 0.1
510 0.09
511 0.07
512 0.05
513 0.04
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.04
523 0.04
524 0.06
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.14
529 0.15
530 0.17
531 0.17
532 0.17
533 0.21
534 0.21
535 0.22
536 0.19
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.15
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.08
547 0.09
548 0.09
549 0.08
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.11
554 0.12
555 0.14
556 0.15
557 0.16
558 0.13
559 0.13
560 0.16
561 0.17
562 0.17
563 0.14
564 0.15
565 0.18
566 0.23
567 0.23
568 0.25
569 0.25
570 0.25
571 0.28
572 0.31
573 0.3
574 0.33
575 0.34
576 0.3
577 0.29
578 0.29
579 0.25
580 0.2
581 0.17
582 0.1
583 0.08
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.08
592 0.11
593 0.13
594 0.16
595 0.19
596 0.26
597 0.35
598 0.44
599 0.53
600 0.61
601 0.69
602 0.77
603 0.85
604 0.88
605 0.89
606 0.91
607 0.93
608 0.94
609 0.93
610 0.9
611 0.85
612 0.78
613 0.77
614 0.75
615 0.7
616 0.6
617 0.57
618 0.53
619 0.48
620 0.48
621 0.43
622 0.44
623 0.43
624 0.45
625 0.43
626 0.47
627 0.53
628 0.55
629 0.55
630 0.47
631 0.42
632 0.42
633 0.38
634 0.31
635 0.24
636 0.2
637 0.16
638 0.18
639 0.18
640 0.14
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.12
645 0.1
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.07
653 0.07
654 0.11
655 0.15
656 0.15
657 0.16
658 0.19
659 0.21
660 0.23
661 0.27
662 0.25
663 0.25
664 0.26
665 0.25
666 0.23
667 0.2
668 0.18
669 0.15
670 0.13
671 0.12
672 0.13
673 0.16
674 0.18
675 0.18
676 0.23
677 0.3
678 0.38
679 0.41
680 0.47
681 0.53
682 0.59
683 0.64
684 0.64
685 0.61
686 0.58
687 0.56
688 0.55
689 0.5
690 0.45
691 0.41
692 0.36
693 0.32
694 0.25
695 0.23
696 0.19
697 0.17
698 0.15
699 0.14
700 0.14
701 0.14
702 0.15
703 0.15
704 0.13
705 0.14
706 0.15
707 0.18
708 0.18
709 0.18
710 0.18
711 0.17
712 0.18
713 0.18
714 0.19
715 0.16
716 0.17
717 0.2
718 0.21
719 0.23
720 0.26
721 0.28
722 0.29
723 0.31
724 0.38
725 0.41
726 0.44
727 0.49
728 0.56
729 0.6
730 0.65
731 0.71
732 0.71
733 0.71
734 0.72
735 0.73
736 0.71
737 0.71
738 0.68
739 0.66
740 0.64
741 0.59
742 0.54
743 0.46
744 0.37
745 0.3
746 0.3
747 0.29
748 0.25
749 0.24
750 0.24
751 0.29
752 0.34
753 0.37
754 0.36
755 0.37
756 0.4
757 0.44
758 0.45
759 0.47
760 0.51
761 0.54
762 0.55
763 0.52
764 0.51
765 0.51
766 0.56
767 0.53
768 0.48
769 0.41
770 0.36
771 0.38
772 0.35
773 0.33
774 0.31
775 0.29
776 0.29
777 0.36
778 0.37
779 0.4
780 0.44
781 0.44
782 0.42
783 0.41
784 0.39
785 0.36
786 0.4
787 0.39
788 0.43
789 0.47
790 0.48