Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397S9Q3

Protein Details
Accession A0A397S9Q3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-168GKDSVKKEKRPVKRKSLDETTKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-178VKKEKRPVKRKSLDETTKKSSNSIKRKGK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 1, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR000555  JAMM/MPN+_dom  
IPR037518  MPN  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0008237  F:metallopeptidase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01398  JAB  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50249  MPN  
PS50934  SWIRM  
CDD cd08067  MPN_2A_DUB  
Amino Acid Sequences MSSSFSSEEAEEKASTSTRDAYHSEKDATSSPPAEFSGSIDQSTELGEGTSSNLAGKSSIKETIIDQSIISEEERQSNIEFFVGRGLKTPERYLKIRNYILNAWLKSKPKFVSKTSVRPGLKDCGDVNAIGRVHLYLESIGAINIGKDSVKKEKRPVKRKSLDETTKKSSNSIKRKGKSEDGDYRRGRENLNGTKENSVEPTGGSYDPFRLVPPHHYTSRNPAPFRVSVSTNVMLLMDFHAHLAHTEIIGLLGGHFFSDRELMEVTYVYPCKSSSTGFQCEMDPASEVAAREVFAEKGLEFVGWYHSHPTFDPQPSIRDIENQTQYQEMWRREDGVEPFIGVIVTPYDIEHDSNVSRFQFWMSGTNYDLSGQFRTPYSCQHSFLQNENLPEEIFSQMTGLVKEYHNYDQRVNMTESYRKDEVVSRLDKLIESLSSHITVSSKAAETFISRVRELMNTEFRPNKNEEESQLEIDAPVGKESILS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.19
4 0.22
5 0.21
6 0.25
7 0.27
8 0.31
9 0.35
10 0.39
11 0.39
12 0.35
13 0.36
14 0.34
15 0.35
16 0.35
17 0.3
18 0.26
19 0.25
20 0.25
21 0.25
22 0.22
23 0.22
24 0.26
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.22
29 0.2
30 0.21
31 0.17
32 0.08
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.16
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.21
50 0.27
51 0.28
52 0.25
53 0.22
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.15
59 0.14
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.19
66 0.17
67 0.16
68 0.11
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.19
73 0.24
74 0.27
75 0.3
76 0.37
77 0.37
78 0.41
79 0.45
80 0.49
81 0.52
82 0.56
83 0.59
84 0.56
85 0.53
86 0.5
87 0.53
88 0.54
89 0.46
90 0.42
91 0.42
92 0.44
93 0.41
94 0.45
95 0.42
96 0.44
97 0.48
98 0.48
99 0.53
100 0.56
101 0.63
102 0.63
103 0.69
104 0.61
105 0.58
106 0.58
107 0.55
108 0.48
109 0.41
110 0.35
111 0.29
112 0.29
113 0.26
114 0.23
115 0.2
116 0.19
117 0.16
118 0.15
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.1
136 0.2
137 0.28
138 0.32
139 0.42
140 0.51
141 0.62
142 0.71
143 0.76
144 0.77
145 0.79
146 0.81
147 0.8
148 0.82
149 0.81
150 0.79
151 0.77
152 0.72
153 0.69
154 0.62
155 0.57
156 0.54
157 0.54
158 0.56
159 0.6
160 0.62
161 0.62
162 0.69
163 0.71
164 0.7
165 0.65
166 0.64
167 0.64
168 0.6
169 0.64
170 0.59
171 0.57
172 0.53
173 0.5
174 0.42
175 0.36
176 0.4
177 0.38
178 0.43
179 0.43
180 0.4
181 0.4
182 0.4
183 0.35
184 0.28
185 0.22
186 0.15
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.17
200 0.23
201 0.26
202 0.29
203 0.32
204 0.33
205 0.4
206 0.48
207 0.47
208 0.42
209 0.39
210 0.39
211 0.37
212 0.39
213 0.33
214 0.25
215 0.21
216 0.25
217 0.23
218 0.19
219 0.18
220 0.15
221 0.12
222 0.1
223 0.09
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.15
262 0.21
263 0.25
264 0.26
265 0.27
266 0.25
267 0.25
268 0.25
269 0.19
270 0.13
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.13
293 0.13
294 0.15
295 0.15
296 0.19
297 0.22
298 0.24
299 0.27
300 0.25
301 0.27
302 0.28
303 0.3
304 0.26
305 0.25
306 0.26
307 0.3
308 0.34
309 0.32
310 0.3
311 0.29
312 0.28
313 0.29
314 0.32
315 0.27
316 0.26
317 0.26
318 0.29
319 0.28
320 0.34
321 0.3
322 0.25
323 0.23
324 0.18
325 0.18
326 0.15
327 0.14
328 0.09
329 0.07
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.12
341 0.15
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.19
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.21
353 0.2
354 0.19
355 0.19
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.18
362 0.19
363 0.25
364 0.31
365 0.32
366 0.35
367 0.37
368 0.43
369 0.42
370 0.45
371 0.47
372 0.42
373 0.4
374 0.38
375 0.35
376 0.28
377 0.25
378 0.22
379 0.14
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.18
391 0.24
392 0.29
393 0.31
394 0.32
395 0.35
396 0.38
397 0.41
398 0.39
399 0.35
400 0.34
401 0.37
402 0.39
403 0.4
404 0.38
405 0.34
406 0.33
407 0.36
408 0.37
409 0.4
410 0.4
411 0.35
412 0.36
413 0.37
414 0.34
415 0.29
416 0.26
417 0.19
418 0.17
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.18
423 0.17
424 0.16
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.16
429 0.15
430 0.16
431 0.16
432 0.17
433 0.21
434 0.25
435 0.26
436 0.24
437 0.25
438 0.26
439 0.28
440 0.3
441 0.33
442 0.37
443 0.36
444 0.43
445 0.5
446 0.5
447 0.52
448 0.52
449 0.51
450 0.48
451 0.49
452 0.46
453 0.45
454 0.48
455 0.45
456 0.41
457 0.35
458 0.28
459 0.25
460 0.26
461 0.19
462 0.16
463 0.13