Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SSX0

Protein Details
Accession A0A397SSX0    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-65LGRTHDKKGSGKNKKPPNAFIHydrophilic
126-145QPTIRQPTTRRKKNTNVRGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-60KKGSGKNKKP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12, mito 3.5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTDTMSQQKEFVFISVDGKQTKNIAITPPENLKVEFPPKFTDSELGRTHDKKGSGKNKKPPNAFILFRKKYVESLHRLGHHDAMKKVSGWARDAWNKLSQNEKDQYEFYANRAASLYQEWEIRNPQPTIRQPTTRRKKNTNVRGPSSNRPAPIQTIQLPKTHSTHLLSPKSSPESLIDIFPEYDRNCNQILSDISTDPFPGFQNILYYPTNIMYESSIMPDCFFNVEDNYSVPPLTEIQPTNNQFYEFDYFSNPKLNYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.25
4 0.26
5 0.26
6 0.27
7 0.26
8 0.27
9 0.25
10 0.24
11 0.25
12 0.29
13 0.3
14 0.33
15 0.36
16 0.37
17 0.36
18 0.34
19 0.32
20 0.32
21 0.38
22 0.36
23 0.33
24 0.35
25 0.35
26 0.36
27 0.35
28 0.35
29 0.29
30 0.34
31 0.35
32 0.34
33 0.38
34 0.38
35 0.41
36 0.39
37 0.4
38 0.38
39 0.45
40 0.52
41 0.58
42 0.65
43 0.7
44 0.76
45 0.81
46 0.8
47 0.75
48 0.71
49 0.67
50 0.62
51 0.62
52 0.63
53 0.57
54 0.54
55 0.52
56 0.45
57 0.42
58 0.45
59 0.43
60 0.39
61 0.41
62 0.44
63 0.44
64 0.47
65 0.45
66 0.44
67 0.41
68 0.38
69 0.35
70 0.32
71 0.3
72 0.27
73 0.28
74 0.26
75 0.23
76 0.21
77 0.22
78 0.25
79 0.3
80 0.32
81 0.31
82 0.35
83 0.35
84 0.34
85 0.39
86 0.35
87 0.36
88 0.39
89 0.38
90 0.33
91 0.31
92 0.31
93 0.29
94 0.27
95 0.22
96 0.23
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.18
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.09
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.22
114 0.27
115 0.34
116 0.34
117 0.41
118 0.44
119 0.55
120 0.64
121 0.66
122 0.68
123 0.67
124 0.74
125 0.76
126 0.8
127 0.79
128 0.76
129 0.72
130 0.73
131 0.71
132 0.68
133 0.65
134 0.57
135 0.48
136 0.42
137 0.39
138 0.34
139 0.32
140 0.28
141 0.25
142 0.29
143 0.3
144 0.31
145 0.32
146 0.3
147 0.3
148 0.28
149 0.26
150 0.22
151 0.27
152 0.33
153 0.35
154 0.34
155 0.33
156 0.36
157 0.36
158 0.34
159 0.28
160 0.22
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.18
165 0.15
166 0.16
167 0.15
168 0.17
169 0.13
170 0.17
171 0.17
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.14
185 0.13
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.13
191 0.13
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.17
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.2
224 0.19
225 0.24
226 0.33
227 0.36
228 0.4
229 0.39
230 0.38
231 0.32
232 0.35
233 0.36
234 0.27
235 0.26
236 0.27
237 0.28
238 0.28
239 0.36