Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TJX5

Protein Details
Accession A0A397TJX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-99VTKSGTKDISKKKPDKIKAFDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025986  RPAP3-like_C  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13877  RPAP3_C  
PF13414  TPR_11  
PF07719  TPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MASQKQKKETSEVYQQYVQNLYKWEKEIKEKEEKEKNLSKDGSLTTPTYPSIRPSGEILFGAAQQPTPVSVLPEKVSKVTKSGTKDISKKKPDKIKAFDYQSWDKFDVDKALEESDEEIPIKPTSVVKSDKDQQQTNPVPIPSTPSNRPTSMSKQREPDRKGKKTVRLEQAFQEKETGNAFFKKGNYTMAIVHYGKAMELDPKEAVYVINRAMAYLKLKNWENAEIDCTSGLILHPDNPKALWRRGIARRELGKLEEAKKDLQDALRLEPNDKAVKEELDKVLNAIESATPNKADTAQINEVPVPRHRLFIEEVDFDEDELETDPIKVYKNKPIENPIIPPKKTTPKKFGVPQSVIEFERDWRIQQSDEDLYHYIKIIPPSSYPNLLSYLLEADFW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.53
4 0.52
5 0.46
6 0.38
7 0.39
8 0.37
9 0.36
10 0.39
11 0.42
12 0.41
13 0.51
14 0.56
15 0.57
16 0.64
17 0.66
18 0.72
19 0.75
20 0.74
21 0.73
22 0.73
23 0.69
24 0.67
25 0.63
26 0.54
27 0.49
28 0.47
29 0.42
30 0.37
31 0.35
32 0.27
33 0.28
34 0.28
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.26
39 0.25
40 0.25
41 0.26
42 0.27
43 0.26
44 0.25
45 0.23
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.14
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.13
58 0.16
59 0.18
60 0.21
61 0.22
62 0.24
63 0.28
64 0.25
65 0.27
66 0.28
67 0.32
68 0.35
69 0.41
70 0.45
71 0.48
72 0.57
73 0.63
74 0.69
75 0.74
76 0.75
77 0.77
78 0.79
79 0.81
80 0.82
81 0.79
82 0.77
83 0.76
84 0.76
85 0.71
86 0.68
87 0.67
88 0.6
89 0.57
90 0.51
91 0.42
92 0.36
93 0.33
94 0.31
95 0.24
96 0.22
97 0.18
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.17
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.19
113 0.22
114 0.23
115 0.29
116 0.36
117 0.41
118 0.45
119 0.45
120 0.41
121 0.47
122 0.49
123 0.46
124 0.42
125 0.35
126 0.31
127 0.28
128 0.32
129 0.26
130 0.29
131 0.29
132 0.31
133 0.35
134 0.35
135 0.37
136 0.36
137 0.41
138 0.46
139 0.5
140 0.49
141 0.53
142 0.61
143 0.68
144 0.68
145 0.68
146 0.68
147 0.68
148 0.73
149 0.72
150 0.74
151 0.74
152 0.78
153 0.78
154 0.71
155 0.66
156 0.62
157 0.64
158 0.55
159 0.46
160 0.39
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.21
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.14
169 0.15
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.19
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.16
205 0.18
206 0.2
207 0.21
208 0.23
209 0.22
210 0.2
211 0.22
212 0.17
213 0.17
214 0.14
215 0.12
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.1
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.2
227 0.23
228 0.25
229 0.25
230 0.25
231 0.33
232 0.4
233 0.46
234 0.45
235 0.47
236 0.49
237 0.47
238 0.47
239 0.4
240 0.36
241 0.36
242 0.36
243 0.33
244 0.31
245 0.29
246 0.28
247 0.28
248 0.26
249 0.22
250 0.22
251 0.2
252 0.22
253 0.25
254 0.25
255 0.25
256 0.23
257 0.26
258 0.26
259 0.24
260 0.23
261 0.2
262 0.22
263 0.23
264 0.27
265 0.25
266 0.23
267 0.23
268 0.2
269 0.2
270 0.17
271 0.15
272 0.11
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.11
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.19
284 0.22
285 0.22
286 0.23
287 0.24
288 0.25
289 0.26
290 0.27
291 0.28
292 0.25
293 0.27
294 0.26
295 0.27
296 0.28
297 0.31
298 0.33
299 0.26
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.23
304 0.21
305 0.15
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.13
314 0.19
315 0.21
316 0.3
317 0.39
318 0.43
319 0.48
320 0.55
321 0.59
322 0.57
323 0.61
324 0.62
325 0.63
326 0.58
327 0.57
328 0.57
329 0.6
330 0.66
331 0.67
332 0.66
333 0.65
334 0.73
335 0.78
336 0.8
337 0.79
338 0.73
339 0.69
340 0.65
341 0.61
342 0.53
343 0.46
344 0.38
345 0.3
346 0.34
347 0.3
348 0.26
349 0.26
350 0.28
351 0.27
352 0.29
353 0.33
354 0.31
355 0.31
356 0.32
357 0.3
358 0.29
359 0.28
360 0.27
361 0.22
362 0.2
363 0.24
364 0.22
365 0.23
366 0.24
367 0.31
368 0.34
369 0.37
370 0.35
371 0.32
372 0.33
373 0.33
374 0.3
375 0.24
376 0.23