Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TFC4

Protein Details
Accession A0A397TFC4    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-46MTNKSSRKPKKSVTTKSLKEKKSTNASKNKTGKTYKNKANVPKILPHydrophilic
87-107NKFINIKKPSLKPVRNNKDSLHydrophilic
460-501VNPNVKDKKRKLEKQEPKKHLSRKMKKLEKERKKVEKEMKEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-33SRKPKKSVTTKSLKEKKSTNASKNKTGK
465-496KDKKRKLEKQEPKKHLSRKMKKLEKERKKVEK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR011501  Noc3_N  
IPR016903  Nucleolar_cplx-assoc_3  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
PF07540  NOC3p  
Amino Acid Sequences MTNKSSRKPKKSVTTKSLKEKKSTNASKNKTGKTYKNKANVPKILPIINDINEDEIELSEEDVEFFKEHDQFTGFLKNIDKVAIHRNKFINIKKPSLKPVRNNKDSLPSLTSSEEDDDEMIMEGELDREKMYISSNSDTEQEYEKIPRSNKAWIQKEQTKLPIKLPDGKIKQREFVKEVRNDEDEEKNSSMSIDQEESSSNNNEQSDFAINDKKSQALEHTSDTNITDEEYISQKKEQMAEIAQLIIEDPEENIGQLKTLREMASDKNLTVKKLVLITQLVVYKDIIPGYRIRQLTDKEKSAQVSKAVKKIWNFEQSLLANYQSYLQSLEEELKVEKKKSLRNKSVNITEEKCIAEEALQCMCNLLTSVTHFNFRLNLMTAIVTRMSARKFTKMSAMCCDAIIEVFKNDESGEASLDAVKLITKMTKSRGYVVHEEVLNTFLHLRLRDELNMKTSHEDEVNPNVKDKKRKLEKQEPKKHLSRKMKKLEKERKKVEKEMKEAEAVVDKEEKDKTHTETLKLVFVTYFRILKHANKSPLLLSVLEGLAKFAHLINVDFFNDLLELLKKIMIDDTKLEDSDLEESNAISFTYRIKTRRSLLCIITAFQLLSGQGEALNIDLKDFYTQMYAILLPLALNPYIEKNEHYKKLNDDEGKIDNVTRVETEQELLMKGFDFMFFKRRQIPIDRSAAFLKRLSIACMNWPSKTVLICLNKMEKMIQRQSRLDALLTSDDKAANGIYRPELNDPELCNPFATSLWELNLLQRHYDPKVRAAAVQLATYESNSSKPVNKVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.88
3 0.9
4 0.9
5 0.85
6 0.81
7 0.77
8 0.76
9 0.76
10 0.78
11 0.77
12 0.78
13 0.79
14 0.83
15 0.85
16 0.83
17 0.81
18 0.79
19 0.79
20 0.79
21 0.83
22 0.82
23 0.82
24 0.83
25 0.84
26 0.85
27 0.84
28 0.77
29 0.74
30 0.69
31 0.62
32 0.54
33 0.49
34 0.44
35 0.37
36 0.35
37 0.28
38 0.26
39 0.23
40 0.22
41 0.18
42 0.13
43 0.13
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.13
54 0.16
55 0.17
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.22
60 0.29
61 0.25
62 0.24
63 0.27
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.24
68 0.19
69 0.3
70 0.37
71 0.37
72 0.42
73 0.43
74 0.48
75 0.56
76 0.6
77 0.59
78 0.56
79 0.63
80 0.64
81 0.67
82 0.71
83 0.73
84 0.75
85 0.75
86 0.8
87 0.82
88 0.8
89 0.78
90 0.72
91 0.71
92 0.65
93 0.6
94 0.53
95 0.44
96 0.39
97 0.37
98 0.34
99 0.26
100 0.25
101 0.2
102 0.16
103 0.15
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.11
119 0.14
120 0.18
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.24
125 0.24
126 0.23
127 0.23
128 0.2
129 0.19
130 0.23
131 0.25
132 0.3
133 0.31
134 0.34
135 0.33
136 0.41
137 0.45
138 0.51
139 0.55
140 0.56
141 0.63
142 0.64
143 0.67
144 0.64
145 0.66
146 0.64
147 0.59
148 0.58
149 0.56
150 0.53
151 0.56
152 0.56
153 0.57
154 0.57
155 0.63
156 0.66
157 0.61
158 0.64
159 0.61
160 0.62
161 0.56
162 0.56
163 0.57
164 0.55
165 0.56
166 0.54
167 0.5
168 0.47
169 0.46
170 0.45
171 0.38
172 0.36
173 0.33
174 0.28
175 0.26
176 0.23
177 0.2
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.16
195 0.17
196 0.21
197 0.21
198 0.24
199 0.25
200 0.24
201 0.21
202 0.21
203 0.23
204 0.21
205 0.24
206 0.23
207 0.24
208 0.23
209 0.24
210 0.23
211 0.2
212 0.15
213 0.13
214 0.1
215 0.08
216 0.1
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.16
221 0.18
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.2
228 0.19
229 0.17
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.08
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.15
250 0.17
251 0.23
252 0.24
253 0.22
254 0.27
255 0.29
256 0.28
257 0.27
258 0.25
259 0.19
260 0.2
261 0.22
262 0.17
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.19
267 0.18
268 0.16
269 0.15
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.09
275 0.12
276 0.14
277 0.2
278 0.2
279 0.2
280 0.25
281 0.28
282 0.36
283 0.39
284 0.39
285 0.35
286 0.38
287 0.38
288 0.36
289 0.34
290 0.32
291 0.36
292 0.36
293 0.39
294 0.39
295 0.41
296 0.4
297 0.43
298 0.44
299 0.42
300 0.4
301 0.35
302 0.38
303 0.35
304 0.35
305 0.3
306 0.23
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.14
321 0.16
322 0.17
323 0.2
324 0.23
325 0.3
326 0.4
327 0.5
328 0.55
329 0.61
330 0.66
331 0.69
332 0.71
333 0.67
334 0.62
335 0.54
336 0.44
337 0.39
338 0.33
339 0.26
340 0.19
341 0.15
342 0.12
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.06
353 0.05
354 0.06
355 0.11
356 0.11
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.09
373 0.09
374 0.14
375 0.15
376 0.19
377 0.2
378 0.2
379 0.28
380 0.28
381 0.3
382 0.29
383 0.31
384 0.27
385 0.25
386 0.25
387 0.17
388 0.13
389 0.12
390 0.08
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.06
410 0.07
411 0.09
412 0.14
413 0.19
414 0.2
415 0.24
416 0.28
417 0.31
418 0.33
419 0.34
420 0.32
421 0.27
422 0.27
423 0.23
424 0.2
425 0.15
426 0.12
427 0.09
428 0.07
429 0.09
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.13
434 0.16
435 0.19
436 0.19
437 0.2
438 0.21
439 0.2
440 0.19
441 0.19
442 0.17
443 0.15
444 0.16
445 0.14
446 0.22
447 0.26
448 0.25
449 0.27
450 0.31
451 0.35
452 0.42
453 0.45
454 0.47
455 0.52
456 0.6
457 0.67
458 0.73
459 0.8
460 0.82
461 0.88
462 0.85
463 0.81
464 0.82
465 0.79
466 0.78
467 0.79
468 0.78
469 0.77
470 0.81
471 0.82
472 0.81
473 0.85
474 0.86
475 0.86
476 0.86
477 0.85
478 0.85
479 0.83
480 0.85
481 0.83
482 0.81
483 0.76
484 0.72
485 0.64
486 0.54
487 0.48
488 0.39
489 0.34
490 0.25
491 0.2
492 0.17
493 0.15
494 0.17
495 0.18
496 0.18
497 0.18
498 0.2
499 0.23
500 0.3
501 0.32
502 0.31
503 0.35
504 0.36
505 0.35
506 0.32
507 0.28
508 0.19
509 0.17
510 0.19
511 0.16
512 0.17
513 0.13
514 0.17
515 0.19
516 0.24
517 0.32
518 0.36
519 0.39
520 0.38
521 0.39
522 0.37
523 0.38
524 0.34
525 0.26
526 0.18
527 0.15
528 0.14
529 0.13
530 0.12
531 0.09
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.05
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.09
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.11
544 0.1
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.18
559 0.18
560 0.19
561 0.18
562 0.15
563 0.15
564 0.17
565 0.16
566 0.12
567 0.1
568 0.1
569 0.1
570 0.11
571 0.09
572 0.07
573 0.06
574 0.08
575 0.13
576 0.18
577 0.21
578 0.26
579 0.32
580 0.39
581 0.46
582 0.5
583 0.5
584 0.47
585 0.51
586 0.48
587 0.43
588 0.37
589 0.3
590 0.24
591 0.18
592 0.16
593 0.09
594 0.09
595 0.08
596 0.06
597 0.05
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.09
613 0.09
614 0.08
615 0.08
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.08
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.1
624 0.13
625 0.14
626 0.15
627 0.22
628 0.31
629 0.37
630 0.4
631 0.41
632 0.45
633 0.51
634 0.57
635 0.53
636 0.47
637 0.46
638 0.45
639 0.43
640 0.38
641 0.31
642 0.25
643 0.22
644 0.2
645 0.17
646 0.14
647 0.14
648 0.14
649 0.15
650 0.14
651 0.14
652 0.14
653 0.13
654 0.13
655 0.11
656 0.11
657 0.1
658 0.1
659 0.11
660 0.12
661 0.19
662 0.21
663 0.25
664 0.32
665 0.35
666 0.39
667 0.46
668 0.51
669 0.51
670 0.59
671 0.55
672 0.51
673 0.53
674 0.51
675 0.45
676 0.38
677 0.32
678 0.29
679 0.28
680 0.29
681 0.28
682 0.26
683 0.31
684 0.39
685 0.39
686 0.34
687 0.35
688 0.34
689 0.32
690 0.32
691 0.27
692 0.27
693 0.3
694 0.32
695 0.36
696 0.39
697 0.37
698 0.37
699 0.4
700 0.38
701 0.41
702 0.49
703 0.51
704 0.52
705 0.54
706 0.57
707 0.57
708 0.52
709 0.44
710 0.35
711 0.31
712 0.31
713 0.29
714 0.26
715 0.23
716 0.22
717 0.2
718 0.2
719 0.18
720 0.14
721 0.15
722 0.16
723 0.17
724 0.2
725 0.22
726 0.26
727 0.29
728 0.29
729 0.31
730 0.32
731 0.36
732 0.36
733 0.34
734 0.3
735 0.28
736 0.26
737 0.22
738 0.23
739 0.2
740 0.19
741 0.19
742 0.22
743 0.22
744 0.25
745 0.31
746 0.28
747 0.27
748 0.28
749 0.32
750 0.34
751 0.41
752 0.39
753 0.39
754 0.45
755 0.44
756 0.43
757 0.42
758 0.44
759 0.39
760 0.37
761 0.31
762 0.26
763 0.25
764 0.24
765 0.23
766 0.16
767 0.16
768 0.18
769 0.21
770 0.25