Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SY18

Protein Details
Accession A0A397SY18    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MGQSSRRTRRRKSRKKLGPYQLHMREEIHydrophilic
45-110VQAARAWRYSPNNKKNDPKYQKEMAQKNKPKKQEKNKPKKQEIIKKTKPRPKKREIVQKNEPKVNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-17RRTRRRKSRKKL
65-99QKEMAQKNKPKKQEKNKPKKQEIIKKTKPRPKKRE
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR006780  YABBY  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF04690  YABBY  
Amino Acid Sequences MGQSSRRTRRRKSRKKLGPYQLHMREEIAAIKANNPNLPHREVFVQAARAWRYSPNNKKNDPKYQKEMAQKNKPKKQEKNKPKKQEIIKKTKPRPKKREIVQKNEPKVNEILVKNNSKNQGYIKELLDMFDENVNENANVLDVEMNETNENEVIDADNGENEKMTDVVYNDDNHLNKLSQVIDNEDMSDVTYHNEAYDTNQMPDKIYVEETEINEMNQVAEVEDLDVDNREIEMNKVNQMAEKVDVEESRMNEMNQNEETNDLDVDNRETEMNKMYQMTEKISDVEETEMENEEISNKKIDIIVDEETELNEAYQMDEVVENKEMNIVERTKMNAIGLEETEMNEVAQNKEMDVETEMNEVAQNKEMDEETEKNEVSQMAKDKGAESSSGGTRYCSKCGTEIYEQLICDLKYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.95
3 0.96
4 0.95
5 0.95
6 0.91
7 0.91
8 0.88
9 0.8
10 0.7
11 0.61
12 0.51
13 0.42
14 0.36
15 0.27
16 0.22
17 0.2
18 0.24
19 0.27
20 0.28
21 0.3
22 0.3
23 0.35
24 0.37
25 0.42
26 0.37
27 0.35
28 0.35
29 0.35
30 0.37
31 0.33
32 0.32
33 0.28
34 0.34
35 0.33
36 0.32
37 0.31
38 0.33
39 0.38
40 0.45
41 0.54
42 0.58
43 0.65
44 0.72
45 0.81
46 0.83
47 0.85
48 0.84
49 0.82
50 0.8
51 0.78
52 0.78
53 0.77
54 0.78
55 0.77
56 0.79
57 0.8
58 0.83
59 0.83
60 0.86
61 0.86
62 0.87
63 0.88
64 0.88
65 0.9
66 0.91
67 0.94
68 0.95
69 0.93
70 0.91
71 0.91
72 0.9
73 0.89
74 0.89
75 0.89
76 0.89
77 0.9
78 0.9
79 0.9
80 0.91
81 0.9
82 0.89
83 0.89
84 0.88
85 0.89
86 0.89
87 0.88
88 0.88
89 0.87
90 0.85
91 0.81
92 0.71
93 0.63
94 0.54
95 0.47
96 0.44
97 0.35
98 0.34
99 0.35
100 0.41
101 0.4
102 0.44
103 0.45
104 0.39
105 0.4
106 0.37
107 0.36
108 0.35
109 0.37
110 0.33
111 0.32
112 0.31
113 0.29
114 0.26
115 0.21
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.16
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.13
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.11
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.09
221 0.1
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.14
227 0.14
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.16
237 0.17
238 0.16
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.12
248 0.12
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.16
264 0.18
265 0.19
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.17
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.1
285 0.11
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.15
292 0.16
293 0.15
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.22
318 0.21
319 0.22
320 0.2
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.13
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.16
338 0.16
339 0.15
340 0.17
341 0.17
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.13
346 0.15
347 0.15
348 0.13
349 0.15
350 0.14
351 0.13
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.27
359 0.26
360 0.25
361 0.26
362 0.25
363 0.22
364 0.25
365 0.27
366 0.25
367 0.27
368 0.28
369 0.27
370 0.29
371 0.28
372 0.24
373 0.2
374 0.21
375 0.23
376 0.25
377 0.24
378 0.23
379 0.31
380 0.33
381 0.35
382 0.33
383 0.31
384 0.32
385 0.37
386 0.42
387 0.4
388 0.42
389 0.43
390 0.44
391 0.41
392 0.39
393 0.39