Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T9C9

Protein Details
Accession A0A397T9C9    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-51DLLNNSTKTRRAKRYEKKRINKPPRPQNAFIIHydrophilic
108-137DYVYEPKKPNPNRKKAKKAAPKRQTNDKNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-44TRRAKRYEKKRINKPPR
113-130PKKPNPNRKKAKKAAPKR
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MKDENLIYSSNYRFTIDIEDLLNNSTKTRRAKRYEKKRINKPPRPQNAFIIYRRNKVAELKIIFEGQKSANISRIVGEYWREEEKEVKELFEAISRVAEKRHSDKYKDYVYEPKKPNPNRKKAKKAAPKRQTNDKNSTIYPSPTLTDISNFSLSDSNYSNSEFYPSPISNSNNSPLIDNDEINDIQEIGDVVPLVPSLNDIQAQIMINDPVVTESLLEPVDINYDYYGATSNLFQNDFFPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.22
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.2
8 0.21
9 0.22
10 0.16
11 0.16
12 0.17
13 0.22
14 0.31
15 0.4
16 0.48
17 0.55
18 0.67
19 0.76
20 0.84
21 0.89
22 0.91
23 0.92
24 0.93
25 0.95
26 0.95
27 0.94
28 0.93
29 0.93
30 0.93
31 0.91
32 0.83
33 0.79
34 0.76
35 0.73
36 0.67
37 0.67
38 0.6
39 0.56
40 0.55
41 0.49
42 0.42
43 0.4
44 0.41
45 0.39
46 0.36
47 0.35
48 0.34
49 0.34
50 0.32
51 0.27
52 0.24
53 0.16
54 0.18
55 0.18
56 0.17
57 0.2
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.19
62 0.16
63 0.14
64 0.15
65 0.12
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.2
72 0.25
73 0.24
74 0.21
75 0.19
76 0.19
77 0.19
78 0.17
79 0.16
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.15
87 0.2
88 0.29
89 0.32
90 0.35
91 0.39
92 0.44
93 0.46
94 0.45
95 0.42
96 0.42
97 0.43
98 0.49
99 0.49
100 0.49
101 0.53
102 0.58
103 0.66
104 0.67
105 0.73
106 0.74
107 0.8
108 0.84
109 0.83
110 0.87
111 0.86
112 0.87
113 0.87
114 0.86
115 0.86
116 0.8
117 0.83
118 0.82
119 0.78
120 0.75
121 0.69
122 0.62
123 0.53
124 0.52
125 0.42
126 0.34
127 0.28
128 0.22
129 0.18
130 0.15
131 0.16
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.12
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.17
152 0.16
153 0.18
154 0.22
155 0.24
156 0.24
157 0.27
158 0.28
159 0.27
160 0.27
161 0.25
162 0.21
163 0.25
164 0.24
165 0.21
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.17
170 0.17
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.17
220 0.18
221 0.18