Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SMH1

Protein Details
Accession A0A397SMH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
316-336ISARAKFIKSKKRLVIRAEKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-328KSKKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012981  PIH1_N  
IPR041442  PIH1D1/2/3_CS-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF08190  PIH1  
PF18201  PIH1_CS  
Amino Acid Sequences MAQVKLEFDDEKSSKALSSLMIKDLVHNEQEELAEEVFLEELSSQLAENPKAMAALTEQYMKTTKLSGQDLENIQLLPEPGLVVKSRITSSNNKLYQVNTKFFINICHSNKVPSPLPNATEAEIRKSMNGEEDSLYRVPTVISNIREDKDTKQEMCYVCDAIIHPLPCKRTREDFDFKLYIIELAVEMIEEQFNLELNRDFAFPNISYKGKREEKPVLIPKQQKSLITEISAKQSKQKIVEVNEKPTKNIKTPDQPKYTITEELRGKKVFLAIFIETPSMQSAKDSTLDLEPLRLIFNSPGKYNLDISLPSNVNIISARAKFIKSKKRLVIRAEKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.22
4 0.15
5 0.21
6 0.22
7 0.23
8 0.25
9 0.25
10 0.28
11 0.31
12 0.31
13 0.26
14 0.24
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.19
19 0.17
20 0.14
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.08
26 0.07
27 0.04
28 0.04
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.08
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.11
41 0.09
42 0.1
43 0.11
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.18
48 0.19
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.21
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.3
57 0.31
58 0.3
59 0.29
60 0.22
61 0.19
62 0.18
63 0.16
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.06
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.16
75 0.2
76 0.26
77 0.33
78 0.41
79 0.42
80 0.42
81 0.43
82 0.42
83 0.47
84 0.45
85 0.41
86 0.33
87 0.31
88 0.3
89 0.29
90 0.32
91 0.28
92 0.31
93 0.31
94 0.34
95 0.34
96 0.35
97 0.37
98 0.37
99 0.34
100 0.29
101 0.31
102 0.3
103 0.31
104 0.31
105 0.3
106 0.26
107 0.28
108 0.25
109 0.23
110 0.22
111 0.21
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.11
124 0.11
125 0.09
126 0.09
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.18
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.23
135 0.22
136 0.26
137 0.28
138 0.25
139 0.24
140 0.29
141 0.28
142 0.28
143 0.27
144 0.19
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.12
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.17
154 0.2
155 0.23
156 0.24
157 0.28
158 0.32
159 0.39
160 0.44
161 0.43
162 0.44
163 0.42
164 0.39
165 0.33
166 0.28
167 0.2
168 0.13
169 0.11
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.11
190 0.1
191 0.13
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.28
197 0.33
198 0.35
199 0.39
200 0.44
201 0.46
202 0.55
203 0.62
204 0.59
205 0.6
206 0.65
207 0.6
208 0.6
209 0.58
210 0.51
211 0.45
212 0.43
213 0.37
214 0.32
215 0.33
216 0.27
217 0.32
218 0.33
219 0.3
220 0.32
221 0.35
222 0.36
223 0.36
224 0.39
225 0.38
226 0.41
227 0.51
228 0.49
229 0.53
230 0.57
231 0.54
232 0.52
233 0.53
234 0.51
235 0.46
236 0.47
237 0.46
238 0.49
239 0.58
240 0.65
241 0.64
242 0.62
243 0.58
244 0.57
245 0.53
246 0.49
247 0.42
248 0.4
249 0.41
250 0.44
251 0.48
252 0.44
253 0.41
254 0.35
255 0.38
256 0.31
257 0.26
258 0.24
259 0.2
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.12
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.18
276 0.17
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.13
282 0.13
283 0.15
284 0.21
285 0.23
286 0.24
287 0.27
288 0.29
289 0.31
290 0.31
291 0.28
292 0.24
293 0.23
294 0.24
295 0.28
296 0.26
297 0.24
298 0.23
299 0.21
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.22
306 0.23
307 0.26
308 0.32
309 0.42
310 0.5
311 0.52
312 0.61
313 0.66
314 0.74
315 0.79
316 0.81