FuNGI

A0A397THF3

Protein Details

Accession

A0A397THF3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-91	CKGKEFIVSKNEKKKTKKRKNYASFDDVKF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
71-81	KNEKKKTKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 5.5, cyto_mito 5.5, cyto 4.5, pero 2, E.R. 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MKVYVKGVSQKANKSDVIHELSIYGSISGGELNNNGHGFVEFVNENDAKSCIADALFVKPMCKGKEFIVSKNEKKKTKKRKNYASFDDVKFTLSSLEMGNWGGQSSIMSPNEKGKKNENEINSFPKSFTFLSEWKYPHYEKPVTICFSKAEKAYILEGLGSSSEEEKRVRISYRTLIENSHGIFLDERDGVISLYITLKQPPCLYRTIKARWVRTDDWTPTGIFGRCLVYKLTFRVGIDLIELRDEIANLKLIKPPKSQSIVRCIDKQVYPKEYFERLICRLPFRLYYKLECLVSYGILTLYELEENQLGERLESLISGTYEIEKNKLDQRLGELVNGENDEKQKLEAIAWYTLNQISIKNWNPFDVKYQDRPISIFDVAIKNFRGEFNVWHPSNPNLHLKNNSRCTWINHATITPTKIYFDDPSYEPSNRILRSYEEKSDHFLRVTFKEENFDRLFVNKDNDSDIIKRIAAIMKNGFYLAGRYYEFLAFSSSQLREQSCWFVASDGDFNANNIRAKMGILSHIKAPALYAARMGQCFTSTMGTLKLNPDQIKYIEEIRRNGFDFSDGCGTISPSLAVRAAKEHWGTKNPDDDEVPSVFQIRFGGCKGMVAVDPDLKGDVLCIRRSQRKFNAPDSSILEIVKTVKTPLSGYLNRQIILLLSTLKVPDHVFISLQEEMCRDINSIMINENKAREIAKRNVGTRETSHIKRTIISMIDAGMMKDDTIDPFLKAILECKRVYTLKSLRHKARILMPNSFLLLGVIDETGILKEGEIYIQTSTIISEHQTFEAVHNKIQRKRKVWTGPAVIARNPCLHPGDLRKVKAVNVRELSHLKNCVVFSQKGYKPLPNLLAGGDLDGDEYFVCFDERLFIPENEKPMDYDPPKRKTLERPVEIDDICEFFTDFMLNDRLGQIDNLHLAHADSNSKGVKSLGCMHLAELHSKAVDFNKTGVPVLDDLPNAGEYPDFMEIKCKDSYKSEKVLGKLYRNIKLYEYESDPILKYKNVIFPNNDFLFDGYQNYMEEAVVCRDRYNSEIRNLMRNYRVNTEAEIITAELLSIRQMDGRKSQNTRELISESVSFIIHNFRKQFLVGIQDIDSNLNDTYDAITPFNLYVPIPVNDNSKAKASAWYYITYNYPEEGNKIGLLSFPWIVSDILLSIRKDKHRTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.51
3	0.49
4	0.48
5	0.41
6	0.36
7	0.31
8	0.29
9	0.26
10	0.22
11	0.14
12	0.08
13	0.07
14	0.07
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.1
19	0.11
20	0.15
21	0.15
22	0.15
23	0.14
24	0.13
25	0.13
26	0.12
27	0.15
28	0.11
29	0.12
30	0.18
31	0.17
32	0.18
33	0.18
34	0.18
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.1
39	0.1
40	0.13
41	0.13
42	0.16
43	0.22
44	0.22
45	0.22
46	0.26
47	0.32
48	0.33
49	0.34
50	0.32
51	0.29
52	0.39
53	0.43
54	0.44
55	0.48
56	0.54
57	0.61
58	0.69
59	0.74
60	0.72
61	0.79
62	0.84
63	0.85
64	0.87
65	0.89
66	0.9
67	0.93
68	0.95
69	0.95
70	0.93
71	0.91
72	0.88
73	0.79
74	0.73
75	0.62
76	0.53
77	0.43
78	0.34
79	0.25
80	0.17
81	0.16
82	0.12
83	0.12
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.11
88	0.11
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.1
93	0.16
94	0.17
95	0.19
96	0.21
97	0.3
98	0.39
99	0.44
100	0.46
101	0.48
102	0.55
103	0.62
104	0.68
105	0.65
106	0.64
107	0.63
108	0.67
109	0.62
110	0.53
111	0.45
112	0.39
113	0.36
114	0.29
115	0.28
116	0.27
117	0.25
118	0.3
119	0.37
120	0.37
121	0.37
122	0.43
123	0.42
124	0.43
125	0.48
126	0.47
127	0.43
128	0.49
129	0.52
130	0.5
131	0.48
132	0.43
133	0.38
134	0.37
135	0.39
136	0.33
137	0.28
138	0.25
139	0.26
140	0.27
141	0.24
142	0.21
143	0.17
144	0.15
145	0.13
146	0.11
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.11
151	0.13
152	0.14
153	0.15
154	0.19
155	0.22
156	0.25
157	0.25
158	0.3
159	0.35
160	0.39
161	0.43
162	0.41
163	0.39
164	0.38
165	0.39
166	0.34
167	0.29
168	0.24
169	0.19
170	0.18
171	0.17
172	0.18
173	0.14
174	0.13
175	0.11
176	0.11
177	0.1
178	0.1
179	0.09
180	0.07
181	0.08
182	0.1
183	0.1
184	0.15
185	0.17
186	0.2
187	0.24
188	0.26
189	0.27
190	0.32
191	0.35
192	0.37
193	0.44
194	0.48
195	0.52
196	0.58
197	0.62
198	0.62
199	0.66
200	0.62
201	0.6
202	0.61
203	0.56
204	0.51
205	0.46
206	0.39
207	0.33
208	0.34
209	0.28
210	0.21
211	0.19
212	0.19
213	0.18
214	0.19
215	0.19
216	0.19
217	0.21
218	0.23
219	0.26
220	0.24
221	0.24
222	0.26
223	0.24
224	0.21
225	0.2
226	0.19
227	0.15
228	0.13
229	0.13
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.12
236	0.12
237	0.14
238	0.18
239	0.22
240	0.28
241	0.32
242	0.34
243	0.38
244	0.44
245	0.48
246	0.49
247	0.54
248	0.57
249	0.56
250	0.56
251	0.51
252	0.5
253	0.48
254	0.5
255	0.47
256	0.46
257	0.45
258	0.44
259	0.46
260	0.44
261	0.43
262	0.39
263	0.38
264	0.34
265	0.39
266	0.38
267	0.36
268	0.35
269	0.36
270	0.39
271	0.37
272	0.41
273	0.38
274	0.4
275	0.41
276	0.42
277	0.4
278	0.33
279	0.31
280	0.24
281	0.21
282	0.17
283	0.13
284	0.09
285	0.08
286	0.08
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.09
296	0.09
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.07
307	0.09
308	0.12
309	0.12
310	0.14
311	0.14
312	0.16
313	0.22
314	0.25
315	0.24
316	0.22
317	0.27
318	0.31
319	0.31
320	0.29
321	0.24
322	0.21
323	0.22
324	0.22
325	0.17
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.12
335	0.14
336	0.16
337	0.16
338	0.17
339	0.16
340	0.16
341	0.17
342	0.15
343	0.13
344	0.12
345	0.18
346	0.23
347	0.26
348	0.26
349	0.28
350	0.3
351	0.3
352	0.34
353	0.33
354	0.33
355	0.33
356	0.39
357	0.39
358	0.38
359	0.38
360	0.34
361	0.32
362	0.27
363	0.22
364	0.18
365	0.2
366	0.19
367	0.21
368	0.19
369	0.16
370	0.17
371	0.17
372	0.16
373	0.13
374	0.16
375	0.2
376	0.28
377	0.28
378	0.28
379	0.29
380	0.29
381	0.32
382	0.32
383	0.35
384	0.29
385	0.32
386	0.39
387	0.45
388	0.51
389	0.55
390	0.53
391	0.49
392	0.48
393	0.5
394	0.51
395	0.49
396	0.42
397	0.36
398	0.35
399	0.34
400	0.34
401	0.31
402	0.23
403	0.18
404	0.16
405	0.16
406	0.17
407	0.16
408	0.15
409	0.17
410	0.17
411	0.21
412	0.24
413	0.24
414	0.22
415	0.24
416	0.28
417	0.25
418	0.25
419	0.22
420	0.22
421	0.28
422	0.31
423	0.33
424	0.31
425	0.31
426	0.35
427	0.37
428	0.35
429	0.28
430	0.26
431	0.24
432	0.23
433	0.27
434	0.25
435	0.22
436	0.26
437	0.26
438	0.3
439	0.28
440	0.26
441	0.22
442	0.2
443	0.23
444	0.2
445	0.22
446	0.17
447	0.17
448	0.18
449	0.18
450	0.19
451	0.18
452	0.17
453	0.15
454	0.14
455	0.14
456	0.13
457	0.16
458	0.14
459	0.16
460	0.16
461	0.15
462	0.16
463	0.15
464	0.14
465	0.1
466	0.11
467	0.09
468	0.09
469	0.08
470	0.09
471	0.1
472	0.1
473	0.11
474	0.1
475	0.11
476	0.1
477	0.1
478	0.14
479	0.13
480	0.14
481	0.16
482	0.16
483	0.15
484	0.16
485	0.19
486	0.15
487	0.16
488	0.14
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.11
493	0.08
494	0.09
495	0.08
496	0.09
497	0.1
498	0.12
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.09
504	0.1
505	0.08
506	0.12
507	0.13
508	0.14
509	0.15
510	0.16
511	0.16
512	0.15
513	0.14
514	0.12
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.13
520	0.13
521	0.13
522	0.1
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.08
527	0.07
528	0.08
529	0.09
530	0.1
531	0.1
532	0.12
533	0.13
534	0.16
535	0.17
536	0.17
537	0.17
538	0.17
539	0.17
540	0.17
541	0.21
542	0.21
543	0.24
544	0.26
545	0.26
546	0.27
547	0.27
548	0.26
549	0.2
550	0.17
551	0.14
552	0.14
553	0.14
554	0.12
555	0.11
556	0.1
557	0.11
558	0.09
559	0.09
560	0.07
561	0.05
562	0.05
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.08
567	0.09
568	0.12
569	0.14
570	0.16
571	0.17
572	0.22
573	0.25
574	0.25
575	0.31
576	0.28
577	0.28
578	0.26
579	0.25
580	0.22
581	0.2
582	0.18
583	0.12
584	0.12
585	0.11
586	0.11
587	0.1
588	0.08
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.09
607	0.1
608	0.11
609	0.14
610	0.18
611	0.27
612	0.3
613	0.38
614	0.42
615	0.49
616	0.53
617	0.57
618	0.6
619	0.53
620	0.54
621	0.49
622	0.43
623	0.34
624	0.29
625	0.22
626	0.15
627	0.15
628	0.12
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.08
633	0.09
634	0.11
635	0.17
636	0.18
637	0.21
638	0.28
639	0.28
640	0.28
641	0.27
642	0.24
643	0.17
644	0.16
645	0.14
646	0.07
647	0.06
648	0.06
649	0.07
650	0.07
651	0.08
652	0.07
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.12
659	0.13
660	0.13
661	0.12
662	0.11
663	0.13
664	0.13
665	0.13
666	0.1
667	0.08
668	0.09
669	0.09
670	0.1
671	0.1
672	0.11
673	0.12
674	0.12
675	0.13
676	0.12
677	0.12
678	0.13
679	0.15
680	0.2
681	0.24
682	0.31
683	0.34
684	0.36
685	0.4
686	0.41
687	0.4
688	0.35
689	0.36
690	0.34
691	0.33
692	0.34
693	0.33
694	0.32
695	0.3
696	0.3
697	0.26
698	0.21
699	0.19
700	0.16
701	0.13
702	0.14
703	0.13
704	0.11
705	0.08
706	0.07
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.05
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.08
715	0.09
716	0.09
717	0.08
718	0.13
719	0.15
720	0.2
721	0.2
722	0.21
723	0.25
724	0.25
725	0.27
726	0.31
727	0.33
728	0.37
729	0.47
730	0.54
731	0.55
732	0.61
733	0.61
734	0.56
735	0.58
736	0.57
737	0.51
738	0.48
739	0.44
740	0.38
741	0.37
742	0.33
743	0.23
744	0.15
745	0.12
746	0.07
747	0.06
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.04
753	0.04
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.04
758	0.05
759	0.05
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.06
769	0.09
770	0.1
771	0.1
772	0.11
773	0.11
774	0.13
775	0.21
776	0.2
777	0.21
778	0.27
779	0.34
780	0.4
781	0.49
782	0.55
783	0.52
784	0.56
785	0.63
786	0.65
787	0.65
788	0.66
789	0.63
790	0.6
791	0.62
792	0.6
793	0.52
794	0.44
795	0.4
796	0.35
797	0.3
798	0.27
799	0.22
800	0.2
801	0.22
802	0.28
803	0.36
804	0.38
805	0.39
806	0.4
807	0.39
808	0.42
809	0.45
810	0.41
811	0.39
812	0.37
813	0.38
814	0.39
815	0.41
816	0.41
817	0.38
818	0.37
819	0.29
820	0.28
821	0.27
822	0.26
823	0.28
824	0.26
825	0.25
826	0.32
827	0.34
828	0.38
829	0.4
830	0.4
831	0.38
832	0.41
833	0.41
834	0.33
835	0.31
836	0.24
837	0.23
838	0.19
839	0.17
840	0.12
841	0.09
842	0.08
843	0.07
844	0.06
845	0.04
846	0.04
847	0.04
848	0.05
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.09
853	0.09
854	0.13
855	0.16
856	0.16
857	0.21
858	0.23
859	0.27
860	0.25
861	0.24
862	0.23
863	0.21
864	0.3
865	0.29
866	0.37
867	0.43
868	0.46
869	0.5
870	0.52
871	0.54
872	0.55
873	0.63
874	0.63
875	0.59
876	0.58
877	0.59
878	0.62
879	0.56
880	0.48
881	0.38
882	0.28
883	0.24
884	0.19
885	0.14
886	0.09
887	0.09
888	0.08
889	0.07
890	0.09
891	0.11
892	0.1
893	0.11
894	0.11
895	0.11
896	0.11
897	0.12
898	0.1
899	0.09
900	0.12
901	0.11
902	0.11
903	0.1
904	0.1
905	0.11
906	0.12
907	0.12
908	0.1
909	0.14
910	0.15
911	0.15
912	0.15
913	0.15
914	0.14
915	0.16
916	0.24
917	0.23
918	0.24
919	0.24
920	0.24
921	0.29
922	0.29
923	0.27
924	0.21
925	0.19
926	0.16
927	0.16
928	0.17
929	0.15
930	0.18
931	0.17
932	0.18
933	0.2
934	0.21
935	0.21
936	0.2
937	0.18
938	0.16
939	0.17
940	0.17
941	0.14
942	0.13
943	0.14
944	0.14
945	0.12
946	0.11
947	0.09
948	0.06
949	0.09
950	0.13
951	0.12
952	0.12
953	0.19
954	0.2
955	0.24
956	0.27
957	0.26
958	0.24
959	0.32
960	0.41
961	0.41
962	0.46
963	0.5
964	0.51
965	0.52
966	0.59
967	0.57
968	0.55
969	0.55
970	0.56
971	0.55
972	0.53
973	0.52
974	0.46
975	0.44
976	0.41
977	0.38
978	0.36
979	0.3
980	0.29
981	0.3
982	0.28
983	0.26
984	0.25
985	0.2
986	0.18
987	0.22
988	0.28
989	0.32
990	0.36
991	0.38
992	0.4
993	0.48
994	0.47
995	0.43
996	0.36
997	0.32
998	0.3
999	0.26
1000	0.24
1001	0.16
1002	0.16
1003	0.15
1004	0.15
1005	0.15
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.11
1009	0.15
1010	0.17
1011	0.17
1012	0.17
1013	0.19
1014	0.21
1015	0.23
1016	0.3
1017	0.3
1018	0.32
1019	0.39
1020	0.4
1021	0.48
1022	0.49
1023	0.51
1024	0.51
1025	0.52
1026	0.5
1027	0.48
1028	0.49
1029	0.42
1030	0.41
1031	0.39
1032	0.31
1033	0.26
1034	0.22
1035	0.17
1036	0.14
1037	0.12
1038	0.1
1039	0.06
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.1
1045	0.12
1046	0.16
1047	0.24
1048	0.31
1049	0.39
1050	0.43
1051	0.5
1052	0.54
1053	0.56
1054	0.54
1055	0.51
1056	0.47
1057	0.4
1058	0.37
1059	0.32
1060	0.25
1061	0.22
1062	0.2
1063	0.15
1064	0.13
1065	0.21
1066	0.22
1067	0.27
1068	0.28
1069	0.29
1070	0.31
1071	0.31
1072	0.34
1073	0.27
1074	0.31
1075	0.26
1076	0.26
1077	0.25
1078	0.25
1079	0.25
1080	0.23
1081	0.21
1082	0.16
1083	0.14
1084	0.12
1085	0.11
1086	0.1
1087	0.12
1088	0.13
1089	0.15
1090	0.13
1091	0.13
1092	0.15
1093	0.15
1094	0.15
1095	0.14
1096	0.11
1097	0.13
1098	0.16
1099	0.17
1100	0.19
1101	0.21
1102	0.24
1103	0.29
1104	0.32
1105	0.3
1106	0.3
1107	0.31
1108	0.29
1109	0.34
1110	0.33
1111	0.34
1112	0.33
1113	0.34
1114	0.32
1115	0.33
1116	0.35
1117	0.31
1118	0.29
1119	0.24
1120	0.24
1121	0.22
1122	0.23
1123	0.23
1124	0.22
1125	0.19
1126	0.18
1127	0.17
1128	0.15
1129	0.15
1130	0.16
1131	0.14
1132	0.13
1133	0.13
1134	0.14
1135	0.14
1136	0.13
1137	0.12
1138	0.1
1139	0.13
1140	0.18
1141	0.18
1142	0.24
1143	0.31
1144	0.39

A0A397THF3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer