FuNGI

A0A397SMN9

Protein Details

Accession

A0A397SMN9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
413-433	IKKQHTRKLLLRKKYEKFRNM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-443	RKLLLRKKYEKFRNMEKNALKEKER

Subcellular Location(s)

plas 13, mito 5, E.R. 5, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019049 Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0005643 C:nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF09531 Ndc1_Nup

Amino Acid Sequences

MSTNETPMQVSTYGLACGSTELGKTRNKFLGVSAGCVYAIIAFFRFIIYLFQGGENNCMEYSEFYVNFFLDTIIAFLKVYIIGLLPIMALRKVLIQESVRRNTPACFLDELHTLMYKKRTYITPLIYTISSIIIGWTYFDLIGTSYRRTKTMFLYPGTEDFWCPSHRKDNCKGLLPMINEHYLIALVYTTVLGIWYGCDFLLHKRYMLTFNVAEPRYPFSLPKEILIVWNCKYDIFVWSSLTTALYFSIIFWFIKLLIWNTIYEWLPNLIFLHNTSIYYWMRASWFDVQLFNRTVLSAIFTVMCWSVIDILIEHFFTRIHFTIGVYMDPHAILVNGLHSYQQPYYQQLAFLELWHIAKFDQYRRSAIYADFNRKRERAFSCVKHNNPNSAWTEISRSCMDLILGLANSAQIEIKKQHTRKLLLRKKYEKFRNMEKNALKEKERKIVGQKDLEVKMTAETMTKDRDYWGMKLLEWFHPVTGNYPYFMRKVYSFFAVPLLKRSIERRTKDVFKDLYITICAIQALTALTVKSLNEDKHGVVQNDIANVFESMLDCLMSLEQYSNKPPLDEWDIGDPFAFTYSSVLSDPLIVINVLKDALFDLRKAFYPHMDYFKLSSVHYDRLNKLLSEGL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.1
4	0.1
5	0.11
6	0.11
7	0.11
8	0.13
9	0.18
10	0.25
11	0.28
12	0.34
13	0.38
14	0.38
15	0.37
16	0.36
17	0.42
18	0.36
19	0.37
20	0.32
21	0.27
22	0.25
23	0.24
24	0.22
25	0.13
26	0.13
27	0.09
28	0.09
29	0.08
30	0.09
31	0.09
32	0.09
33	0.08
34	0.1
35	0.11
36	0.12
37	0.12
38	0.14
39	0.17
40	0.18
41	0.21
42	0.19
43	0.19
44	0.17
45	0.16
46	0.15
47	0.14
48	0.17
49	0.19
50	0.19
51	0.18
52	0.2
53	0.19
54	0.19
55	0.17
56	0.13
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.07
61	0.08
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.06
68	0.06
69	0.05
70	0.06
71	0.06
72	0.05
73	0.06
74	0.07
75	0.06
76	0.06
77	0.07
78	0.09
79	0.1
80	0.11
81	0.16
82	0.18
83	0.27
84	0.36
85	0.41
86	0.41
87	0.42
88	0.42
89	0.39
90	0.41
91	0.35
92	0.29
93	0.27
94	0.26
95	0.27
96	0.28
97	0.27
98	0.22
99	0.23
100	0.21
101	0.22
102	0.26
103	0.25
104	0.24
105	0.27
106	0.29
107	0.33
108	0.4
109	0.43
110	0.42
111	0.42
112	0.43
113	0.39
114	0.36
115	0.29
116	0.22
117	0.15
118	0.1
119	0.08
120	0.06
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.1
130	0.12
131	0.15
132	0.2
133	0.22
134	0.23
135	0.25
136	0.27
137	0.29
138	0.36
139	0.38
140	0.34
141	0.37
142	0.37
143	0.37
144	0.36
145	0.31
146	0.22
147	0.18
148	0.19
149	0.18
150	0.18
151	0.21
152	0.29
153	0.34
154	0.42
155	0.49
156	0.56
157	0.58
158	0.62
159	0.6
160	0.54
161	0.54
162	0.48
163	0.43
164	0.36
165	0.32
166	0.25
167	0.24
168	0.19
169	0.14
170	0.12
171	0.08
172	0.05
173	0.03
174	0.04
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.06
187	0.1
188	0.17
189	0.17
190	0.17
191	0.18
192	0.2
193	0.23
194	0.23
195	0.23
196	0.18
197	0.2
198	0.27
199	0.26
200	0.25
201	0.23
202	0.25
203	0.23
204	0.23
205	0.22
206	0.18
207	0.26
208	0.26
209	0.25
210	0.24
211	0.22
212	0.25
213	0.27
214	0.26
215	0.2
216	0.22
217	0.21
218	0.19
219	0.19
220	0.16
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.11
230	0.08
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.13
249	0.13
250	0.12
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.14
264	0.13
265	0.14
266	0.14
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.14
271	0.14
272	0.15
273	0.15
274	0.18
275	0.18
276	0.21
277	0.21
278	0.19
279	0.15
280	0.13
281	0.13
282	0.1
283	0.11
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.12
310	0.13
311	0.13
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.08
327	0.08
328	0.11
329	0.11
330	0.14
331	0.17
332	0.16
333	0.17
334	0.15
335	0.18
336	0.16
337	0.15
338	0.13
339	0.11
340	0.11
341	0.1
342	0.11
343	0.07
344	0.09
345	0.12
346	0.16
347	0.22
348	0.23
349	0.25
350	0.27
351	0.28
352	0.27
353	0.25
354	0.29
355	0.28
356	0.37
357	0.41
358	0.43
359	0.45
360	0.45
361	0.45
362	0.42
363	0.4
364	0.37
365	0.4
366	0.41
367	0.47
368	0.55
369	0.58
370	0.61
371	0.6
372	0.59
373	0.51
374	0.51
375	0.44
376	0.37
377	0.34
378	0.25
379	0.28
380	0.22
381	0.25
382	0.2
383	0.18
384	0.16
385	0.15
386	0.15
387	0.1
388	0.1
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.04
398	0.07
399	0.1
400	0.17
401	0.25
402	0.27
403	0.34
404	0.4
405	0.46
406	0.52
407	0.61
408	0.63
409	0.64
410	0.73
411	0.76
412	0.77
413	0.81
414	0.82
415	0.79
416	0.76
417	0.77
418	0.78
419	0.73
420	0.74
421	0.68
422	0.67
423	0.67
424	0.65
425	0.6
426	0.57
427	0.57
428	0.56
429	0.54
430	0.49
431	0.5
432	0.55
433	0.57
434	0.54
435	0.53
436	0.51
437	0.51
438	0.48
439	0.39
440	0.31
441	0.25
442	0.21
443	0.17
444	0.12
445	0.12
446	0.13
447	0.16
448	0.16
449	0.16
450	0.16
451	0.21
452	0.23
453	0.22
454	0.26
455	0.24
456	0.23
457	0.27
458	0.29
459	0.27
460	0.27
461	0.26
462	0.2
463	0.22
464	0.22
465	0.2
466	0.23
467	0.2
468	0.18
469	0.19
470	0.21
471	0.2
472	0.21
473	0.21
474	0.16
475	0.2
476	0.21
477	0.23
478	0.22
479	0.21
480	0.26
481	0.27
482	0.26
483	0.27
484	0.28
485	0.25
486	0.27
487	0.31
488	0.35
489	0.41
490	0.44
491	0.46
492	0.51
493	0.58
494	0.6
495	0.64
496	0.56
497	0.49
498	0.49
499	0.43
500	0.38
501	0.3
502	0.27
503	0.19
504	0.17
505	0.15
506	0.1
507	0.09
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.08
516	0.12
517	0.16
518	0.16
519	0.19
520	0.22
521	0.22
522	0.29
523	0.35
524	0.32
525	0.28
526	0.31
527	0.29
528	0.3
529	0.28
530	0.21
531	0.16
532	0.16
533	0.15
534	0.11
535	0.1
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.08
545	0.12
546	0.15
547	0.19
548	0.23
549	0.24
550	0.24
551	0.24
552	0.28
553	0.32
554	0.31
555	0.29
556	0.33
557	0.33
558	0.32
559	0.32
560	0.26
561	0.19
562	0.18
563	0.15
564	0.07
565	0.08
566	0.09
567	0.1
568	0.11
569	0.11
570	0.1
571	0.11
572	0.11
573	0.1
574	0.1
575	0.08
576	0.08
577	0.08
578	0.09
579	0.08
580	0.08
581	0.07
582	0.08
583	0.14
584	0.15
585	0.15
586	0.17
587	0.19
588	0.23
589	0.26
590	0.27
591	0.27
592	0.33
593	0.38
594	0.42
595	0.42
596	0.41
597	0.4
598	0.44
599	0.4
600	0.33
601	0.36
602	0.33
603	0.37
604	0.41
605	0.46
606	0.43
607	0.47
608	0.5
609	0.42

A0A397SMN9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer