Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TDM8

Protein Details
Accession A0A397TDM8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
685-710LSNRNWTTGKLRRRKKTNGEIIEEKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
696-699RRRK
Subcellular Location(s) plas 21, vacu 3, mito 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010640  Low_temperature_requirement_A  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF06772  LtrA  
Amino Acid Sequences MTEPKKSDGDNIEKIVETTSINVIENDESVGDTTKKIEKDESDNNNDEQKCIEFSKKLQVGGKNILVVNSEDYVLSGDSAPSCCIIGSPEHVAALKSKIDELKIDLTKVQEERAQMEAAAQTKSEQVAQQLDRLASELKELGHGSEDSEQTIHATVHTFGVLRKLEIIADEDDEFDYNRLWRIPRVRQYWHLDTLHREAGERASSYTELFWDLIFVAVVQNLGHILVEDVSFETVQRFIITFYPVFRIWLDVHNYLNVYSSKDILEKFLLLWEMCLLIVMGTHTSNIFQGTSAIFIISYVVARLTFFLQYFLLASWIPMFRISLTNSAWGIFIPCVLWIIAIFTPSNKTIPLLWSAIVFEVFWTAFVPVYYRYRAKKQAKIQESDLDFKKVDTATSITPHKAMRIRGTEFQWKWNELFSLFRFAEYRPAINIEHWSERYGVFAIICLGEGIFGIVYSSLNPKLDAQLAKAILALFIAYNLHWIYFDVDASRQFQHALRRHVITGVLFGLAHLPLNMALIAFGSSLRILIQLRDFPGAESIPLPDVHGLDGGGGEEVKRALPASADSTSEFPASLRWLFCVSLAISIYCMATIGMLHKGLDSVTYLRIRKEYRIALRIIVATIILLLPLSEVNSFNLVLITSMLSLILVLVETYGRLIRNQPLFGKCDDDIICDEGRRYVRWRWGLSNRNWTTGKLRRRKKTNGEIIEEKIDDNDDNDIVEEEINIVMTKKENDYEYKDESCHMPCTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.29
4 0.2
5 0.16
6 0.17
7 0.16
8 0.17
9 0.16
10 0.17
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.16
21 0.21
22 0.22
23 0.25
24 0.29
25 0.31
26 0.39
27 0.48
28 0.53
29 0.55
30 0.57
31 0.57
32 0.6
33 0.55
34 0.47
35 0.39
36 0.33
37 0.28
38 0.29
39 0.32
40 0.27
41 0.3
42 0.4
43 0.42
44 0.44
45 0.47
46 0.49
47 0.5
48 0.53
49 0.52
50 0.46
51 0.43
52 0.39
53 0.34
54 0.29
55 0.25
56 0.19
57 0.17
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.14
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.19
80 0.2
81 0.21
82 0.19
83 0.16
84 0.18
85 0.2
86 0.21
87 0.22
88 0.24
89 0.29
90 0.29
91 0.29
92 0.28
93 0.27
94 0.31
95 0.3
96 0.29
97 0.23
98 0.23
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.18
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.15
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.15
114 0.22
115 0.22
116 0.25
117 0.26
118 0.26
119 0.24
120 0.24
121 0.22
122 0.15
123 0.16
124 0.14
125 0.11
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.17
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.13
138 0.14
139 0.12
140 0.08
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.19
169 0.27
170 0.36
171 0.44
172 0.5
173 0.54
174 0.6
175 0.67
176 0.66
177 0.65
178 0.59
179 0.52
180 0.5
181 0.49
182 0.45
183 0.36
184 0.31
185 0.25
186 0.25
187 0.25
188 0.21
189 0.17
190 0.15
191 0.16
192 0.16
193 0.15
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.19
237 0.22
238 0.21
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.19
243 0.2
244 0.16
245 0.14
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.05
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.1
309 0.11
310 0.13
311 0.13
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.07
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.1
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.1
357 0.12
358 0.16
359 0.18
360 0.24
361 0.34
362 0.4
363 0.46
364 0.52
365 0.59
366 0.61
367 0.62
368 0.59
369 0.55
370 0.5
371 0.47
372 0.4
373 0.33
374 0.27
375 0.24
376 0.24
377 0.17
378 0.15
379 0.11
380 0.12
381 0.11
382 0.14
383 0.16
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.18
388 0.2
389 0.21
390 0.23
391 0.27
392 0.3
393 0.32
394 0.35
395 0.41
396 0.38
397 0.43
398 0.39
399 0.36
400 0.33
401 0.3
402 0.27
403 0.18
404 0.21
405 0.15
406 0.2
407 0.18
408 0.18
409 0.18
410 0.17
411 0.24
412 0.22
413 0.21
414 0.15
415 0.18
416 0.18
417 0.18
418 0.21
419 0.16
420 0.19
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.17
425 0.17
426 0.15
427 0.12
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.02
440 0.02
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.06
445 0.07
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.11
450 0.15
451 0.15
452 0.14
453 0.18
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.15
458 0.11
459 0.1
460 0.09
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.04
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.1
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.13
480 0.15
481 0.24
482 0.29
483 0.34
484 0.35
485 0.37
486 0.37
487 0.36
488 0.35
489 0.26
490 0.2
491 0.14
492 0.11
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.11
517 0.13
518 0.15
519 0.17
520 0.17
521 0.15
522 0.17
523 0.15
524 0.14
525 0.11
526 0.11
527 0.1
528 0.1
529 0.11
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.12
550 0.13
551 0.14
552 0.15
553 0.16
554 0.17
555 0.17
556 0.15
557 0.11
558 0.11
559 0.13
560 0.15
561 0.13
562 0.14
563 0.15
564 0.15
565 0.16
566 0.17
567 0.14
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.12
573 0.12
574 0.08
575 0.08
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.08
581 0.08
582 0.09
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.14
590 0.2
591 0.21
592 0.23
593 0.29
594 0.31
595 0.34
596 0.4
597 0.43
598 0.45
599 0.49
600 0.49
601 0.44
602 0.44
603 0.41
604 0.33
605 0.25
606 0.16
607 0.11
608 0.1
609 0.08
610 0.05
611 0.04
612 0.03
613 0.04
614 0.04
615 0.05
616 0.06
617 0.07
618 0.08
619 0.1
620 0.11
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.05
631 0.05
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.04
639 0.05
640 0.07
641 0.08
642 0.09
643 0.13
644 0.21
645 0.26
646 0.3
647 0.35
648 0.37
649 0.4
650 0.4
651 0.41
652 0.34
653 0.35
654 0.32
655 0.28
656 0.27
657 0.27
658 0.27
659 0.23
660 0.23
661 0.22
662 0.24
663 0.25
664 0.27
665 0.31
666 0.39
667 0.46
668 0.51
669 0.54
670 0.62
671 0.69
672 0.72
673 0.76
674 0.69
675 0.69
676 0.65
677 0.59
678 0.58
679 0.57
680 0.6
681 0.59
682 0.67
683 0.7
684 0.78
685 0.86
686 0.87
687 0.89
688 0.89
689 0.88
690 0.86
691 0.81
692 0.75
693 0.7
694 0.6
695 0.49
696 0.39
697 0.32
698 0.24
699 0.2
700 0.18
701 0.13
702 0.12
703 0.13
704 0.13
705 0.11
706 0.11
707 0.1
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.07
713 0.08
714 0.11
715 0.14
716 0.16
717 0.2
718 0.23
719 0.29
720 0.36
721 0.41
722 0.44
723 0.45
724 0.43
725 0.41
726 0.42
727 0.39