Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TC20

Protein Details
Accession A0A397TC20    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MRGGRRRSRERQPERRTDGDDGBasic
114-147GTIKNYSERVKQKKSKPVDKHKPVDKPKPADKPIBasic
496-526SSFSESTKEGGKKKKQKKQKAKTVLFHVGQKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-142KQKKSKPVDKHKPVDKPKP
504-517EGGKKKKQKKQKAK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 13.166, cyto_nucl 10.833, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044288  ZNF598/Hel2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
Amino Acid Sequences MRGGRRRSRERQPERRTDGDDGVMVIEEVTRQTRNLNIDSTPSAVNGTTFNARTVRPPPGFGVLSPEEAIGSADESPENEVELRNVAHTSPRIRAEDFPTLSDAMRVNTSNNSGTIKNYSERVKQKKSKPVDKHKPVDKPKPADKPIQSVASSSRSETPLNFNSHQQTMYGSANKGKTPAFPPLPSANQSTSASSSGSSSSLNYREKALSNPFDSENSSRNSQFHQRISTFLSNNPAKMEDFKSFTTAYNNSILDASSYIEELSLLFNKKKDIGKVVSGLVEILEGEKKKTDLLRAWHDHKAKQTDDFPALEPPYSPISSMTNNSKPNITSPKSPKPSPRVLVIKSSTNRSGGGTKASSGPRVWDKIAAIAESKIKEKNNSAFPSLSSAVNNSSNDVWRGSVPKFVQSPPRSESTSSSVNNSPAATNISSFTTTFVKGRPTKAENEEFPGLPLTPKSSHSQQRYNNNVPEKSAWGQGGAFTVSDNSKNENDSEDDSSFSESTKEGGKKKKQKKQKAKTVLFHVGQKNIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.87
3 0.82
4 0.76
5 0.69
6 0.6
7 0.5
8 0.4
9 0.32
10 0.25
11 0.19
12 0.13
13 0.09
14 0.07
15 0.08
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.14
20 0.19
21 0.24
22 0.27
23 0.28
24 0.26
25 0.3
26 0.31
27 0.32
28 0.27
29 0.22
30 0.2
31 0.17
32 0.17
33 0.13
34 0.15
35 0.18
36 0.18
37 0.2
38 0.22
39 0.22
40 0.27
41 0.3
42 0.36
43 0.33
44 0.35
45 0.35
46 0.39
47 0.39
48 0.34
49 0.37
50 0.29
51 0.3
52 0.28
53 0.25
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.1
58 0.09
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.16
75 0.2
76 0.22
77 0.26
78 0.31
79 0.33
80 0.34
81 0.38
82 0.4
83 0.45
84 0.42
85 0.38
86 0.35
87 0.33
88 0.31
89 0.29
90 0.23
91 0.15
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.17
96 0.2
97 0.18
98 0.19
99 0.2
100 0.18
101 0.2
102 0.22
103 0.23
104 0.22
105 0.25
106 0.29
107 0.34
108 0.44
109 0.51
110 0.58
111 0.64
112 0.71
113 0.76
114 0.82
115 0.84
116 0.85
117 0.87
118 0.87
119 0.88
120 0.89
121 0.87
122 0.87
123 0.87
124 0.86
125 0.84
126 0.81
127 0.8
128 0.81
129 0.77
130 0.75
131 0.69
132 0.65
133 0.6
134 0.57
135 0.48
136 0.39
137 0.39
138 0.35
139 0.32
140 0.27
141 0.26
142 0.23
143 0.24
144 0.24
145 0.27
146 0.28
147 0.34
148 0.33
149 0.33
150 0.35
151 0.35
152 0.34
153 0.27
154 0.22
155 0.2
156 0.22
157 0.21
158 0.18
159 0.22
160 0.23
161 0.23
162 0.24
163 0.21
164 0.22
165 0.22
166 0.29
167 0.28
168 0.27
169 0.31
170 0.33
171 0.35
172 0.34
173 0.34
174 0.28
175 0.27
176 0.28
177 0.25
178 0.22
179 0.2
180 0.18
181 0.15
182 0.14
183 0.11
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.11
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.2
192 0.21
193 0.22
194 0.25
195 0.28
196 0.26
197 0.26
198 0.27
199 0.26
200 0.25
201 0.27
202 0.25
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.21
208 0.24
209 0.29
210 0.33
211 0.33
212 0.35
213 0.33
214 0.34
215 0.39
216 0.4
217 0.33
218 0.29
219 0.33
220 0.29
221 0.28
222 0.27
223 0.23
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.19
237 0.18
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.16
257 0.18
258 0.18
259 0.21
260 0.22
261 0.24
262 0.25
263 0.25
264 0.21
265 0.19
266 0.17
267 0.11
268 0.09
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.14
279 0.17
280 0.22
281 0.3
282 0.35
283 0.4
284 0.45
285 0.46
286 0.45
287 0.47
288 0.47
289 0.39
290 0.37
291 0.35
292 0.32
293 0.32
294 0.3
295 0.25
296 0.24
297 0.23
298 0.2
299 0.17
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.11
305 0.14
306 0.15
307 0.18
308 0.23
309 0.26
310 0.28
311 0.29
312 0.29
313 0.27
314 0.3
315 0.36
316 0.32
317 0.35
318 0.41
319 0.5
320 0.54
321 0.58
322 0.61
323 0.59
324 0.65
325 0.59
326 0.59
327 0.56
328 0.52
329 0.55
330 0.5
331 0.5
332 0.44
333 0.46
334 0.4
335 0.34
336 0.33
337 0.27
338 0.27
339 0.2
340 0.22
341 0.18
342 0.17
343 0.22
344 0.22
345 0.23
346 0.2
347 0.24
348 0.24
349 0.26
350 0.26
351 0.23
352 0.22
353 0.24
354 0.25
355 0.21
356 0.18
357 0.16
358 0.19
359 0.18
360 0.2
361 0.2
362 0.21
363 0.24
364 0.28
365 0.34
366 0.39
367 0.41
368 0.42
369 0.38
370 0.37
371 0.39
372 0.35
373 0.29
374 0.21
375 0.19
376 0.19
377 0.22
378 0.22
379 0.18
380 0.18
381 0.19
382 0.19
383 0.19
384 0.16
385 0.14
386 0.18
387 0.17
388 0.22
389 0.21
390 0.26
391 0.28
392 0.3
393 0.39
394 0.38
395 0.43
396 0.39
397 0.43
398 0.4
399 0.39
400 0.39
401 0.34
402 0.39
403 0.34
404 0.35
405 0.34
406 0.33
407 0.33
408 0.29
409 0.24
410 0.18
411 0.21
412 0.17
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.16
417 0.15
418 0.17
419 0.15
420 0.17
421 0.17
422 0.18
423 0.25
424 0.29
425 0.33
426 0.39
427 0.4
428 0.46
429 0.52
430 0.57
431 0.51
432 0.53
433 0.52
434 0.44
435 0.41
436 0.36
437 0.28
438 0.22
439 0.21
440 0.18
441 0.17
442 0.2
443 0.25
444 0.32
445 0.4
446 0.47
447 0.55
448 0.59
449 0.67
450 0.74
451 0.77
452 0.76
453 0.75
454 0.69
455 0.63
456 0.58
457 0.53
458 0.45
459 0.41
460 0.34
461 0.27
462 0.26
463 0.23
464 0.22
465 0.17
466 0.15
467 0.1
468 0.13
469 0.13
470 0.17
471 0.17
472 0.19
473 0.21
474 0.23
475 0.23
476 0.24
477 0.25
478 0.26
479 0.3
480 0.26
481 0.26
482 0.25
483 0.28
484 0.24
485 0.21
486 0.19
487 0.13
488 0.14
489 0.21
490 0.27
491 0.31
492 0.42
493 0.52
494 0.62
495 0.73
496 0.81
497 0.84
498 0.89
499 0.93
500 0.94
501 0.94
502 0.95
503 0.94
504 0.93
505 0.91
506 0.89
507 0.82
508 0.79
509 0.74