Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TJC9

Protein Details
Accession A0A397TJC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-62YLPDQKSSTKIKRPPNSNIIYHydrophilic
76-95GKFCDKHRINKQKLLPLSKKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MTQNLNELAIQVNNENKDELNNLLSSLREAIDKNGMPTTKDYLPDQKSSTKIKRPPNSNIIYTNLLNKFGFLYIIGKFCDKHRINKQKLLPLSKKVSKILWEELPERYQKFFKELASILRKKHKNLYPDYIYKPKRNRNDYSTFKPYELKTKTTPIKSIPGHKNEQLISINNLISTYKSYEQMEEEDTDYSDSSVDELSIAESIFDGFAIPSSTLFPSNDFNNDSEEVIRNSICWSDVLEARLCELYMKDDIVDIFWGRLIEDHIAESTTWNVYVITRGLHHPYTKTEIIEDGQIIHFIAEEAKFANTIDPLPSSIEIPQDLKEKFDEALDNELGISFREAHYNLVGISTGYKRIKGQLTEIPAIILYVRQKGILRRGCDGIFPKEICGFPVDVIEACAAVPCAGSGIDSCRRYQGDVKLGSSIGVGSEEENITGTLSAVVYDNLSCKVGIISCEHVLKFNKSDSRKDIAIYQPSYNDLFEPKKRLVELRRLLKEPEIKEDDIESITDDIEIEERKLTKAMKKDSTLATYVRGMRENFIINNKKYGIDAGFCDFNNGNRTLCPTKFTIPSNYFEDAGFSTCLEGTYTYDELKNFNYDTRVFKVGRTTGLTLGQLLPTDQAIACNLTNESIKNAKKLAMEKHVPCYNNTDQKIFVGYMKSHLDSEIRQTRKKCYPVEWFDRQLAFRFELGEFECGDSGASIVDKKGKALGILHAKWITSYQTFGIVSPYFAVLEALNVRMCYSSNSISPTIISSSITLSSSSSYSFSSSSSSSTFNLKQYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.21
4 0.22
5 0.23
6 0.22
7 0.2
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.18
18 0.25
19 0.26
20 0.27
21 0.31
22 0.31
23 0.3
24 0.32
25 0.35
26 0.3
27 0.32
28 0.34
29 0.38
30 0.42
31 0.45
32 0.47
33 0.47
34 0.49
35 0.56
36 0.62
37 0.62
38 0.65
39 0.71
40 0.76
41 0.78
42 0.81
43 0.81
44 0.78
45 0.74
46 0.69
47 0.63
48 0.58
49 0.51
50 0.5
51 0.41
52 0.38
53 0.33
54 0.29
55 0.26
56 0.22
57 0.21
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.18
65 0.2
66 0.3
67 0.3
68 0.38
69 0.47
70 0.57
71 0.63
72 0.71
73 0.77
74 0.75
75 0.8
76 0.8
77 0.76
78 0.73
79 0.75
80 0.73
81 0.7
82 0.64
83 0.59
84 0.55
85 0.54
86 0.51
87 0.47
88 0.45
89 0.43
90 0.44
91 0.45
92 0.44
93 0.4
94 0.38
95 0.36
96 0.33
97 0.35
98 0.35
99 0.31
100 0.32
101 0.32
102 0.38
103 0.45
104 0.48
105 0.49
106 0.56
107 0.59
108 0.57
109 0.65
110 0.61
111 0.6
112 0.63
113 0.67
114 0.65
115 0.67
116 0.7
117 0.7
118 0.71
119 0.71
120 0.73
121 0.73
122 0.74
123 0.76
124 0.77
125 0.75
126 0.78
127 0.78
128 0.77
129 0.76
130 0.68
131 0.62
132 0.59
133 0.53
134 0.53
135 0.49
136 0.45
137 0.4
138 0.48
139 0.54
140 0.53
141 0.55
142 0.49
143 0.54
144 0.53
145 0.59
146 0.59
147 0.58
148 0.59
149 0.58
150 0.59
151 0.5
152 0.51
153 0.43
154 0.36
155 0.33
156 0.3
157 0.27
158 0.21
159 0.21
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.16
164 0.15
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.21
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.12
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.15
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.2
210 0.2
211 0.19
212 0.18
213 0.19
214 0.17
215 0.16
216 0.15
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.11
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.25
272 0.25
273 0.24
274 0.21
275 0.2
276 0.19
277 0.19
278 0.16
279 0.11
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.15
315 0.11
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.05
335 0.07
336 0.07
337 0.12
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.19
342 0.22
343 0.21
344 0.25
345 0.23
346 0.27
347 0.27
348 0.27
349 0.22
350 0.18
351 0.17
352 0.13
353 0.11
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.14
360 0.23
361 0.26
362 0.27
363 0.27
364 0.29
365 0.28
366 0.3
367 0.3
368 0.25
369 0.24
370 0.22
371 0.2
372 0.2
373 0.2
374 0.18
375 0.16
376 0.13
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.07
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.17
399 0.18
400 0.2
401 0.24
402 0.26
403 0.28
404 0.29
405 0.29
406 0.27
407 0.27
408 0.25
409 0.2
410 0.15
411 0.07
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.11
440 0.12
441 0.14
442 0.14
443 0.18
444 0.19
445 0.2
446 0.2
447 0.22
448 0.27
449 0.29
450 0.34
451 0.35
452 0.38
453 0.36
454 0.35
455 0.35
456 0.34
457 0.38
458 0.35
459 0.31
460 0.27
461 0.28
462 0.28
463 0.23
464 0.18
465 0.15
466 0.18
467 0.2
468 0.24
469 0.24
470 0.25
471 0.26
472 0.32
473 0.33
474 0.39
475 0.44
476 0.49
477 0.52
478 0.51
479 0.52
480 0.51
481 0.52
482 0.43
483 0.43
484 0.38
485 0.34
486 0.32
487 0.32
488 0.28
489 0.21
490 0.2
491 0.13
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.12
504 0.15
505 0.18
506 0.26
507 0.33
508 0.37
509 0.39
510 0.43
511 0.44
512 0.44
513 0.42
514 0.34
515 0.29
516 0.27
517 0.28
518 0.25
519 0.25
520 0.23
521 0.22
522 0.23
523 0.23
524 0.21
525 0.27
526 0.33
527 0.3
528 0.34
529 0.33
530 0.31
531 0.29
532 0.3
533 0.22
534 0.16
535 0.17
536 0.16
537 0.17
538 0.17
539 0.2
540 0.18
541 0.19
542 0.21
543 0.21
544 0.19
545 0.17
546 0.23
547 0.25
548 0.25
549 0.25
550 0.24
551 0.27
552 0.31
553 0.34
554 0.37
555 0.35
556 0.39
557 0.41
558 0.39
559 0.35
560 0.31
561 0.29
562 0.21
563 0.2
564 0.16
565 0.11
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.09
570 0.08
571 0.08
572 0.11
573 0.13
574 0.13
575 0.15
576 0.15
577 0.16
578 0.18
579 0.19
580 0.16
581 0.17
582 0.19
583 0.2
584 0.24
585 0.27
586 0.31
587 0.28
588 0.29
589 0.34
590 0.33
591 0.34
592 0.33
593 0.31
594 0.28
595 0.3
596 0.29
597 0.23
598 0.21
599 0.18
600 0.14
601 0.13
602 0.11
603 0.08
604 0.1
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.11
609 0.1
610 0.11
611 0.11
612 0.11
613 0.13
614 0.13
615 0.16
616 0.22
617 0.23
618 0.25
619 0.27
620 0.29
621 0.32
622 0.38
623 0.4
624 0.42
625 0.48
626 0.48
627 0.55
628 0.57
629 0.53
630 0.49
631 0.49
632 0.49
633 0.5
634 0.49
635 0.43
636 0.38
637 0.39
638 0.4
639 0.33
640 0.27
641 0.22
642 0.2
643 0.23
644 0.25
645 0.25
646 0.23
647 0.23
648 0.23
649 0.2
650 0.29
651 0.34
652 0.36
653 0.41
654 0.43
655 0.5
656 0.57
657 0.63
658 0.59
659 0.58
660 0.63
661 0.67
662 0.73
663 0.72
664 0.68
665 0.65
666 0.64
667 0.57
668 0.51
669 0.45
670 0.38
671 0.31
672 0.29
673 0.24
674 0.23
675 0.24
676 0.21
677 0.18
678 0.17
679 0.16
680 0.14
681 0.14
682 0.1
683 0.08
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.09
688 0.15
689 0.15
690 0.16
691 0.2
692 0.2
693 0.21
694 0.22
695 0.29
696 0.32
697 0.33
698 0.38
699 0.35
700 0.34
701 0.33
702 0.32
703 0.29
704 0.2
705 0.21
706 0.16
707 0.2
708 0.21
709 0.2
710 0.24
711 0.2
712 0.19
713 0.18
714 0.18
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.08
719 0.11
720 0.12
721 0.13
722 0.13
723 0.13
724 0.14
725 0.13
726 0.14
727 0.15
728 0.18
729 0.2
730 0.21
731 0.26
732 0.27
733 0.27
734 0.27
735 0.25
736 0.22
737 0.2
738 0.18
739 0.14
740 0.15
741 0.16
742 0.16
743 0.15
744 0.13
745 0.14
746 0.14
747 0.15
748 0.14
749 0.13
750 0.14
751 0.14
752 0.14
753 0.16
754 0.16
755 0.18
756 0.19
757 0.2
758 0.2
759 0.27
760 0.3