Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SSN2

Protein Details
Accession A0A397SSN2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSNKEKTFKKRKFIPSPQPSPSKIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024738  Hfi1/Tada1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF12767  SAGA-Tad1  
Amino Acid Sequences MSNKEKTFKKRKFIPSPQPSPSKIISSSLTPTSCSLWSAHQQRKEPREDQKIQIITPIITSTELLPINSTIPQTVTTPEISSNKKAAQVDPISLKNSLDEALEVNKEKYWLLIQSFIKGEINKNELDFYVHSLLPKEHVHLHDEFIRASIKLKNTRRYQDDVKNVTFSASSSQKEKFLKKIMSSMGKEERDKLHVILESAQNNQGIVHTNSNLMLFEKKFPKYTTIDEDFVDLPTLTPPSLTTLSSINEEEDGFSEFNSVYTKMTEIALDNGLICGVTEDCANLMIYALETHLKNIVHSCINKIRSNEFHDETEKISNSPISLRDLAFSLEISPYILVNNNFILEKILVKINQKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.9
3 0.91
4 0.89
5 0.86
6 0.78
7 0.72
8 0.65
9 0.58
10 0.49
11 0.44
12 0.38
13 0.34
14 0.35
15 0.35
16 0.32
17 0.28
18 0.28
19 0.27
20 0.26
21 0.23
22 0.2
23 0.2
24 0.29
25 0.37
26 0.43
27 0.48
28 0.55
29 0.63
30 0.7
31 0.73
32 0.71
33 0.72
34 0.75
35 0.74
36 0.71
37 0.7
38 0.65
39 0.57
40 0.53
41 0.45
42 0.35
43 0.29
44 0.25
45 0.16
46 0.14
47 0.14
48 0.11
49 0.14
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.16
56 0.15
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.18
66 0.22
67 0.25
68 0.28
69 0.3
70 0.29
71 0.33
72 0.34
73 0.31
74 0.34
75 0.32
76 0.33
77 0.34
78 0.34
79 0.31
80 0.3
81 0.29
82 0.21
83 0.19
84 0.16
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.2
100 0.2
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.24
105 0.21
106 0.23
107 0.2
108 0.22
109 0.2
110 0.19
111 0.19
112 0.17
113 0.18
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.17
123 0.15
124 0.16
125 0.17
126 0.2
127 0.2
128 0.22
129 0.22
130 0.23
131 0.21
132 0.17
133 0.17
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.18
138 0.26
139 0.33
140 0.4
141 0.46
142 0.52
143 0.55
144 0.57
145 0.59
146 0.58
147 0.61
148 0.58
149 0.52
150 0.47
151 0.43
152 0.37
153 0.29
154 0.21
155 0.16
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.21
161 0.25
162 0.28
163 0.28
164 0.31
165 0.34
166 0.32
167 0.35
168 0.35
169 0.37
170 0.36
171 0.36
172 0.37
173 0.37
174 0.36
175 0.35
176 0.32
177 0.28
178 0.28
179 0.24
180 0.2
181 0.17
182 0.17
183 0.17
184 0.19
185 0.18
186 0.18
187 0.19
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.15
204 0.2
205 0.22
206 0.24
207 0.25
208 0.29
209 0.29
210 0.33
211 0.35
212 0.35
213 0.35
214 0.32
215 0.33
216 0.29
217 0.25
218 0.22
219 0.14
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.16
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.11
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.17
283 0.2
284 0.23
285 0.24
286 0.3
287 0.34
288 0.39
289 0.43
290 0.44
291 0.47
292 0.47
293 0.53
294 0.54
295 0.5
296 0.48
297 0.47
298 0.45
299 0.41
300 0.41
301 0.35
302 0.28
303 0.26
304 0.23
305 0.21
306 0.23
307 0.22
308 0.22
309 0.23
310 0.23
311 0.22
312 0.22
313 0.23
314 0.2
315 0.18
316 0.14
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.16
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.18
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.2
335 0.22