Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397S4R8

Protein Details
Accession A0A397S4R8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-65SDEQQRFTKRPRQQDQPDNTLSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences TTTAPAKSPVPKSLTTSQVNETTSLDKDKEIIAQTYGTSSNSASDEQQRFTKRPRQQDQPDNTLSGNNTTSSSSSSFPPCDHDQEDASTSSNASRSKIQNLTKIFAKFSTYTGVAIRIIKKLNKGKYMCIFFLDENDLLDAIKLPITKSSKASLPVTENPNNNTAPEDHTDQPNPDLDTPPQFYFQKFSDTVPADDPNATNAKSIFIPRNPISYKPLNFAYINYESEDAKQKAMKTNYKLNGRDLFWCTENARTCNRCGSPSHLFNECPHRKPRSYAEAARSSKNDRSRDHNPSAKANGNNSQHQHSFQQSRTTLSSSKLNGGTQQGGSMHGAQTEKFTAMYNEILKLMEQINSRISSIDKKIFMLEKYTSKQPESLSPHAHELRAKNSNIPSISDPVVENTVSSSSSVTESQESPVDIEALKKESSEMRSLTNTCVNILKQMQSYMGMDNPDDDADPENFEDYDRDGDEDDNMETEEFDKDGYLLNPTDDALNKLAENWGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.53
3 0.52
4 0.49
5 0.5
6 0.48
7 0.43
8 0.38
9 0.33
10 0.3
11 0.31
12 0.27
13 0.22
14 0.22
15 0.22
16 0.25
17 0.25
18 0.24
19 0.21
20 0.21
21 0.21
22 0.22
23 0.22
24 0.18
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.17
30 0.18
31 0.26
32 0.29
33 0.31
34 0.38
35 0.41
36 0.43
37 0.5
38 0.57
39 0.55
40 0.63
41 0.68
42 0.72
43 0.77
44 0.83
45 0.83
46 0.82
47 0.77
48 0.68
49 0.6
50 0.52
51 0.43
52 0.36
53 0.28
54 0.21
55 0.18
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.19
60 0.17
61 0.19
62 0.23
63 0.23
64 0.23
65 0.28
66 0.29
67 0.33
68 0.33
69 0.33
70 0.3
71 0.31
72 0.33
73 0.28
74 0.25
75 0.2
76 0.18
77 0.17
78 0.19
79 0.18
80 0.18
81 0.24
82 0.26
83 0.33
84 0.41
85 0.44
86 0.47
87 0.49
88 0.51
89 0.5
90 0.48
91 0.42
92 0.35
93 0.34
94 0.28
95 0.26
96 0.26
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.21
101 0.18
102 0.21
103 0.22
104 0.22
105 0.26
106 0.27
107 0.35
108 0.42
109 0.46
110 0.51
111 0.51
112 0.54
113 0.58
114 0.6
115 0.52
116 0.46
117 0.42
118 0.33
119 0.34
120 0.3
121 0.22
122 0.17
123 0.17
124 0.14
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.14
133 0.18
134 0.2
135 0.22
136 0.24
137 0.26
138 0.29
139 0.31
140 0.29
141 0.31
142 0.35
143 0.4
144 0.42
145 0.41
146 0.39
147 0.41
148 0.37
149 0.32
150 0.27
151 0.21
152 0.19
153 0.2
154 0.23
155 0.21
156 0.24
157 0.26
158 0.25
159 0.25
160 0.24
161 0.23
162 0.2
163 0.2
164 0.18
165 0.21
166 0.24
167 0.23
168 0.25
169 0.24
170 0.23
171 0.24
172 0.23
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.25
177 0.26
178 0.26
179 0.26
180 0.26
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.15
192 0.17
193 0.16
194 0.22
195 0.23
196 0.29
197 0.29
198 0.3
199 0.33
200 0.35
201 0.35
202 0.32
203 0.33
204 0.29
205 0.28
206 0.26
207 0.26
208 0.22
209 0.22
210 0.19
211 0.19
212 0.16
213 0.18
214 0.24
215 0.19
216 0.17
217 0.19
218 0.19
219 0.25
220 0.32
221 0.36
222 0.33
223 0.41
224 0.47
225 0.52
226 0.52
227 0.5
228 0.48
229 0.43
230 0.43
231 0.37
232 0.32
233 0.25
234 0.25
235 0.22
236 0.22
237 0.23
238 0.22
239 0.25
240 0.25
241 0.25
242 0.29
243 0.29
244 0.26
245 0.25
246 0.29
247 0.3
248 0.33
249 0.34
250 0.31
251 0.31
252 0.31
253 0.41
254 0.39
255 0.36
256 0.38
257 0.41
258 0.4
259 0.44
260 0.48
261 0.46
262 0.48
263 0.49
264 0.5
265 0.54
266 0.55
267 0.53
268 0.49
269 0.44
270 0.43
271 0.45
272 0.44
273 0.37
274 0.42
275 0.48
276 0.54
277 0.57
278 0.57
279 0.52
280 0.51
281 0.53
282 0.51
283 0.45
284 0.4
285 0.4
286 0.38
287 0.41
288 0.38
289 0.38
290 0.34
291 0.33
292 0.33
293 0.31
294 0.32
295 0.29
296 0.35
297 0.31
298 0.33
299 0.33
300 0.33
301 0.29
302 0.27
303 0.3
304 0.24
305 0.27
306 0.26
307 0.24
308 0.24
309 0.24
310 0.24
311 0.19
312 0.19
313 0.15
314 0.14
315 0.15
316 0.14
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.13
337 0.13
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.19
345 0.23
346 0.27
347 0.24
348 0.24
349 0.27
350 0.3
351 0.29
352 0.28
353 0.27
354 0.28
355 0.31
356 0.37
357 0.37
358 0.35
359 0.37
360 0.34
361 0.39
362 0.41
363 0.43
364 0.42
365 0.41
366 0.47
367 0.46
368 0.46
369 0.41
370 0.37
371 0.38
372 0.4
373 0.38
374 0.37
375 0.38
376 0.41
377 0.38
378 0.38
379 0.33
380 0.3
381 0.3
382 0.26
383 0.23
384 0.2
385 0.21
386 0.17
387 0.14
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.09
393 0.08
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.17
401 0.17
402 0.16
403 0.15
404 0.15
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.15
409 0.15
410 0.14
411 0.16
412 0.2
413 0.23
414 0.26
415 0.25
416 0.26
417 0.31
418 0.33
419 0.35
420 0.35
421 0.32
422 0.28
423 0.31
424 0.28
425 0.28
426 0.29
427 0.29
428 0.25
429 0.26
430 0.26
431 0.24
432 0.25
433 0.21
434 0.21
435 0.18
436 0.17
437 0.17
438 0.17
439 0.15
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.15
445 0.14
446 0.15
447 0.14
448 0.14
449 0.15
450 0.14
451 0.16
452 0.15
453 0.15
454 0.15
455 0.16
456 0.17
457 0.17
458 0.15
459 0.13
460 0.13
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.11
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.11
470 0.11
471 0.14
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.18
477 0.17
478 0.19
479 0.17
480 0.18
481 0.17
482 0.18