Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397S3C0

Protein Details
Accession A0A397S3C0    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-140DSGKITSEKKRRQAPIKQSIIHydrophilic
476-498AEANKNEPQQKRQNKAKQPEIVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-258RRQIADKPKIASIERPRR
401-426GKGKSGKKKKSAAVKAKTPITRRKTA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044198  DEK  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS50800  SAP  
Amino Acid Sequences MASQTQEIVRVANITNDTTENTSAMESHWQELIAATEITADNAQDTKVNKMNGNTSTESSNTTERQKSSPIGINFIQQAQDDGQASVIIFESSISSKPKIAITACREKKYNDEDTVNKKDSGKITSEKKRRQAPIKQSIIPEIQALGSTNETSATSRTSKKRKTEPYISAVTFRAKEKSEVSKRASVTIGEKRYKLVADTIAFSQDFASEMPPPQSDEQENNNEAEVAEYSFNGDITTKRRRQIADKPKIASIERPRRSIRPVIPYGSEAAEQKVRNKKPVEISQGSGLPLSQIPHVLRAIDKMKTGDDVLKGLHKLIYGRMGSKHDIKNHIRSFSGFKIQTPLDEIVLKEKLEKWKIAGLKEMCHLFGLKSSGDKQKVVDRVYDFLKNPRDMTAPNEENGKGKSGKKKKSAAVKAKTPITRRKTARDIFKSEQRIVYKEKAENHSKTRAEVDSLLAEAWKGLTEDDKKSYVEKAAEANKNEPQQKRQNKAKQPEIVEDSDLSEEEFEDPVMHEGEVEKQKDEQPKDTDIVDSNSDFSDPPGDNEDADTEEDNAMEVDLDKSVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.22
6 0.22
7 0.18
8 0.17
9 0.16
10 0.14
11 0.14
12 0.2
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.19
19 0.2
20 0.14
21 0.12
22 0.1
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.19
34 0.24
35 0.28
36 0.29
37 0.32
38 0.39
39 0.39
40 0.44
41 0.4
42 0.36
43 0.35
44 0.33
45 0.33
46 0.29
47 0.3
48 0.28
49 0.32
50 0.36
51 0.37
52 0.39
53 0.4
54 0.4
55 0.42
56 0.46
57 0.41
58 0.4
59 0.39
60 0.39
61 0.36
62 0.35
63 0.3
64 0.21
65 0.22
66 0.18
67 0.2
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.11
74 0.1
75 0.07
76 0.05
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.17
84 0.19
85 0.2
86 0.23
87 0.25
88 0.31
89 0.35
90 0.45
91 0.5
92 0.52
93 0.53
94 0.5
95 0.55
96 0.54
97 0.54
98 0.49
99 0.48
100 0.51
101 0.58
102 0.64
103 0.59
104 0.54
105 0.47
106 0.46
107 0.44
108 0.41
109 0.38
110 0.37
111 0.43
112 0.51
113 0.61
114 0.64
115 0.68
116 0.74
117 0.77
118 0.79
119 0.8
120 0.8
121 0.81
122 0.8
123 0.76
124 0.69
125 0.64
126 0.56
127 0.47
128 0.36
129 0.26
130 0.19
131 0.15
132 0.14
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.12
142 0.15
143 0.22
144 0.31
145 0.4
146 0.48
147 0.56
148 0.65
149 0.72
150 0.77
151 0.79
152 0.77
153 0.73
154 0.72
155 0.65
156 0.57
157 0.49
158 0.43
159 0.35
160 0.3
161 0.28
162 0.22
163 0.24
164 0.26
165 0.35
166 0.4
167 0.45
168 0.48
169 0.51
170 0.5
171 0.5
172 0.46
173 0.37
174 0.35
175 0.36
176 0.38
177 0.35
178 0.35
179 0.33
180 0.34
181 0.33
182 0.27
183 0.22
184 0.19
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.17
191 0.14
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.22
206 0.26
207 0.27
208 0.25
209 0.24
210 0.21
211 0.19
212 0.16
213 0.12
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.13
224 0.22
225 0.25
226 0.28
227 0.32
228 0.34
229 0.41
230 0.49
231 0.55
232 0.57
233 0.58
234 0.57
235 0.55
236 0.55
237 0.49
238 0.46
239 0.45
240 0.46
241 0.44
242 0.47
243 0.48
244 0.48
245 0.52
246 0.52
247 0.47
248 0.44
249 0.44
250 0.41
251 0.39
252 0.37
253 0.34
254 0.27
255 0.23
256 0.15
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.21
261 0.28
262 0.29
263 0.34
264 0.36
265 0.38
266 0.41
267 0.48
268 0.5
269 0.42
270 0.42
271 0.38
272 0.37
273 0.33
274 0.26
275 0.19
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.07
280 0.09
281 0.08
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.13
287 0.16
288 0.14
289 0.15
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.12
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.15
306 0.14
307 0.15
308 0.18
309 0.2
310 0.22
311 0.28
312 0.31
313 0.3
314 0.38
315 0.41
316 0.48
317 0.48
318 0.47
319 0.41
320 0.39
321 0.39
322 0.34
323 0.38
324 0.28
325 0.25
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.24
330 0.22
331 0.15
332 0.16
333 0.16
334 0.15
335 0.17
336 0.16
337 0.14
338 0.17
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.24
343 0.28
344 0.31
345 0.31
346 0.35
347 0.29
348 0.28
349 0.31
350 0.3
351 0.24
352 0.21
353 0.21
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.11
358 0.13
359 0.17
360 0.24
361 0.25
362 0.26
363 0.25
364 0.3
365 0.36
366 0.35
367 0.35
368 0.3
369 0.3
370 0.32
371 0.36
372 0.3
373 0.31
374 0.36
375 0.33
376 0.32
377 0.31
378 0.3
379 0.26
380 0.3
381 0.33
382 0.28
383 0.27
384 0.3
385 0.28
386 0.28
387 0.28
388 0.28
389 0.23
390 0.27
391 0.36
392 0.43
393 0.51
394 0.58
395 0.65
396 0.67
397 0.73
398 0.78
399 0.78
400 0.76
401 0.76
402 0.73
403 0.73
404 0.73
405 0.69
406 0.68
407 0.64
408 0.66
409 0.63
410 0.65
411 0.67
412 0.69
413 0.72
414 0.71
415 0.72
416 0.69
417 0.72
418 0.7
419 0.63
420 0.62
421 0.54
422 0.5
423 0.47
424 0.48
425 0.46
426 0.44
427 0.49
428 0.5
429 0.55
430 0.58
431 0.57
432 0.6
433 0.54
434 0.52
435 0.49
436 0.43
437 0.38
438 0.33
439 0.3
440 0.22
441 0.21
442 0.19
443 0.14
444 0.12
445 0.09
446 0.08
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.12
451 0.16
452 0.2
453 0.24
454 0.26
455 0.26
456 0.28
457 0.3
458 0.29
459 0.27
460 0.25
461 0.28
462 0.35
463 0.41
464 0.42
465 0.43
466 0.44
467 0.5
468 0.55
469 0.53
470 0.52
471 0.57
472 0.64
473 0.7
474 0.75
475 0.78
476 0.81
477 0.86
478 0.87
479 0.84
480 0.78
481 0.77
482 0.72
483 0.64
484 0.55
485 0.46
486 0.38
487 0.31
488 0.26
489 0.19
490 0.13
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.09
497 0.1
498 0.11
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.18
503 0.24
504 0.25
505 0.25
506 0.26
507 0.33
508 0.42
509 0.46
510 0.45
511 0.43
512 0.47
513 0.48
514 0.46
515 0.43
516 0.37
517 0.36
518 0.31
519 0.27
520 0.24
521 0.22
522 0.22
523 0.19
524 0.16
525 0.19
526 0.16
527 0.18
528 0.22
529 0.22
530 0.22
531 0.23
532 0.24
533 0.19
534 0.21
535 0.19
536 0.15
537 0.15
538 0.14
539 0.13
540 0.12
541 0.1
542 0.08
543 0.08
544 0.07