FuNGI

A0A397SAE2

Protein Details

Accession

A0A397SAE2

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-87	WENLNNRPKKKHSISKISSRPTA	Hydrophilic
527-548	LVAPRVPKRKPTGYQKLTPLQK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
498-537	EKKERIIGNLRRAMAKEKAKKEARQVKMLLVAPRVPKRKP

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001810 F-box_dom IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A
PROSITE	View protein in PROSITE PS50181 FBOX

Amino Acid Sequences

MKQNSKMLTRVDSSLKTPQSTATVQTQDQDLIQKHFIYKEPLEFYKTKNMREHEEKSKMAVKTFWENLNNRPKKKHSISKISSRPTASILSSGTTSASSTLRSAAIPTAQRNAVQPLTKASSSRLTISLNPVQSVNISSVKSTTHKSQSTRTTATQKIKLAQNSKNKSTKASVESSCTTADVQYKEPLKFYKTKDMREHEEKSKWVVQTFWENLNGRSKKSTQSSENTLESQISVNLSEVSGSSDSQTLSIQSENETSFGLTEQVNSVAKDKAIGRSNKDSFLSSGSTSKAALTQTFSRSMVDVNENGVSAATFAEPHASSSGLAAQGPEISVLDADRPLTKISNKRKHSGDGEIGNSKLIKISIPETRRQKEFSMKINLPNRPAPQVGNNSQNIISSGTSKNNVVKSLVQLCTMTLVSNKHRLYKLGDAPYHLLEPILKFCTDEELRQLEEVNSRLIDEDMELWKRFLQQKLPDQLLPDNPEDYRKTYLNIIDEEKEKKERIIGNLRRAMAKEKAKKEARQVKMLLVAPRVPKRKPTGYQKLTPLQKIRREMIREGYVTFPHR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.45
3	0.41
4	0.39
5	0.37
6	0.36
7	0.35
8	0.35
9	0.34
10	0.35
11	0.33
12	0.35
13	0.34
14	0.29
15	0.29
16	0.31
17	0.26
18	0.26
19	0.28
20	0.28
21	0.29
22	0.31
23	0.33
24	0.33
25	0.34
26	0.36
27	0.4
28	0.4
29	0.44
30	0.43
31	0.44
32	0.48
33	0.5
34	0.5
35	0.51
36	0.53
37	0.56
38	0.63
39	0.66
40	0.65
41	0.68
42	0.62
43	0.59
44	0.63
45	0.55
46	0.49
47	0.44
48	0.38
49	0.39
50	0.43
51	0.44
52	0.44
53	0.45
54	0.52
55	0.6
56	0.64
57	0.61
58	0.65
59	0.65
60	0.68
61	0.76
62	0.77
63	0.76
64	0.78
65	0.8
66	0.83
67	0.86
68	0.82
69	0.77
70	0.69
71	0.6
72	0.52
73	0.47
74	0.37
75	0.31
76	0.25
77	0.2
78	0.19
79	0.17
80	0.15
81	0.12
82	0.11
83	0.11
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.13
91	0.13
92	0.17
93	0.2
94	0.21
95	0.25
96	0.25
97	0.26
98	0.27
99	0.3
100	0.29
101	0.27
102	0.26
103	0.26
104	0.3
105	0.3
106	0.28
107	0.27
108	0.28
109	0.28
110	0.3
111	0.27
112	0.25
113	0.26
114	0.32
115	0.35
116	0.3
117	0.28
118	0.26
119	0.24
120	0.22
121	0.21
122	0.17
123	0.15
124	0.14
125	0.14
126	0.14
127	0.17
128	0.18
129	0.21
130	0.24
131	0.29
132	0.34
133	0.37
134	0.44
135	0.5
136	0.55
137	0.56
138	0.54
139	0.54
140	0.56
141	0.6
142	0.58
143	0.53
144	0.52
145	0.53
146	0.55
147	0.55
148	0.55
149	0.58
150	0.59
151	0.64
152	0.65
153	0.6
154	0.57
155	0.54
156	0.52
157	0.47
158	0.46
159	0.4
160	0.38
161	0.39
162	0.37
163	0.33
164	0.27
165	0.22
166	0.18
167	0.2
168	0.17
169	0.18
170	0.22
171	0.26
172	0.26
173	0.28
174	0.28
175	0.28
176	0.33
177	0.36
178	0.41
179	0.43
180	0.5
181	0.57
182	0.61
183	0.64
184	0.65
185	0.67
186	0.63
187	0.61
188	0.54
189	0.51
190	0.5
191	0.43
192	0.36
193	0.3
194	0.25
195	0.29
196	0.3
197	0.27
198	0.27
199	0.27
200	0.28
201	0.37
202	0.36
203	0.3
204	0.31
205	0.31
206	0.31
207	0.36
208	0.4
209	0.35
210	0.39
211	0.44
212	0.45
213	0.45
214	0.4
215	0.35
216	0.29
217	0.24
218	0.19
219	0.13
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.09
235	0.07
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.12
259	0.15
260	0.21
261	0.23
262	0.26
263	0.34
264	0.35
265	0.35
266	0.35
267	0.3
268	0.25
269	0.24
270	0.22
271	0.14
272	0.14
273	0.13
274	0.13
275	0.12
276	0.11
277	0.11
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.13
282	0.15
283	0.17
284	0.17
285	0.15
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.13
290	0.11
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.1
295	0.09
296	0.07
297	0.05
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.07
326	0.08
327	0.1
328	0.15
329	0.23
330	0.34
331	0.43
332	0.47
333	0.52
334	0.54
335	0.57
336	0.56
337	0.53
338	0.48
339	0.42
340	0.42
341	0.38
342	0.35
343	0.3
344	0.27
345	0.2
346	0.15
347	0.11
348	0.08
349	0.08
350	0.11
351	0.18
352	0.21
353	0.28
354	0.36
355	0.4
356	0.43
357	0.44
358	0.45
359	0.47
360	0.5
361	0.5
362	0.5
363	0.49
364	0.54
365	0.59
366	0.58
367	0.53
368	0.52
369	0.47
370	0.41
371	0.4
372	0.33
373	0.32
374	0.37
375	0.37
376	0.38
377	0.37
378	0.35
379	0.34
380	0.32
381	0.27
382	0.21
383	0.17
384	0.14
385	0.16
386	0.17
387	0.18
388	0.2
389	0.23
390	0.24
391	0.24
392	0.23
393	0.22
394	0.24
395	0.3
396	0.29
397	0.25
398	0.24
399	0.22
400	0.22
401	0.21
402	0.16
403	0.12
404	0.16
405	0.18
406	0.27
407	0.28
408	0.32
409	0.33
410	0.35
411	0.38
412	0.42
413	0.47
414	0.46
415	0.46
416	0.43
417	0.44
418	0.43
419	0.38
420	0.29
421	0.22
422	0.15
423	0.15
424	0.16
425	0.16
426	0.14
427	0.14
428	0.14
429	0.22
430	0.22
431	0.22
432	0.23
433	0.24
434	0.25
435	0.25
436	0.26
437	0.2
438	0.22
439	0.21
440	0.18
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.14
445	0.12
446	0.1
447	0.12
448	0.14
449	0.18
450	0.19
451	0.19
452	0.2
453	0.26
454	0.31
455	0.32
456	0.36
457	0.41
458	0.5
459	0.57
460	0.6
461	0.55
462	0.52
463	0.52
464	0.5
465	0.45
466	0.38
467	0.32
468	0.29
469	0.33
470	0.32
471	0.31
472	0.3
473	0.27
474	0.27
475	0.3
476	0.34
477	0.33
478	0.34
479	0.34
480	0.33
481	0.36
482	0.38
483	0.38
484	0.39
485	0.36
486	0.33
487	0.36
488	0.38
489	0.42
490	0.49
491	0.53
492	0.58
493	0.63
494	0.64
495	0.6
496	0.57
497	0.53
498	0.51
499	0.53
500	0.53
501	0.53
502	0.62
503	0.66
504	0.7
505	0.76
506	0.77
507	0.73
508	0.73
509	0.68
510	0.62
511	0.62
512	0.61
513	0.54
514	0.48
515	0.47
516	0.46
517	0.53
518	0.55
519	0.5
520	0.54
521	0.58
522	0.64
523	0.68
524	0.71
525	0.74
526	0.76
527	0.81
528	0.81
529	0.82
530	0.8
531	0.79
532	0.77
533	0.75
534	0.75
535	0.75
536	0.72
537	0.72
538	0.7
539	0.67
540	0.66
541	0.64
542	0.57
543	0.53
544	0.5

A0A397SAE2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer