Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TH71

Protein Details
Accession A0A397TH71    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
207-232IEKFKKVLNTKKKKVKKLMKVLNANGHydrophilic
323-347VQEVKEVKEKRPRKRPESVLTKTFRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-223NTKKKKVKK
330-340KEKRPRKRPES
352-357KSRRMG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MSTGQYKLSITCFRLSSSVENEIEKIFYVRSNWKVDPFKDLLGRDEKVICDLSITDCKSFWTRNVKLIDFKNTKPDNIRNPKDFCEATQAALSGRDKYGDQKLSCQIAINESHAKLTWNWSMQQAGISTMALQFTLGSISLHPVSQFETIKMWQEWIDFFIEERNQLIKSKNTYEIRVNDLEEIKNHMQDKIESITDEKINNQALLIEKFKKVLNTKKKKVKKLMKVLNANGAIMSSELRASHDLSDEHLNEKELLEEELSNESESSKHDNARGKSSWSRSRPLSTDAFSPSKKTKLDDVLASKSTIASESPNEDDQNEIELVQEVKEVKEKRPRKRPESVLTKTFRGQVIKSRRMGRRPVTRSSNSLDNILIPVDEPEPNPEIEEVNEVNEGVEDLLNQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.33
4 0.32
5 0.37
6 0.34
7 0.34
8 0.34
9 0.31
10 0.29
11 0.24
12 0.2
13 0.14
14 0.14
15 0.18
16 0.24
17 0.3
18 0.36
19 0.38
20 0.46
21 0.52
22 0.51
23 0.54
24 0.49
25 0.48
26 0.47
27 0.46
28 0.43
29 0.41
30 0.41
31 0.36
32 0.36
33 0.31
34 0.28
35 0.28
36 0.22
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.23
41 0.25
42 0.23
43 0.22
44 0.25
45 0.28
46 0.29
47 0.32
48 0.35
49 0.36
50 0.42
51 0.48
52 0.48
53 0.51
54 0.54
55 0.57
56 0.52
57 0.51
58 0.54
59 0.5
60 0.51
61 0.51
62 0.55
63 0.55
64 0.61
65 0.67
66 0.64
67 0.66
68 0.66
69 0.65
70 0.57
71 0.48
72 0.46
73 0.39
74 0.33
75 0.3
76 0.26
77 0.2
78 0.24
79 0.24
80 0.17
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.19
85 0.27
86 0.3
87 0.3
88 0.33
89 0.38
90 0.4
91 0.39
92 0.37
93 0.29
94 0.26
95 0.27
96 0.25
97 0.24
98 0.21
99 0.22
100 0.2
101 0.21
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.2
106 0.21
107 0.22
108 0.22
109 0.21
110 0.22
111 0.17
112 0.14
113 0.12
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.13
133 0.14
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.19
138 0.18
139 0.17
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.21
157 0.24
158 0.31
159 0.31
160 0.33
161 0.37
162 0.37
163 0.37
164 0.35
165 0.32
166 0.26
167 0.26
168 0.23
169 0.19
170 0.22
171 0.18
172 0.2
173 0.2
174 0.19
175 0.17
176 0.17
177 0.19
178 0.15
179 0.15
180 0.12
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.2
199 0.23
200 0.32
201 0.4
202 0.48
203 0.57
204 0.66
205 0.74
206 0.79
207 0.84
208 0.84
209 0.83
210 0.83
211 0.83
212 0.82
213 0.81
214 0.73
215 0.69
216 0.59
217 0.49
218 0.38
219 0.29
220 0.2
221 0.13
222 0.12
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.17
234 0.16
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.13
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.24
257 0.31
258 0.33
259 0.39
260 0.39
261 0.38
262 0.42
263 0.48
264 0.52
265 0.49
266 0.53
267 0.49
268 0.53
269 0.5
270 0.48
271 0.45
272 0.37
273 0.37
274 0.37
275 0.38
276 0.33
277 0.35
278 0.34
279 0.35
280 0.35
281 0.33
282 0.34
283 0.37
284 0.4
285 0.42
286 0.44
287 0.43
288 0.43
289 0.41
290 0.34
291 0.27
292 0.24
293 0.18
294 0.13
295 0.1
296 0.11
297 0.14
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.18
304 0.19
305 0.16
306 0.12
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.1
311 0.12
312 0.1
313 0.11
314 0.18
315 0.2
316 0.26
317 0.36
318 0.45
319 0.54
320 0.64
321 0.73
322 0.74
323 0.82
324 0.85
325 0.84
326 0.86
327 0.83
328 0.82
329 0.77
330 0.72
331 0.64
332 0.59
333 0.53
334 0.46
335 0.41
336 0.42
337 0.48
338 0.52
339 0.56
340 0.61
341 0.65
342 0.68
343 0.75
344 0.75
345 0.75
346 0.73
347 0.76
348 0.76
349 0.73
350 0.7
351 0.66
352 0.64
353 0.55
354 0.51
355 0.42
356 0.34
357 0.3
358 0.25
359 0.2
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.16
366 0.18
367 0.18
368 0.19
369 0.18
370 0.17
371 0.17
372 0.21
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.16
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.09
381 0.09