Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397RXF1

Protein Details
Accession A0A397RXF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-284ERVRTKKREIKEESKKKAREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-283RVRTKKREIKEESKKKAR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021122  RNA_ligase_dom_REL/Rnl2  
IPR041948  Rnl1/2_C_sf  
IPR040609  Rnl2_C  
Pfam View protein in Pfam  
PF09414  RNA_ligase  
PF18043  T4_Rnl2_C  
Amino Acid Sequences MTAPQSIDSLKNSSINLDEWWDINKHVSYHSIEPTSNSKRVDLFSKDKLLDKCEWVVTEKIHGSNFSFITNGKQIKCATRSKPLSDSEKFYGFQKVKETLSTNIIKLWEIMSSKNLIHSISNDNNNDDEKIIIIFGELFGGRYTHPNIKPLKSSIMCQYGIEYCPQNDFMSFDIYDGKDFLDYDIMINLFEESGLPYLKSLFRGSFNDAFNYDPEFTTTIPGLLGLPPLPFQNKAEGVIIKPVLTLRTTTKKRVILKIKTSDFEERVRTKKREIKEESKKKAREPLIEMYEEFLTFINENRLNNVVSKFGPVVIQNHDDDGEDDDDESKLNKRIDQVVELLCEDALTDLNKDDTLKEKFDQLPIWKQNYIVKGKGKDKALEVVKEYVEKVKGLHLNNNNIDKEEKDKLDLLGDSDDNLDNNLQLNLTI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.22
4 0.22
5 0.2
6 0.18
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.22
11 0.23
12 0.2
13 0.21
14 0.25
15 0.26
16 0.3
17 0.35
18 0.34
19 0.32
20 0.35
21 0.42
22 0.44
23 0.45
24 0.41
25 0.37
26 0.37
27 0.4
28 0.43
29 0.42
30 0.42
31 0.43
32 0.5
33 0.49
34 0.53
35 0.53
36 0.51
37 0.47
38 0.44
39 0.41
40 0.36
41 0.36
42 0.32
43 0.33
44 0.29
45 0.31
46 0.3
47 0.29
48 0.27
49 0.27
50 0.26
51 0.28
52 0.27
53 0.22
54 0.19
55 0.17
56 0.21
57 0.27
58 0.3
59 0.26
60 0.3
61 0.32
62 0.39
63 0.44
64 0.48
65 0.46
66 0.51
67 0.56
68 0.56
69 0.6
70 0.59
71 0.61
72 0.56
73 0.58
74 0.51
75 0.49
76 0.45
77 0.4
78 0.43
79 0.36
80 0.35
81 0.34
82 0.34
83 0.32
84 0.35
85 0.36
86 0.29
87 0.35
88 0.35
89 0.3
90 0.28
91 0.28
92 0.24
93 0.21
94 0.19
95 0.15
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.15
104 0.15
105 0.17
106 0.22
107 0.25
108 0.32
109 0.3
110 0.31
111 0.31
112 0.32
113 0.29
114 0.22
115 0.17
116 0.11
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.09
130 0.13
131 0.2
132 0.22
133 0.28
134 0.32
135 0.35
136 0.38
137 0.37
138 0.42
139 0.34
140 0.36
141 0.35
142 0.36
143 0.33
144 0.3
145 0.29
146 0.23
147 0.23
148 0.23
149 0.18
150 0.13
151 0.14
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.13
190 0.16
191 0.21
192 0.24
193 0.24
194 0.23
195 0.23
196 0.22
197 0.2
198 0.2
199 0.16
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.17
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.22
235 0.25
236 0.3
237 0.36
238 0.41
239 0.46
240 0.54
241 0.59
242 0.57
243 0.63
244 0.67
245 0.63
246 0.58
247 0.57
248 0.53
249 0.46
250 0.41
251 0.39
252 0.36
253 0.4
254 0.46
255 0.45
256 0.49
257 0.53
258 0.55
259 0.58
260 0.62
261 0.66
262 0.69
263 0.77
264 0.79
265 0.82
266 0.8
267 0.73
268 0.73
269 0.68
270 0.64
271 0.59
272 0.57
273 0.52
274 0.5
275 0.46
276 0.39
277 0.33
278 0.26
279 0.21
280 0.12
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.22
291 0.22
292 0.17
293 0.16
294 0.18
295 0.16
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.16
300 0.18
301 0.21
302 0.19
303 0.19
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.14
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.16
317 0.17
318 0.19
319 0.22
320 0.29
321 0.31
322 0.33
323 0.34
324 0.3
325 0.31
326 0.29
327 0.26
328 0.18
329 0.15
330 0.12
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.17
341 0.2
342 0.23
343 0.23
344 0.3
345 0.32
346 0.35
347 0.39
348 0.38
349 0.45
350 0.49
351 0.53
352 0.47
353 0.46
354 0.48
355 0.5
356 0.5
357 0.46
358 0.46
359 0.5
360 0.55
361 0.6
362 0.59
363 0.54
364 0.52
365 0.54
366 0.52
367 0.48
368 0.45
369 0.43
370 0.39
371 0.38
372 0.36
373 0.33
374 0.29
375 0.25
376 0.22
377 0.26
378 0.31
379 0.32
380 0.4
381 0.42
382 0.5
383 0.56
384 0.63
385 0.56
386 0.51
387 0.5
388 0.43
389 0.42
390 0.4
391 0.35
392 0.31
393 0.33
394 0.32
395 0.34
396 0.33
397 0.29
398 0.25
399 0.24
400 0.21
401 0.21
402 0.21
403 0.17
404 0.17
405 0.15
406 0.12
407 0.13
408 0.13