Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397T543

Protein Details
Accession A0A397T543    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-346VGKEQSYRLKNKKSKAKTFVEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-49K
108-131RSSRGARPSDRGRGGRGGRRGGRE
355-377GASPRGRGRGRGGRGGRGGRDER
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MASVVSRNIFDLLGESEDSETVVKEKEPPAKEQPVIVQKKVDRSRASPKEARIRHEYPQRGGHKPSTSNRNNEDTRSGAPRDRNVGPRLSGRREEGGGGGGGDYHSTRSSRGARPSDRGRGGRGGRRGGREYDRHSGTGRHDSEKKENQAWGKKTENWENNGAPETPNWNAEAKDSNNANAAWDDNTNDTNAEGTWGDTNTTNATEEKNDWNSGVAEEKSGAGDSWKATEETSGGWEQQPEPTETNWENKEEKIEDTAAGDSAPVPEPEPEEVVKTLEEYLAEKAQKSLDISLPEARKPNEGVDDSQWKDAVPLERDEEDDFLFVGKEQSYRLKNKKSKAKTFVEITQTFEKSGGASPRGRGRGRGGRGGRGGRDERDGRDRNNYDDNNRDNRRRGGGGGGRSVVNLDDTRAFPSLGAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.14
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.16
12 0.23
13 0.31
14 0.34
15 0.4
16 0.47
17 0.54
18 0.54
19 0.52
20 0.54
21 0.56
22 0.59
23 0.54
24 0.53
25 0.48
26 0.58
27 0.62
28 0.61
29 0.56
30 0.56
31 0.65
32 0.66
33 0.72
34 0.68
35 0.69
36 0.71
37 0.71
38 0.71
39 0.68
40 0.64
41 0.63
42 0.67
43 0.65
44 0.6
45 0.65
46 0.66
47 0.62
48 0.64
49 0.62
50 0.59
51 0.6
52 0.63
53 0.64
54 0.64
55 0.67
56 0.67
57 0.68
58 0.64
59 0.59
60 0.55
61 0.47
62 0.44
63 0.42
64 0.4
65 0.37
66 0.39
67 0.4
68 0.42
69 0.44
70 0.48
71 0.45
72 0.46
73 0.43
74 0.47
75 0.5
76 0.5
77 0.48
78 0.44
79 0.44
80 0.41
81 0.39
82 0.31
83 0.25
84 0.19
85 0.15
86 0.12
87 0.09
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.16
96 0.22
97 0.28
98 0.36
99 0.43
100 0.46
101 0.54
102 0.6
103 0.63
104 0.63
105 0.59
106 0.54
107 0.54
108 0.55
109 0.54
110 0.53
111 0.52
112 0.5
113 0.53
114 0.53
115 0.5
116 0.51
117 0.5
118 0.5
119 0.5
120 0.48
121 0.44
122 0.42
123 0.4
124 0.38
125 0.41
126 0.38
127 0.36
128 0.38
129 0.41
130 0.49
131 0.53
132 0.53
133 0.47
134 0.48
135 0.5
136 0.54
137 0.53
138 0.5
139 0.47
140 0.46
141 0.48
142 0.54
143 0.51
144 0.46
145 0.48
146 0.43
147 0.4
148 0.37
149 0.32
150 0.23
151 0.19
152 0.19
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.18
160 0.16
161 0.2
162 0.2
163 0.19
164 0.2
165 0.2
166 0.19
167 0.15
168 0.14
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.14
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.1
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.18
231 0.19
232 0.24
233 0.23
234 0.25
235 0.24
236 0.22
237 0.26
238 0.22
239 0.22
240 0.19
241 0.18
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.1
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.15
277 0.17
278 0.19
279 0.24
280 0.25
281 0.26
282 0.29
283 0.28
284 0.27
285 0.27
286 0.27
287 0.27
288 0.27
289 0.27
290 0.28
291 0.35
292 0.34
293 0.34
294 0.31
295 0.25
296 0.24
297 0.25
298 0.26
299 0.2
300 0.21
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.26
305 0.23
306 0.18
307 0.15
308 0.13
309 0.1
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.18
317 0.25
318 0.34
319 0.43
320 0.52
321 0.59
322 0.68
323 0.76
324 0.79
325 0.83
326 0.82
327 0.81
328 0.77
329 0.75
330 0.72
331 0.71
332 0.62
333 0.57
334 0.54
335 0.48
336 0.41
337 0.36
338 0.29
339 0.21
340 0.25
341 0.25
342 0.23
343 0.25
344 0.29
345 0.37
346 0.44
347 0.44
348 0.43
349 0.46
350 0.52
351 0.54
352 0.6
353 0.55
354 0.55
355 0.61
356 0.62
357 0.56
358 0.55
359 0.53
360 0.46
361 0.51
362 0.47
363 0.46
364 0.51
365 0.53
366 0.48
367 0.55
368 0.55
369 0.52
370 0.59
371 0.58
372 0.54
373 0.58
374 0.62
375 0.62
376 0.67
377 0.69
378 0.66
379 0.67
380 0.67
381 0.6
382 0.55
383 0.54
384 0.53
385 0.52
386 0.5
387 0.46
388 0.4
389 0.37
390 0.36
391 0.26
392 0.23
393 0.18
394 0.15
395 0.17
396 0.18
397 0.21
398 0.22
399 0.22