Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397SGD5

Protein Details
Accession A0A397SGD5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-263ECPIRKQDSKKQQLNKLYNHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.666, cyto_nucl 10.333, mito 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MITTARRTNHCTIAPYNNVKGNAPRSKIQNLTKIFAKFSTYMGAAVRIIKKLNKGKYMCIFFLDEKDLLDAIKVLITKSSMKVHTVCASLSRFSEIESIKLVTRGLFQHAFLVYKSVISATSFVTYWGTYILRDAVRVFPKFLTDEQRQLRKKFGCKLTSLPNNIQAHDLHDILRTMNAKSIFIPRNPVSYKPLNFAYINYKSEDARQIAMKTNYKVNGQDLFWCTENARTCNRCGSPSHLFNECPIRKQDSKKQQLNKLYNHYRPAQHRKPKSYADATKAHKDDKSHECNPSNEKCTSKQPESLSPHARELRAKTSTIPFISDPVIENTASSSISLIESHENPVDIEALKKESSET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.57
4 0.54
5 0.52
6 0.49
7 0.5
8 0.51
9 0.51
10 0.49
11 0.49
12 0.5
13 0.56
14 0.62
15 0.62
16 0.61
17 0.58
18 0.58
19 0.58
20 0.55
21 0.49
22 0.42
23 0.39
24 0.31
25 0.28
26 0.28
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.2
31 0.17
32 0.22
33 0.23
34 0.21
35 0.24
36 0.26
37 0.34
38 0.41
39 0.47
40 0.51
41 0.51
42 0.57
43 0.62
44 0.65
45 0.56
46 0.5
47 0.47
48 0.39
49 0.4
50 0.35
51 0.27
52 0.21
53 0.22
54 0.19
55 0.15
56 0.14
57 0.1
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.07
62 0.08
63 0.1
64 0.13
65 0.15
66 0.21
67 0.21
68 0.23
69 0.25
70 0.28
71 0.29
72 0.28
73 0.25
74 0.24
75 0.25
76 0.23
77 0.22
78 0.21
79 0.17
80 0.17
81 0.23
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.19
86 0.16
87 0.17
88 0.16
89 0.11
90 0.14
91 0.14
92 0.17
93 0.17
94 0.16
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.16
99 0.18
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.07
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.08
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.16
123 0.2
124 0.21
125 0.22
126 0.19
127 0.2
128 0.21
129 0.23
130 0.24
131 0.22
132 0.29
133 0.34
134 0.43
135 0.46
136 0.46
137 0.51
138 0.5
139 0.53
140 0.54
141 0.56
142 0.5
143 0.48
144 0.51
145 0.52
146 0.54
147 0.52
148 0.45
149 0.45
150 0.42
151 0.4
152 0.37
153 0.28
154 0.24
155 0.21
156 0.2
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.12
162 0.11
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.26
172 0.23
173 0.29
174 0.3
175 0.31
176 0.29
177 0.32
178 0.33
179 0.3
180 0.3
181 0.27
182 0.26
183 0.26
184 0.28
185 0.26
186 0.26
187 0.24
188 0.24
189 0.21
190 0.23
191 0.26
192 0.2
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.23
197 0.28
198 0.29
199 0.27
200 0.3
201 0.3
202 0.29
203 0.29
204 0.26
205 0.25
206 0.21
207 0.25
208 0.22
209 0.23
210 0.22
211 0.21
212 0.19
213 0.2
214 0.23
215 0.22
216 0.27
217 0.26
218 0.27
219 0.33
220 0.34
221 0.32
222 0.31
223 0.35
224 0.36
225 0.39
226 0.4
227 0.37
228 0.35
229 0.36
230 0.44
231 0.38
232 0.34
233 0.32
234 0.36
235 0.39
236 0.46
237 0.54
238 0.54
239 0.63
240 0.68
241 0.74
242 0.75
243 0.8
244 0.8
245 0.77
246 0.76
247 0.75
248 0.71
249 0.67
250 0.64
251 0.61
252 0.62
253 0.66
254 0.67
255 0.68
256 0.72
257 0.75
258 0.77
259 0.77
260 0.75
261 0.74
262 0.71
263 0.67
264 0.66
265 0.63
266 0.65
267 0.61
268 0.57
269 0.49
270 0.45
271 0.47
272 0.48
273 0.51
274 0.48
275 0.54
276 0.55
277 0.57
278 0.63
279 0.63
280 0.58
281 0.53
282 0.51
283 0.47
284 0.53
285 0.56
286 0.53
287 0.52
288 0.51
289 0.57
290 0.61
291 0.65
292 0.63
293 0.58
294 0.61
295 0.59
296 0.57
297 0.54
298 0.51
299 0.51
300 0.46
301 0.44
302 0.4
303 0.42
304 0.46
305 0.41
306 0.39
307 0.31
308 0.31
309 0.31
310 0.28
311 0.24
312 0.21
313 0.22
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.17
318 0.16
319 0.13
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.14
326 0.15
327 0.19
328 0.2
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.19
333 0.15
334 0.17
335 0.16
336 0.18
337 0.18