Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A397TMV9

Protein Details
Accession A0A397TMV9    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-200TSTISFKRPRGRPRKFSNRYASIHydrophilic
359-380SVNSTRSRGRPPKSSSKGKQHMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-191RPRGRPR
368-371RPPK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MSNVNNTNTSFSELITAVREVRDNANRFLESLERFDNIRHEINVKSLNNFIQGILNTDYNEIEEVAAVDTTSTGRQSTTSTIITSSPAFVNSRHPLLAESFSESSIEPTKSPPAVSSISPYSQIETPSDITSTTFPNITPIVTESQESHSESSITTQYPRVLLEDHTTTTTNSATISTSTISFKRPRGRPRKFSNRYASIIDQVVPTKSDRRYSQKNAGNSHITGKSINSSEMCYSDTSDSFSSRSGSADIYSSDDDSNFEKVMNLVRTYISSTRSDVLKDGIYTWKNTRPVFVNEHLVKVKKLFRNNNILSSPNEDDDIVSAFKRIHTSRRSMHLTRQKYVHTNSSSSKSAIINVVDSVNSTRSRGRPPKSSSKGKQHM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.19
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.25
9 0.33
10 0.34
11 0.37
12 0.41
13 0.4
14 0.39
15 0.39
16 0.37
17 0.3
18 0.31
19 0.29
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.29
24 0.28
25 0.29
26 0.26
27 0.27
28 0.26
29 0.32
30 0.38
31 0.35
32 0.32
33 0.32
34 0.31
35 0.31
36 0.31
37 0.26
38 0.21
39 0.2
40 0.22
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.15
47 0.15
48 0.11
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.11
64 0.14
65 0.17
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.19
71 0.18
72 0.16
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.21
78 0.23
79 0.24
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.23
84 0.25
85 0.18
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.18
93 0.18
94 0.14
95 0.16
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.18
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.22
107 0.21
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.17
114 0.15
115 0.16
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.11
132 0.14
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.14
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.1
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.14
169 0.17
170 0.22
171 0.3
172 0.36
173 0.46
174 0.55
175 0.63
176 0.69
177 0.75
178 0.82
179 0.79
180 0.82
181 0.8
182 0.74
183 0.68
184 0.62
185 0.53
186 0.44
187 0.38
188 0.29
189 0.21
190 0.16
191 0.14
192 0.12
193 0.11
194 0.14
195 0.15
196 0.2
197 0.23
198 0.3
199 0.39
200 0.45
201 0.53
202 0.54
203 0.58
204 0.56
205 0.56
206 0.51
207 0.43
208 0.41
209 0.32
210 0.27
211 0.22
212 0.19
213 0.17
214 0.15
215 0.16
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.11
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.15
251 0.17
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.16
256 0.19
257 0.21
258 0.19
259 0.18
260 0.19
261 0.21
262 0.22
263 0.22
264 0.19
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.21
270 0.21
271 0.24
272 0.27
273 0.31
274 0.36
275 0.36
276 0.37
277 0.35
278 0.39
279 0.43
280 0.42
281 0.45
282 0.4
283 0.45
284 0.45
285 0.42
286 0.37
287 0.36
288 0.41
289 0.37
290 0.46
291 0.5
292 0.54
293 0.63
294 0.65
295 0.67
296 0.61
297 0.57
298 0.49
299 0.47
300 0.42
301 0.32
302 0.29
303 0.22
304 0.2
305 0.18
306 0.19
307 0.13
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.13
312 0.19
313 0.2
314 0.27
315 0.32
316 0.4
317 0.45
318 0.54
319 0.6
320 0.58
321 0.66
322 0.67
323 0.67
324 0.66
325 0.64
326 0.61
327 0.61
328 0.62
329 0.61
330 0.55
331 0.54
332 0.53
333 0.54
334 0.51
335 0.44
336 0.43
337 0.34
338 0.32
339 0.31
340 0.27
341 0.23
342 0.21
343 0.21
344 0.17
345 0.18
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.19
350 0.24
351 0.28
352 0.39
353 0.47
354 0.52
355 0.58
356 0.65
357 0.74
358 0.77
359 0.84
360 0.83