FuNGI

A0A397TJC2

Protein Details

Accession

A0A397TJC2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
55-78	SSIPPVSKSPRHGNFKKRRESSGS	Hydrophilic
86-110	DDLTLKNQKLRQKLRKLERVHSKSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018554 FRQ IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0007623 P:circadian rhythm GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF09421 FRQ
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

GSSVSTTEAWFREFNQNTKELNKNNFDDDDSETPYFVNSYKSLPKHPKLVPNQQSSIPPVSKSPRHGNFKKRRESSGSDSYRSVIDDLTLKNQKLRQKLRKLERVHSKSLHKEKLFEVRYYQMPREKRHQLEEYLRQFAVQLSTPSTTQVTQNSINVNDSTENAGSPDSLHIKASDKSKMKQVVRAIENVFTTKPSLNDHYLKDQEDSDPQGYVYLNLLTNMAQLHTMSVTLPFVKQAIRTFSNCLELNEDGTKVRWRTGLDHIKPDQSSTNKNKYVDTIISGGSSENISRSGGVSEISSSTGDKQSDSSSSNPFAESIQNYSSDPKNSANAYITPSSLTSSNASKPINQQIKSTPPITHYRPVFLHRNVSSSSSSSDETSSENDQHDGPVIYYEGGLFCTDFSRDLIIDDNDKPTTSSGTQFSPVFDNSITDDNNIDIFKERWNVPRYERATNSILGGNNIILNETSEEDSTSGQEADDESLTKLCDLCDPNDHYSLTCPHISIDGAKTSMIAVDDRCKENSMDTKDGLNKILMEKDIEFTFDRNYGEINDWNDNISKDSISSSSTNSNSCIPDYKRLHTTKVPGVITDDNFMVLVQTSHPMKKRISHSKESSVDCEDIILNSSSSDNSMDMKQQNNERSQQSPESHKIISTKLFQLPPSMSPQPRISPPPGVRGISYATSSNTSSLDSGGGSSGYGSSSSSSSSSETSRDNSYLLRNSTLLQLSQSNNSNLKSSQYDEIQDMELDSLSSDSSGPSPFINIDADEDEELEIEDGHHHHKSRIEESILGKNLRLQDAAIEERRKLADKAAPQEQRLMYLKEIMASSRAVVEALEDNKNSNNVIDGGMDALPTVHLPFFNQRNVQQQSNIYVNNLGINQNNNINNNNNDNNNL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.42
3	0.46
4	0.46
5	0.52
6	0.56
7	0.53
8	0.57
9	0.59
10	0.56
11	0.56
12	0.54
13	0.5
14	0.44
15	0.43
16	0.38
17	0.37
18	0.34
19	0.29
20	0.27
21	0.25
22	0.23
23	0.18
24	0.18
25	0.14
26	0.19
27	0.28
28	0.32
29	0.41
30	0.5
31	0.55
32	0.6
33	0.65
34	0.69
35	0.71
36	0.78
37	0.78
38	0.76
39	0.74
40	0.68
41	0.65
42	0.6
43	0.59
44	0.5
45	0.41
46	0.4
47	0.44
48	0.47
49	0.5
50	0.56
51	0.57
52	0.66
53	0.73
54	0.78
55	0.8
56	0.85
57	0.88
58	0.83
59	0.81
60	0.78
61	0.77
62	0.75
63	0.74
64	0.71
65	0.63
66	0.58
67	0.52
68	0.45
69	0.38
70	0.31
71	0.2
72	0.15
73	0.17
74	0.18
75	0.26
76	0.31
77	0.3
78	0.35
79	0.4
80	0.44
81	0.5
82	0.59
83	0.61
84	0.66
85	0.76
86	0.81
87	0.85
88	0.86
89	0.85
90	0.85
91	0.82
92	0.79
93	0.76
94	0.74
95	0.75
96	0.78
97	0.78
98	0.68
99	0.65
100	0.61
101	0.65
102	0.6
103	0.52
104	0.46
105	0.41
106	0.46
107	0.48
108	0.49
109	0.47
110	0.5
111	0.54
112	0.59
113	0.63
114	0.62
115	0.64
116	0.64
117	0.64
118	0.66
119	0.7
120	0.67
121	0.62
122	0.56
123	0.48
124	0.43
125	0.36
126	0.3
127	0.22
128	0.18
129	0.16
130	0.18
131	0.18
132	0.2
133	0.2
134	0.18
135	0.19
136	0.21
137	0.22
138	0.23
139	0.26
140	0.27
141	0.27
142	0.28
143	0.25
144	0.23
145	0.19
146	0.18
147	0.19
148	0.16
149	0.15
150	0.13
151	0.13
152	0.11
153	0.11
154	0.14
155	0.14
156	0.14
157	0.15
158	0.16
159	0.19
160	0.23
161	0.27
162	0.32
163	0.33
164	0.35
165	0.43
166	0.51
167	0.5
168	0.53
169	0.55
170	0.55
171	0.53
172	0.56
173	0.49
174	0.43
175	0.41
176	0.37
177	0.3
178	0.22
179	0.22
180	0.18
181	0.18
182	0.19
183	0.23
184	0.27
185	0.32
186	0.34
187	0.39
188	0.42
189	0.41
190	0.39
191	0.35
192	0.31
193	0.29
194	0.31
195	0.24
196	0.2
197	0.19
198	0.19
199	0.17
200	0.16
201	0.14
202	0.11
203	0.1
204	0.1
205	0.11
206	0.09
207	0.1
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.1
223	0.12
224	0.15
225	0.21
226	0.24
227	0.25
228	0.29
229	0.29
230	0.34
231	0.32
232	0.3
233	0.27
234	0.23
235	0.25
236	0.22
237	0.21
238	0.15
239	0.16
240	0.21
241	0.18
242	0.19
243	0.19
244	0.2
245	0.23
246	0.33
247	0.42
248	0.4
249	0.47
250	0.47
251	0.49
252	0.48
253	0.45
254	0.41
255	0.35
256	0.41
257	0.41
258	0.49
259	0.49
260	0.5
261	0.49
262	0.45
263	0.46
264	0.38
265	0.32
266	0.24
267	0.19
268	0.18
269	0.17
270	0.15
271	0.11
272	0.1
273	0.08
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.1
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.14
294	0.16
295	0.18
296	0.18
297	0.18
298	0.21
299	0.21
300	0.2
301	0.18
302	0.17
303	0.18
304	0.16
305	0.16
306	0.14
307	0.15
308	0.15
309	0.18
310	0.19
311	0.18
312	0.19
313	0.17
314	0.2
315	0.19
316	0.21
317	0.2
318	0.19
319	0.21
320	0.2
321	0.18
322	0.16
323	0.15
324	0.14
325	0.13
326	0.13
327	0.11
328	0.12
329	0.14
330	0.18
331	0.19
332	0.2
333	0.23
334	0.31
335	0.37
336	0.35
337	0.35
338	0.35
339	0.41
340	0.42
341	0.4
342	0.31
343	0.28
344	0.33
345	0.35
346	0.37
347	0.32
348	0.32
349	0.32
350	0.36
351	0.39
352	0.35
353	0.38
354	0.32
355	0.34
356	0.32
357	0.32
358	0.29
359	0.23
360	0.22
361	0.17
362	0.17
363	0.15
364	0.15
365	0.12
366	0.12
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.11
376	0.09
377	0.07
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.06
393	0.07
394	0.09
395	0.09
396	0.12
397	0.12
398	0.14
399	0.13
400	0.13
401	0.13
402	0.11
403	0.13
404	0.11
405	0.13
406	0.12
407	0.13
408	0.16
409	0.15
410	0.16
411	0.15
412	0.15
413	0.13
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.12
418	0.12
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.1
423	0.09
424	0.08
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.12
429	0.13
430	0.19
431	0.22
432	0.25
433	0.26
434	0.34
435	0.37
436	0.39
437	0.38
438	0.36
439	0.34
440	0.32
441	0.31
442	0.25
443	0.21
444	0.16
445	0.15
446	0.11
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.1
475	0.11
476	0.12
477	0.17
478	0.21
479	0.23
480	0.25
481	0.25
482	0.21
483	0.21
484	0.22
485	0.2
486	0.16
487	0.14
488	0.12
489	0.13
490	0.13
491	0.13
492	0.12
493	0.1
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.07
501	0.06
502	0.12
503	0.15
504	0.16
505	0.17
506	0.18
507	0.17
508	0.2
509	0.26
510	0.27
511	0.26
512	0.26
513	0.28
514	0.31
515	0.32
516	0.29
517	0.22
518	0.18
519	0.16
520	0.17
521	0.14
522	0.12
523	0.11
524	0.12
525	0.12
526	0.13
527	0.12
528	0.11
529	0.12
530	0.13
531	0.13
532	0.11
533	0.12
534	0.11
535	0.13
536	0.15
537	0.16
538	0.16
539	0.16
540	0.17
541	0.18
542	0.17
543	0.16
544	0.14
545	0.11
546	0.09
547	0.1
548	0.1
549	0.11
550	0.12
551	0.12
552	0.17
553	0.18
554	0.18
555	0.19
556	0.21
557	0.19
558	0.19
559	0.24
560	0.21
561	0.3
562	0.33
563	0.35
564	0.41
565	0.42
566	0.45
567	0.43
568	0.47
569	0.42
570	0.45
571	0.41
572	0.33
573	0.35
574	0.34
575	0.3
576	0.26
577	0.21
578	0.14
579	0.14
580	0.13
581	0.09
582	0.06
583	0.06
584	0.05
585	0.08
586	0.1
587	0.14
588	0.18
589	0.21
590	0.23
591	0.3
592	0.39
593	0.47
594	0.52
595	0.58
596	0.6
597	0.66
598	0.7
599	0.66
600	0.6
601	0.52
602	0.45
603	0.35
604	0.3
605	0.21
606	0.15
607	0.14
608	0.12
609	0.08
610	0.08
611	0.09
612	0.08
613	0.08
614	0.09
615	0.07
616	0.09
617	0.1
618	0.15
619	0.18
620	0.21
621	0.24
622	0.3
623	0.35
624	0.38
625	0.42
626	0.4
627	0.4
628	0.41
629	0.43
630	0.41
631	0.42
632	0.43
633	0.41
634	0.39
635	0.38
636	0.35
637	0.32
638	0.32
639	0.29
640	0.29
641	0.3
642	0.32
643	0.3
644	0.32
645	0.31
646	0.29
647	0.32
648	0.34
649	0.3
650	0.32
651	0.36
652	0.35
653	0.38
654	0.41
655	0.38
656	0.4
657	0.42
658	0.45
659	0.45
660	0.43
661	0.38
662	0.35
663	0.34
664	0.26
665	0.25
666	0.19
667	0.16
668	0.17
669	0.17
670	0.17
671	0.14
672	0.14
673	0.13
674	0.12
675	0.11
676	0.09
677	0.08
678	0.08
679	0.07
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.06
687	0.07
688	0.08
689	0.09
690	0.09
691	0.11
692	0.12
693	0.13
694	0.15
695	0.17
696	0.18
697	0.21
698	0.21
699	0.2
700	0.21
701	0.25
702	0.29
703	0.29
704	0.28
705	0.25
706	0.25
707	0.29
708	0.28
709	0.23
710	0.19
711	0.21
712	0.21
713	0.26
714	0.28
715	0.28
716	0.3
717	0.3
718	0.31
719	0.27
720	0.28
721	0.26
722	0.26
723	0.26
724	0.25
725	0.26
726	0.25
727	0.26
728	0.24
729	0.21
730	0.18
731	0.14
732	0.12
733	0.09
734	0.08
735	0.07
736	0.05
737	0.06
738	0.05
739	0.06
740	0.07
741	0.08
742	0.09
743	0.09
744	0.1
745	0.1
746	0.12
747	0.12
748	0.11
749	0.13
750	0.13
751	0.15
752	0.13
753	0.14
754	0.12
755	0.11
756	0.1
757	0.08
758	0.07
759	0.06
760	0.07
761	0.08
762	0.12
763	0.16
764	0.17
765	0.2
766	0.25
767	0.31
768	0.33
769	0.38
770	0.37
771	0.38
772	0.4
773	0.46
774	0.47
775	0.42
776	0.38
777	0.36
778	0.37
779	0.34
780	0.3
781	0.22
782	0.19
783	0.23
784	0.3
785	0.32
786	0.31
787	0.29
788	0.33
789	0.35
790	0.35
791	0.31
792	0.31
793	0.31
794	0.36
795	0.42
796	0.49
797	0.52
798	0.5
799	0.56
800	0.5
801	0.5
802	0.46
803	0.42
804	0.34
805	0.34
806	0.33
807	0.28
808	0.29
809	0.23
810	0.21
811	0.18
812	0.17
813	0.13
814	0.13
815	0.11
816	0.1
817	0.11
818	0.15
819	0.18
820	0.21
821	0.2
822	0.21
823	0.24
824	0.25
825	0.24
826	0.18
827	0.17
828	0.14
829	0.15
830	0.14
831	0.12
832	0.12
833	0.12
834	0.11
835	0.09
836	0.08
837	0.07
838	0.07
839	0.09
840	0.08
841	0.08
842	0.11
843	0.2
844	0.25
845	0.32
846	0.37
847	0.39
848	0.48
849	0.54
850	0.54
851	0.51
852	0.49
853	0.48
854	0.49
855	0.46
856	0.37
857	0.34
858	0.3
859	0.28
860	0.26
861	0.23
862	0.2
863	0.22
864	0.24
865	0.29
866	0.32
867	0.32
868	0.34
869	0.37
870	0.39
871	0.43
872	0.46

A0A397TJC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer